More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1618 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1618  major facilitator transporter  100 
 
 
412 aa  822    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2602  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 
422 aa  226  8e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.954157  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4237  major facilitator superfamily MFS_1  33.85 
 
 
422 aa  223  4.9999999999999996e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4559  major facilitator transporter  35.9 
 
 
421 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1426  major facilitator superfamily MFS_1  36.26 
 
 
415 aa  215  9.999999999999999e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.681295  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5855  major facilitator superfamily transporter  35.52 
 
 
420 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1445  major facilitator transporter  35.81 
 
 
419 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804439  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1463  major facilitator superfamily transporter  35.81 
 
 
419 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0911464  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1826  major facilitator superfamily MFS_1  36.26 
 
 
415 aa  212  7.999999999999999e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.793514  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0900  major facilitator transporter  35.38 
 
 
420 aa  212  9e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4972  major facilitator transporter  36.14 
 
 
425 aa  209  8e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.702579  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4198  major facilitator transporter  34.97 
 
 
418 aa  203  6e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4264  major facilitator superfamily transporter  34.97 
 
 
418 aa  203  6e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.396919  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4425  major facilitator transporter  34.97 
 
 
418 aa  203  6e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.226942  normal  0.426578 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0291  major facilitator superfamily MFS_1  31.68 
 
 
411 aa  198  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.505334  normal  0.0430819 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4715  major facilitator superfamily MFS_1  32.66 
 
 
413 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2309  major facilitator transporter  35 
 
 
426 aa  197  3e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.559549 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4586  major facilitator transporter  35 
 
 
426 aa  194  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101779  decreased coverage  0.00026814 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4929  major facilitator superfamily MFS_1  33.43 
 
 
395 aa  179  9e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.127537  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3208  major facilitator transporter  34.55 
 
 
415 aa  179  9e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.54065  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10866  integral membrane transport protein  34.55 
 
 
419 aa  179  1e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.25313  hitchhiker  0.00190628 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1048  major facilitator superfamily MFS_1  31.68 
 
 
477 aa  172  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.137816  normal  0.36117 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4401  major facilitator transporter  30.59 
 
 
414 aa  150  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0744  major facilitator transporter  30.99 
 
 
408 aa  150  5e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.871557 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1444  multidrug resistance protein MdtH  27.27 
 
 
402 aa  120  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.723421  hitchhiker  0.006681 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01061  predicted drug efflux system  27.27 
 
 
402 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2581  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 
402 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.487081  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1188  multidrug resistance protein MdtH  27.27 
 
 
402 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.812353  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2261  multidrug resistance protein MdtH  27.27 
 
 
402 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01069  hypothetical protein  27.27 
 
 
402 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2064  multidrug resistance protein MdtH  27.27 
 
 
402 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.182289 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1188  multidrug resistance protein MdtH  27.27 
 
 
402 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2535  multidrug resistance protein MdtH  27.27 
 
 
402 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.327464  normal  0.203452 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1664  major facilitator superfamily MFS_1  29.17 
 
 
406 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1579  multidrug resistance protein MdtH  26.08 
 
 
402 aa  118  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1263  multidrug resistance protein MdtH  27.19 
 
 
402 aa  116  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.21889 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1278  multidrug resistance protein MdtH  27.19 
 
 
402 aa  116  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.742422 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2022  multidrug resistance protein MdtH  27.19 
 
 
402 aa  116  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2206  multidrug resistance protein MdtH  27.19 
 
 
402 aa  116  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.151391 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1234  multidrug resistance protein MdtH  26.89 
 
 
402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.182579 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2443  multidrug resistance protein MdtH  26.81 
 
 
401 aa  113  7.000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.313716  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2050  multidrug resistance protein MdtH  26.81 
 
 
401 aa  113  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2162  multidrug resistance protein MdtH  26.81 
 
 
401 aa  113  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.976846  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2181  multidrug resistance protein MdtH  25.98 
 
 
401 aa  113  7.000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.815188  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1802  multidrug resistance protein MdtH  25.15 
 
