More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2328 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2328  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 227 aa  448  1e-125  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18630  Response regulator, two-component  66.06 
 
 		 219 aa  298  6e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1940  two component transcriptional regulator, winged helix family  64.22 
 
 		 219 aa  281  5.000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359722  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3354  two component transcriptional regulator  62.84 
 
 		 220 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44436  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2713  DNA-binding response regulator  62.21 
 
 		 220 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.20215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3309  two component transcriptional regulator  60.73 
 
 		 220 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3039  two component transcriptional regulator  61.29 
 
 		 220 aa  268  4e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3019  two component transcriptional regulator  61.36 
 
 		 220 aa  268  5e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933394  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1894  DNA-binding response regulator  59.45 
 
 		 220 aa  241  6e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  55 
 
 		 220 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.55 
 
 		 220 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1783  two component transcriptional regulator  56.22 
 
 		 220 aa  239  4e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5497  DNA-binding response regulator  55.5 
 
 		 221 aa  237  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2815  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  56.02 
 
 		 218 aa  235  5.0000000000000005e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.877458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63150  two-component response regulator  55.5 
 
 		 221 aa  234  6e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.388672  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1255  hypothetical protein  54.59 
 
 		 225 aa  232  3e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1254  hypothetical protein  54.59 
 
 		 225 aa  232  3e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1312  transcriptional regulatory protein  50.68 
 
 		 232 aa  231  7.000000000000001e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0158381  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3511  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  59.91 
 
 		 220 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1372  transcriptional regulatory protein  50.68 
 
 		 223 aa  229  2e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000461157  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0469  two component transcriptional regulator  54.09 
 
 		 220 aa  228  5e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601273  normal  0.0513669 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0136  two component transcriptional regulator  53.7 
 
 		 220 aa  227  1e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.235991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3105  two component transcriptional regulator  51.14 
 
 		 219 aa  223  1e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.136173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3252  two component transcriptional regulator  52.05 
 
 		 220 aa  223  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0051  DNA-binding response regulator  55.45 
 
 		 220 aa  222  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0308  DNA-binding response regulator  55.45 
 
 		 220 aa  222  4e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0845  DNA-binding response regulator  55.45 
 
 		 220 aa  222  4e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0850  DNA-binding response regulator  55.45 
 
 		 220 aa  222  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2437  DNA-binding response regulator  55.45 
 
 		 220 aa  222  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3674  two component transcriptional regulator  50.68 
 
 		 219 aa  222  4.9999999999999996e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0680  two component transcriptional regulator  53.81 
 
 		 225 aa  221  9e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.982653 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5949  two component transcriptional regulator  54.3 
 
 		 224 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.274276 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0673  DNA-binding response regulator  55.96 
 
 		 241 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2647  two component transcriptional regulator  54.34 
 
 		 224 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2665  two component transcriptional regulator  54.34 
 
 		 220 aa  219  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2618  two component transcriptional regulator  54.34 
 
 		 220 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0575  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.77 
 
 		 224 aa  218  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.21251 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0603  DNA-binding response regulator  55.5 
 
 		 283 aa  218  7e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3820  two component transcriptional regulator  49.54 
 
 		 221 aa  217  1e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5798  winged helix family two component transcriptional regulator  49.56 
 
 		 242 aa  217  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0751826 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3901  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  50.23 
 
 		 225 aa  216  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2076  OmpR family two-component transcriptional regulator  50 
 
 		 224 aa  215  5e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000231542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0692  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 224 aa  214  9.999999999999999e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.478389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5326  two component transcriptional regulator  49.56 
 
 		 235 aa  212  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0503  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 227 aa  212  2.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2197  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.32 
 
 		 219 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2066  two component transcriptional regulator QseB  49.54 
 
 		 223 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.254921 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0644  two component transcriptional regulator  48.87 
 
 		 222 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.553024  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6226  two component transcriptional regulator  50.46 
 
 		 221 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344594  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2384  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.25 
 
 		 219 aa  211  5.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23421  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6233  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 220 aa  210  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1183  two component transcriptional regulator  50.46 
 
