237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0500 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0500  hypothetical protein  100 
 
 
494 aa  969    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0830  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.97 
 
 
493 aa  414  1e-114  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3409  TRAP-T family transporter large inner membrane subunit  47.15 
 
 
498 aa  383  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.619026  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3054  hypothetical protein  47.15 
 
 
498 aa  383  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0529038  normal  0.0190341 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2448  hypothetical protein  40.5 
 
 
498 aa  381  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3162  hypothetical protein  41.63 
 
 
490 aa  375  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1211  hypothetical protein  40.45 
 
 
506 aa  367  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0374344  normal  0.144663 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0300  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.57 
 
 
491 aa  353  4e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4195  hypothetical protein  44.44 
 
 
503 aa  351  2e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03719  conserved hypothetical protein  41.42 
 
 
496 aa  349  5e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03668  hypothetical protein  41.42 
 
 
496 aa  349  5e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4209  integral membrane protein  41.42 
 
 
496 aa  349  5e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000736829 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2075  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.73 
 
 
497 aa  348  1e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4415  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.52 
 
 
503 aa  346  5e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0289  hypothetical protein  39.75 
 
 
499 aa  346  5e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4286  hypothetical protein  40.92 
 
 
497 aa  345  8.999999999999999e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1159  hypothetical protein  40.58 
 
 
500 aa  342  8e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0589561  normal  0.408221 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3911  hypothetical protein  38.21 
 
 
499 aa  331  2e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.144759  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1975  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.17 
 
 
503 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0301079  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1563  hypothetical protein  38.66 
 
 
529 aa  328  2.0000000000000001e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.526146  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4452  hypothetical protein  39.82 
 
 
507 aa  327  4.0000000000000003e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0697965 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0622  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.17 
 
 
502 aa  326  5e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4220  hypothetical protein  37.65 
 
 
494 aa  326  5e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3933  hypothetical protein  35.87 
 
 
505 aa  326  7e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1753  hypothetical protein  38.48 
 
 
504 aa  325  1e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0278889  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3033  hypothetical protein  38.7 
 
 
658 aa  324  2e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2790  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.88 
 
 
508 aa  323  5e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2397  hypothetical protein  38.48 
 
 
499 aa  323  6e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1067  hypothetical protein  37.5 
 
 
508 aa  322  8e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3049  hypothetical protein  38.49 
 
 
490 aa  322  9.999999999999999e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.654023  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2001  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.07 
 
 
514 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3100  hypothetical protein  39.48 
 
 
509 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.405009  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1960  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.07 
 
 
509 aa  321  1.9999999999999998e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0173399  normal  0.831984 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0338  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.99 
 
 
506 aa  319  6e-86  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0598  hypothetical protein  36.14 
 
 
502 aa  317  2e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0355  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.33 
 
 
519 aa  315  8e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3387  TRAP-T family transporter fused small and large inner membrane subunits  39.33 
 
 
658 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.933362  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1999  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.05 
 
 
514 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2158  protein of unknown function DUF112 transmembrane  41.57 
 
 
516 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2227  hypothetical protein  37.45 
 
 
504 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36170  hypothetical protein  38.32 
 
 
506 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000760883 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4435  hypothetical protein  39.74 
 
 
495 aa  313  3.9999999999999997e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4226  hypothetical protein  38.66 
 
 
512 aa  313  5.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0723732  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1351  hypothetical protein  36.18 
 
 
504 aa  312  1e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0786425  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4539  hypothetical protein  38.82 
 
 
497 aa  311  1e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3083  hypothetical protein  39.24 
 
 
506 aa  311  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.659328  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0071  hypothetical protein  38.14 
 
 
505 aa  310  5e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2223  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.97 
 
 
502 aa  309  5.9999999999999995e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4219  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.76 
 
 
508 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380149  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2895  hypothetical protein  34.99 
 