 
401 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.888492  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2079  multidrug resistance protein MdtH  24.85 
 
 
401 aa  105  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0994516  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2132  major facilitator transporter  27.23 
 
 
393 aa  106  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2796  multidrug resistance protein MdtH  25.07 
 
 
401 aa  105  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.141154 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3060  membrane protein; TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  24.8 
 
 
393 aa  103  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000191911  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3166  hypothetical protein  24.75 
 
 
393 aa  102  9e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0358769  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3150  membrane protein; TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  24.54 
 
 
393 aa  102  9e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000153748  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3416  hypothetical protein  24.75 
 
 
393 aa  102  9e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0239  multidrug resistance protein MdtH  24.55 
 
 
411 aa  101  2e-20  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3387  hypothetical protein  24.79 
 
 
395 aa  100  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113682  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3386  hypothetical protein  24.54 
 
 
393 aa  99.8  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2276  multidrug resistance protein MdtH  24.92 
 
 
398 aa  99  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3391  major facilitator family protein  24.44 
 
 
399 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.271693  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3364  hypothetical protein  24.72 
 
 
397 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1861  hypothetical protein  24.71 
 
 
398 aa  92.8  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4228  hypothetical protein  29.87 
 
 
443 aa  89  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.642554  normal  0.06951 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5044  major facilitator transporter  23.68 
 
 
403 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183022  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1587  hypothetical protein  24.3 
 
 
413 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0149232 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3730  hypothetical protein  23.79 
 
 
412 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218361  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3641  hypothetical protein  24.04 
 
 
412 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3308  major facilitator transporter  24.14 
 
 
412 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.943572  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.87 
 
 
480 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  24.8 
 
 
423 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  24.36 
 
 
392 aa  67.4  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  24.8 
 
 
423 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4917  major facilitator transporter  22.58 
 
 
419 aa  65.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48630  putative MFS transporter  23.92 
 
 
409 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0171421  normal  0.0121812 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1474  putative permease  22.43 
 
 
432 aa  65.5  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  24.26 
 
 
423 aa  64.7  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  24.26 
 
 
423 aa  64.7  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3324  multidrug resistance protein B; transporter permease  23.31 
 
 
412 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  24.26 
 
 
423 aa  64.7  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  24.26 
 
 
423 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0267  hypothetical protein  21.15 
 
 
434 aa  64.3  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1378  multidrug resistance efflux transporter, putative  24.09 
 
 
433 aa  64.3  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.993613  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2146  major facilitator superfamily MFS_1  22.19 
 
 
438 aa  64.3  0.000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  24.26 
 
 
423 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  24.26 
 
 
423 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  24.26 
 
 
423 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0485  major facilitator superfamily MFS_1  24.44 
 
 
485 aa  62.4  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.165691  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2859  major facilitator transporter  23.22 
 
 
381 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2818  major facilitator transporter  33.07 
 
 
463 aa  62.4  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561944  decreased coverage  0.0000285964 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1277  major facilitator superfamily transporter  23.6 
 
 
433 aa  61.6  0.00000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.92 
 
 
458 aa  60.8  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3073  major facilitator superfamily MFS_1  22.99 
 
 
412 aa  60.8  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2899  peptide permease  28.74 
 
 
404 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.356613  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  30.81 
 
 
424 aa  60.5  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1664  major facilitator superfamily MFS_1  23.53 
 
 
428 aa  60.5  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0767786 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1065  major facilitator superfamily MFS_1  25.41 
 
 
404 aa  60.8  0.00000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.137002  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  23.86 
 
 
424 aa  60.1  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  28.26 
 
 
423 aa  60.1  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1567  multidrug resistance efflux transporter, putative  23.89 
 
 
433 aa  60.1  0.00000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0744  major facilitator transporter  23.61 
 
 
433 aa  58.9  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0364296  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2238  major facilitator superfamily MFS_1  21 
 
 
421 aa  59.7  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5301  major facilitator transporter  32.08 
 
 
468 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4713  major facilitator transporter  32.08 
 
 
397 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800868  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>