More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2479 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2479  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
277 aa  580  1.0000000000000001e-165  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4154  alpha/beta hydrolase  40.46 
 
 
249 aa  186  4e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.451839 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6084  hydrolase  38.37 
 
 
278 aa  171  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  33.71 
 
 
277 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  33.71 
 
 
292 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6120  alpha/beta hydrolase fold  35.5 
 
 
272 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894817  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6549  alpha/beta hydrolase fold protein  38.15 
 
 
281 aa  161  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.385661  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  32.95 
 
 
277 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  33.46 
 
 
277 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5584  alpha/beta hydrolase fold  37.55 
 
 
281 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.554679  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6254  alpha/beta hydrolase fold  36.23 
 
 
277 aa  149  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.140494  normal  0.235201 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  32.7 
 
 
282 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2216  alpha/beta fold family hydrolase  33.2 
 
 
294 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  30.83 
 
 
277 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 
282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3232  3-oxoadipate enol-lactonase  31.32 
 
 
277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0084  alpha/beta hydrolase fold protein  30.58 
 
 
246 aa  106  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  29.06 
 
 
280 aa  92  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  25.88 
 
 
259 aa  90.5  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  27.38 
 
 
269 aa  89.7  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  28.4 
 
 
275 aa  89.4  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  25.56 
 
 
270 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  24.07 
 
 
270 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  32.23 
 
 
255 aa  83.2  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  28.46 
 
 
265 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  27.46 
 
 
258 aa  82  0.000000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3642  alpha/beta fold family hydrolase  23.26 
 
 
262 aa  80.9  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  25.38 
 
 
268 aa  80.1  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  27.35 
 
 
275 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  23.7 
 
 
270 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  25.59 
 
 
281 aa  78.6  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1273  Alpha/beta hydrolase fold  28.76 
 
 
258 aa  77  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.879726  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  36.52 
 
 
372 aa  76.6  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  23.7 
 
 
270 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  24.34 
 
 
267 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  22.61 
 
 
282 aa  74.3  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  39 
 
 
456 aa  74.3  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1118  alpha/beta hydrolase fold  23.17 
 
 
275 aa  74.3  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3491  3-oxoadipate enol-lactonase  27.27 
 
 
262 aa  74.3  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.323872  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_002936  DET1308  alpha/beta fold family hydrolase  23.17 
 
 
275 aa  73.6  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.100773  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.94 
 
 
369 aa  73.2  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2092  alpha/beta hydrolase fold  26.37 
 
 
275 aa  73.6  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.168465  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0538  alpha/beta hydrolase fold  23.57 
 
 
299 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.282885  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  21.65 
 
 
262 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1996  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 
254 aa  72.8  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.507588  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  26.74 
 
 
266 aa  72.8  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5440  alpha/beta hydrolase fold  23.28 
 
 
299 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.341918 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5837  alpha/beta hydrolase fold  23.28 
 
 
316 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381935  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  26.14 
 
 
279 aa  71.6  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1234  alpha/beta hydrolase fold  26.12 
 
 
262 aa  71.6  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1090  hydrolase, alpha/beta fold family  23.17 
 
 
275 aa  70.9  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  25.88 
 
 
258 aa  70.9  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  32.35 
 
 
257 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  32.35 
 
 
257 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  32.35 
 
 
257 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  32.35 
 
 
257 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0545  alpha/beta hydrolase fold  22.9 
 
 
299 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0627  alpha/beta hydrolase fold  22.9 
 
 
299 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1679  alpha/beta hydrolase fold  22.9 
 
 
299 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1652  alpha/beta hydrolase fold  22.9 
 
 
299 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5609  alpha/beta hydrolase fold  22.9 
 
 
299 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333622  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1708  alpha/beta hydrolase fold  22.9 
 
 
299 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0456043  normal  0.790109 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3504  magnesium-chelatase 30 kDa subunit  24.27 
 
 
302 aa  70.1  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.477882 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  26.1 
 
 
256 aa  70.1  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3816  alpha/beta hydrolase fold  37.89 
 
 
257 aa  70.1  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  36.08 
 
 
314 aa  70.1  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0128  alpha/beta hydrolase fold  24.52 
 
 
262 aa  70.1  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2121  alpha/beta hydrolase fold  26.05 
 
 
256 aa  70.1  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00152914  normal  0.180644 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4676  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  23.74 
 
 
331 aa  69.7  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.318593  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2099  biotin biosynthesis protein, BioH  24.39 
 
 
255 aa  68.9  0.00000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4115  alpha/beta hydrolase fold  24.03 
 
 
280 aa  69.3  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5996  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)  24.66 
 
 
260 aa  68.9  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  24.69 
 
 
264 aa  68.9  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5552  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.31 
 
 
370 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.077135  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  30.39 
 
 
361 aa  68.2  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0315  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  35.35 
 
 
370 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4523  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  33.33 
 
 
271 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104364  normal  0.231171 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2437  alpha/beta hydrolase fold  24.1 
 
 
251 aa  68.2  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  23.41 
 
 
279 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7062  alpha/beta hydrolase fold  34.02 
 
 
296 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  29.91 
 
 
340 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  23.41 
 
 
266 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  31.37 
 
 
341 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0442  alpha/beta hydrolase fold protein  32 
 
 
334 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544577  normal  0.471208 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  26.62 
 
 
302 aa  67.4  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3321  alpha/beta hydrolase fold protein  25.79 
 
 
254 aa  67.4  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  35.11 
 
 
279 aa  67  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  25.74 
 
 
350 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  32.39 
 
 
309 aa  67  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5140  alpha/beta hydrolase fold  34.23 
 
 
305 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.773664  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2868  alpha/beta hydrolase fold protein  35.05 
 
 
265 aa  66.6  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0147271  normal  0.0470272 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.64 
 
 
370 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  34.46 
 
 
370 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  34.02 
 
 
333 aa  67  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0801  alpha/beta hydrolase fold protein  33.98 
 
 
305 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  32.41 
 
 
312 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  24.1 
 
 
263 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2809  alpha/beta hydrolase fold  23.37 
 
 
271 aa  66.2  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4748  alpha/beta hydrolase fold  22.8 
 
 
295 aa  66.2  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259792  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2404  alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 
301 aa  66.2  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367269 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>