 		 228 aa  209  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2538  two component transcriptional regulator  53.85 
 
 		 210 aa  209  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.322532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0688  two component transcriptional regulator  49.54 
 
 		 220 aa  207  8e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3011  two component transcriptional regulator  50.46 
 
 		 221 aa  207  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2298  two component transcriptional regulator  47.06 
 
 		 221 aa  203  1e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0500017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0286  two component transcriptional regulator  47.06 
 
 		 227 aa  204  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3786  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.39 
 
 		 279 aa  203  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4760  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.07 
 
 		 227 aa  203  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00176778  hitchhiker  0.0056462 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1228  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  47.71 
 
 		 218 aa  202  3e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.169339 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4863  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.39 
 
 		 244 aa  202  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.494797 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3004  two component transcriptional regulator  47.95 
 
 		 221 aa  202  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.195535 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4039  winged helix family two component transcriptional regulator  47.95 
 
 		 221 aa  202  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4978  winged helix family two component transcriptional regulator  47.95 
 
 		 221 aa  202  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.140502  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3871  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 230 aa  202  4e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0076  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 223 aa  202  4e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.225452 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5866  two component transcriptional regulator  47.69 
 
 		 221 aa  202  5e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0998  two component transcriptional regulator  47.96 
 
 		 220 aa  201  9e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.333129  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6335  two component transcriptional regulator  48.4 
 
 		 223 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.923263 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1535  two component transcriptional regulator  47.71 
 
 		 222 aa  199  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1765  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 255 aa  199  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.003723  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0830  DNA-binding response regulator  50.46 
 
 		 220 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0346205  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0866  DNA-binding response regulator  50.46 
 
 		 220 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.775386  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2208  response regulator protein  50.46 
 
 		 220 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000167641  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1570  DNA-binding response regulator  50.46 
 
 		 220 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00189564  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5326  two component transcriptional regulator  49.55 
 
 		 221 aa  198  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.575046 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0050  DNA-binding response regulator  50.46 
 
 		 220 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000526726  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2754  two-component system response regulator  48.62 
 
 		 225 aa  198  5e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.864218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0958  DNA-binding response regulator  50.46 
 
 		 220 aa  198  5e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000129968  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3691  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 220 aa  198  5e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000843383  normal  0.576087 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0277  two component transcriptional regulator  47.41 
 
 		 235 aa  198  7e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.344057 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1827  two component transcriptional regulator  47.25 
 
 		 219 aa  197  7e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00738443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2150  two component transcriptional regulator  47.25 
 
 		 219 aa  197  7e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00200664  normal  0.32319 
 
 
-
 
NC_003296  RS02110  two-component response regulator transcription regulator protein  44.98 
 
 		 246 aa  197  9e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3607  DNA-binding transcriptional regulator BasR  47.2 
 
 		 220 aa  197  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000202279  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2104  DNA-binding response regulator YgiX, putative  46.79 
 
 		 219 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3741  DNA-binding transcriptional regulator BasR  47.2 
 
 		 220 aa  197  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03384  response regulator  46.12 
 
 		 221 aa  197  1.0000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000742618  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3980  DNA-binding transcriptional regulator BasR  47.2 
 
 		 220 aa  197  1.0000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000564215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0498  two component transcriptional regulator  49.11 
 
 		 223 aa  197  1.0000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1128  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  47.73 
 
 		 219 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.40399  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2399  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.69 
 
 		 219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00272  hitchhiker  0.00893631 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4334  DNA-binding transcriptional regulator QseB  44.29 
 
 		 219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1885  two component transcriptional regulator  46.79 
 
 		 219 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1337  two component transcriptional regulator  46.85 
 
 		 249 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257065  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1894  two component transcriptional regulator  47.69 
 
 		 219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000765732  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4873  two component transcriptional regulator  49.54 
 
 		 220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00274413  hitchhiker  0.0000000776703 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4177  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.83 
 
 		 223 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.622163  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4356  two component transcriptional regulator  49.54 
 
 		 220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00111042  unclonable  0.00000437588 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.75 
 
 		 220 aa  196  3e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.904967  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>