 
508 aa  308  1.0000000000000001e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0852317  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1801  hypothetical protein  35.48 
 
 
506 aa  308  1.0000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.292075  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4234  membrane protein TctA, putative  35.1 
 
 
504 aa  307  3e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5724  hypothetical protein  35.74 
 
 
506 aa  307  3e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.438284  normal  0.286089 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3968  hypothetical protein  35.31 
 
 
504 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.675721  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4305  hypothetical protein  35.16 
 
 
504 aa  306  7e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3049  hypothetical protein  37.23 
 
 
504 aa  306  8.000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.235521  normal  0.409974 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6101  hypothetical protein  34.26 
 
 
503 aa  305  9.000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1416  tricarboxylate transport protein TctA, putative  35.16 
 
 
504 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2514  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  39.38 
 
 
531 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.22099 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3357  hypothetical protein  34.39 
 
 
504 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0972974  hitchhiker  0.00431658 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5627  tricarboxylate transport protein (TctA)  38.23 
 
 
508 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0245667  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2439  hypothetical protein  37.73 
 
 
494 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.188037  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4395  hypothetical protein  35.37 
 
 
504 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1908  hypothetical protein  36.52 
 
 
529 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.839704  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3009  hypothetical protein  36.81 
 
 
499 aa  304  3.0000000000000004e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.587046  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0724  hypothetical protein  36.47 
 
 
500 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.241934  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2503  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.48 
 
 
536 aa  304  3.0000000000000004e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2024  hypothetical protein  38.29 
 
 
510 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.482328  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0732  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.76 
 
 
503 aa  303  5.000000000000001e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0015815 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3430  hypothetical protein  39.05 
 
 
510 aa  302  7.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.467097  normal  0.0598189 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1455  hypothetical protein  35.4 
 
 
504 aa  302  9e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.265608  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3964  hypothetical protein  36.75 
 
 
500 aa  302  1e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454339  normal  0.0362473 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7083  hypothetical protein  34.7 
 
 
502 aa  302  1e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4009  protein of unknown function DUF112 transmembrane  32.39 
 
 
504 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1056  hypothetical protein  34.96 
 
 
504 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2388  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.56 
 
 
504 aa  301  2e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2034  hypothetical protein  36.02 
 
 
505 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32397  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4417  hypothetical protein  36.14 
 
 
503 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2797  hypothetical protein  38.8 
 
 
509 aa  300  3e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.47019  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1016  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  36.78 
 
 
515 aa  300  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238153  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1721  hypothetical protein  35.43 
 
 
500 aa  300  4e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2059  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.22 
 
 
497 aa  300  4e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1639  tricarboxylic transport  36.79 
 
 
498 aa  300  5e-80  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0156  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.73 
 
 
500 aa  298  1e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5653  hypothetical protein  37.64 
 
 
513 aa  299  1e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0296187 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1827  hypothetical protein  35.23 
 
 
500 aa  298  2e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3644  hypothetical protein  36.3 
 
 
500 aa  296  4e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0805741  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3268  hypothetical protein  33.83 
 
 
505 aa  296  5e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625282  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4491  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.72 
 
 
509 aa  296  6e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2377  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.26 
 
 
520 aa  296  7e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1851  hypothetical protein  38.61 
 
 
499 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3198  hypothetical protein  36.83 
 
 
500 aa  294  2e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.088206  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2190  integral membrane protein  34.66 
 
 
508 aa  294  2e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3089  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.4 
 
 
536 aa  293  3e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1768  hypothetical protein  37.9 
 
 
503 aa  292  1e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.567272  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0793  hypothetical protein  35 
 
 
500 aa  291  2e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2145  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  34.82 
 
 
519 aa  291  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2918  hypothetical protein  35.11 
 
 
512 aa  291  2e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.191157  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3966  hypothetical protein  36.91 
 
 
497 aa  291  2e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2967  tricarboxylic transport  34.35 
 
 
504 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0170848 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>