More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5571 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007950  Bpro_5571  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  100 
 
 
415 aa  843    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3315  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  54.85 
 
 
403 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2104  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  55.1 
 
 
404 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0421788  normal  0.0185484 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5037  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  53.32 
 
 
398 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7488  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  52.42 
 
 
406 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.800783  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0608  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  52.45 
 
 
398 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3953  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  53.83 
 
 
400 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.15496  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0178  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  53.27 
 
 
432 aa  422  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.207633 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3565  putative Formyl-CoA transferase  50.13 
 
 
401 aa  419  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4713  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  50 
 
 
408 aa  412  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3673  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  51 
 
 
473 aa  406  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.653273  normal  0.0775315 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4564  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  51.13 
 
 
403 aa  404  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419878  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3863  Formyl-CoA transferase  49.13 
 
 
426 aa  390  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.859373  normal  0.485093 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4071  putative formyl-CoA transferases/L-carnitine dehydratase  50.13 
 
 
391 aa  385  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0818051  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0058  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  48.46 
 
 
398 aa  384  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3560  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  48.35 
 
 
407 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1791  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  49.48 
 
 
388 aa  377  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.940519 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4617  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  49.34 
 
 
388 aa  377  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.629332  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4959  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  49.87 
 
 
381 aa  376  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.446104 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0237  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  46.7 
 
 
419 aa  369  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5362  putative CoA-transferase  48.32 
 
 
403 aa  369  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.360586  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1038  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  48.94 
 
 
394 aa  367  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2275  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  45.98 
 
 
401 aa  365  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.559073 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5186  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  48.41 
 
 
383 aa  367  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1126  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  48.02 
 
 
383 aa  365  1e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.251236  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4490  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  47.91 
 
 
404 aa  364  1e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.274729  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4403  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  47.91 
 
 
404 aa  364  1e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0269703  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4784  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  47.64 
 
 
404 aa  363  3e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.873877  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4518  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  48.3 
 
 
385 aa  359  4e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1135  Formyl-CoA transferase  46.15 
 
 
424 aa  359  4e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.923521  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3707  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  49.08 
 
 
395 aa  358  9.999999999999999e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6841  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  46.23 
 
 
417 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3262  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  49.23 
 
 
423 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.436186  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0077  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  43.81 
 
 
409 aa  350  4e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4224  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  48.4 
 
 
384 aa  348  8e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0326799  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1334  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  44.02 
 
 
421 aa  343  5e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000214497 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3797  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  45.43 
 
 
404 aa  342  7e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2995  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  45.71 
 
 
398 aa  341  1e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.233271  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2058  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  43.62 
 
 
413 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0195  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  43.32 
 
 
401 aa  318  1e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.111208  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3999  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  41.33 
 
 
397 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0222  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  44.72 
 
 
406 aa  315  9.999999999999999e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0445  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  43.93 
 
 
405 aa  305  1.0000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225942  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2501  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  41.36 
 
 
390 aa  298  1e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1195  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  41.42 
 
 
389 aa  293  3e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0818  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  41.27 
 
 
409 aa  292  6e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1851  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  38.69 
 
 
404 aa  255  1.0000000000000001e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.990249  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2980  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  36.63 
 
 
418 aa  249  6e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0057  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  36.19 
 
 
415 aa  248  1e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6129  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  37.63 
 
 
418 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6417  Formyl-CoA transferase  37.37 
 
 
418 aa  247  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.478883  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2408  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  36.63 
 
 
418 aa  247  3e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2399  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  40.85 
 
 
389 aa  247  3e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3421  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.16 
 
 
416 aa  244  3e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0047  Formyl-CoA transferase  35.25 
 
 
412 aa  241  2e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.386629  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0442  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.25 
 
 
387 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2825  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  36 
 
 
406 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0265401 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2914  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.78 
 
 
406 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.508097  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0039  Formyl-CoA transferase  34.5 
 
 
406 aa  237  2e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2971  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.31 
 
 
419 aa  238  2e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315436  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0905  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  38.9 
 
 
410 aa  237  3e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.36953  normal  0.0364065 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1310  Alpha-methylacyl-CoA racemase  35.48 
 
 
406 aa  236  8e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0880  Formyl-CoA transferase  34.93 
 
 
389 aa  235  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000116287  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1038  Alpha-methylacyl-CoA racemase  35.26 
 
 
413 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000337447  normal  0.997405 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2206  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  36.98 
 
 
415 aa  234  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0420  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.94 
 
 
407 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2908  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.61 
 
 
411 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.35571  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1981  Formyl-CoA transferase  35.78 
 
 
425 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.5463  hitchhiker  0.00178281 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0206  Formyl-CoA transferase  32.83 
 
 
393 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.640391 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0830  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.05 
 
 
406 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0441069  normal  0.0516739 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0683  Formyl-CoA transferase  36.17 
 
 
416 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.521571  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1835  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.59 
 
 
409 aa  233  5e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3546  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  36.3 
 
 
411 aa  232  8.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.906288  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3330  formyl-CoA transferase  33.58 
 
 
411 aa  232  1e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1329  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.48 
 
 
423 aa  231  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.94269  normal  0.646992 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3087  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  36.11 
 
 
411 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2142  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.36 
 
 
446 aa  231  2e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1614  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.36 
 
 
406 aa  230  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.553519 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0409  Formyl-CoA transferase  33.67 
 
 
396 aa  230  3e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2662  CAIB/BAIF family protein  34.66 
 
 
406 aa  229  5e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000146578  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24920  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.77 
 
 
407 aa  229  5e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.534139  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4160  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.91 
 
 
407 aa  229  5e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0846  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.26 
 
 
415 aa  229  7e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3300  acyl-CoA transferase/carnitine dehydratase  35.57 
 
 
389 aa  229  8e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.217224 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6435  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.89 
 
 
415 aa  228  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00145178 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0894  CAIB/BAIF family protein  34.06 
 
 
577 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.846716  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1422  CAIB/BAIF family protein  34.06 
 
 
568 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.498676  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6317  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.85 
 
 
392 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136735  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1814  CAIB/BAIF family protein  34.06 
 
 
544 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00543882  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5625  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.33 
 
 
415 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.344287  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2036  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.88 
 
 
390 aa  228  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.402932  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2211  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.03 
 
 
426 aa  228  2e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.859864 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1658  CAIB/BAIF family protein  34.41 
 
 
406 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0837995  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0704  CAIB/BAIF family protein  34.41 
 
 
406 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.504433  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0456  CAIB/BAIF family protein  34.41 
 
 
406 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.367298  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1635  CAIB/BAIF family protein  34.41 
 
 
406 aa  227  3e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0382163  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2771  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.37 
 
 
405 aa  227  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1285  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.74 
 
 
426 aa  226  6e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0281  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.28 
 
 
424 aa  226  8e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0849  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.07 
 
 
433 aa  225  9e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>