More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0535 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0535  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 296 aa  605  9.999999999999999e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.524385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0075  LysR family transcriptional regulator  42.6 
 
 		 296 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  39.72 
 
 		 292 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 323 aa  194  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2138  transcriptional regulator, LysR family  40.42 
 
 		 337 aa  191  2e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0824  LysR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 295 aa  187  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.607099 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2320  LysR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 305 aa  187  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00283549  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6318  LysR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 296 aa  186  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149291  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3457  als operon regulatory protein AlsR  39.38 
 
 		 301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.943458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3423  LysR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.141428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3374  LysR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.08343  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3685  putative als operon regulatory protein AlsR  39.38 
 
 		 301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3729  als operon regulatory protein AlsR  39.38 
 
 		 301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3702  als operon regulatory protein AlsR, putative  39.38 
 
 		 301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3354  LysR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.910894  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1538  transcriptional regulator, LysR family  39.38 
 
 		 299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0429395 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3709  putative als operon regulatory protein AlsR  39.38 
 
 		 301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.510407  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3776  transcriptional regulator, LysR family  39.38 
 
 		 299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1553  LysR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 305 aa  181  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1850  LysR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 328 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2461  LysR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 328 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0821  transcriptional regulator, LysR family  36.82 
 
 		 298 aa  180  2.9999999999999997e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0540741  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2466  LysR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 304 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.708031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1842  LysR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 307 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1527  LysR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 303 aa  178  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.25562 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2212  LysR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 296 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00538572  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2803  LysR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 316 aa  178  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.765199 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1662  transcriptional regulator, LysR family  41.76 
 
 		 296 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4970  transcriptional regulator, LysR family  35.89 
 
 		 298 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.126085  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3750  LysR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 297 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101985  normal  0.203083 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1735  transcriptional regulator, LysR family  41.76 
 
 		 296 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185137  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5792  LysR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 304 aa  176  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.316053 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0833  LysR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 304 aa  176  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5674  transcriptional regulator, LysR family  34.83 
 
 		 294 aa  176  5e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.949814  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2531  transcriptional regulator, LysR family  36.3 
 
 		 312 aa  176  5e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2243  transcriptional regulator, LysR family  36.27 
 
 		 296 aa  176  6e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1479  LysR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 289 aa  175  7e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.175288 
 
 
-
 
NC_003296  RS04822  transcription regulator protein  37.89 
 
 		 306 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05669  transcription regulator protein  37.89 
 
 		 306 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2220  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1922  LysR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2752  transcriptional regulator, LysR family  36.86 
 
 		 298 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000767643 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2536  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 297 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00700314  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0068  LysR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 298 aa  172  5.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3633  LysR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 328 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2510  LysR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 305 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2378  LysR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 305 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0445  LysR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 295 aa  172  9e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.294779  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03773  transcriptional regulator LysR family  40.45 
 
 		 295 aa  171  1e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1491  LysR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 308 aa  171  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00327558 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0417  LysR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 298 aa  171  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784631  normal  0.373184 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1543  transcriptional regulator, LysR family  35.05 
 
 		 298 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114968 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2097  transcriptional regulator, LysR family  34.84 
 
 		 302 aa  171  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7097  transcriptional regulator, LysR family  35.44 
 
 		 296 aa  170  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.785925  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0989  transcriptional regulator, LysR family  36.21 
 
 		 321 aa  170  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2053  LysR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 323 aa  171  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.79519  normal  0.0937075 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2876  LysR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 310 aa  171  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.692087 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1930  LysR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 306 aa  170  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0640  LysR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 318 aa  170  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404969  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3404  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 293 aa  169  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.729223  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1384  LysR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 303 aa  169  7e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.510026  normal  0.961764 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1366  LysR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 303 aa  169  7e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4628  transcriptional regulator, LysR family  38.57 
 
 		 292 aa  168  8e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0890971  normal  0.246233 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5892  LysR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 297 aa  168  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2442  LysR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 299 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.383889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4202  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 295 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.932359  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2778  transcriptional regulator, LysR family  35.17 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23055  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1181  isoleucine biosynthesis transcriptional activator  35.52 
 
 		 331 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3007  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 308 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3010  LysR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 309 aa  166  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.450342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6120  transcriptional regulator, LysR family  38.64 
 
 		 302 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.274534 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0833  transcriptional regulator, LysR family  34.03 
 
 		 294 aa  166  4e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45170  Transcriptional regulator, LysR family  36.03 
 
 		 308 aa  166  5.9999999999999996e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1969  transcriptional regulator, LysR family  35.29 
 
 		 308 aa  166  5.9999999999999996e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2332  transcriptional regulator, LysR family  35.29 
 
 		 308 aa  166  5.9999999999999996e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.194223  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0038  transcriptional regulator, LysR family  33.82 
 
 		 300 aa  165  6.9999999999999995e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.744574 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0037  transcriptional regulator, LysR family  33.82 
 
 		 300 aa  165  6.9999999999999995e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.279269  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3424  LysR family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 296 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5470  LysR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 300 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000367157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4167  LysR substrate-binding protein  36.08 
 
 		 295 aa  165  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.767565  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5766  putative transcriptional regulator  38.46 
 
 		 301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2411  transcription regulator protein  35.91 
 
 		 311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1405  LysR family transcriptional regulator  37.64 
 
 		 302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.893483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66490  LysR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1021  isoleucine biosynthesis transcriptional activator IlvR  34.8 
 
 		 337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.127351  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1756  LysR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 300 aa  163  3e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.497412  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3799  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  35.25 
 
 		 300 aa  163  3e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621197 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2265  LysR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 300 aa  163  3e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.503277  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2782  LysR family regulatory protein  36.49 
 
 		 300 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.105762  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2043  transcriptional regulator, LysR family  36.64 
 
 		 298 aa  163  3e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637177  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2179  LysR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 300 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1538  LysR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 300 aa  163  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.337495  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6486  LysR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 301 aa  163  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.898531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3053  LysR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 300 aa  163  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1646  isoleucine biosynthesis transcriptional activator IlvR  35.05 
 
 		 315 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.636647  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1400  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 303 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2649  transcriptional regulator  36.49 
 
 		 300 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1434  transcriptional regulator, LysR family  36.18 
 
 		 308 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3117  transcriptional regulator, LysR family  34.92 
 
 		 306 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2333  isoleucine biosynthesis transcriptional activator IlvR  35.05 
 
 		 315 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0128681  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>