168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0735 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0735  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  100 
 
 		 154 aa  300  5.000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.466982  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1727  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  81.17 
 
 		 154 aa  255  2e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0175  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  80.52 
 
 		 154 aa  253  6e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.155132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0221  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  74.68 
 
 		 154 aa  239  1e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0450541  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2024  CheD  45.64 
 
 		 162 aa  127  7.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2687  hypothetical protein  41.61 
 
 		 161 aa  121  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2022  CheD, stimulates methylation of MCP protein  43.06 
 
 		 166 aa  120  8e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1741  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  43.24 
 
 		 171 aa  119  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0111  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  45.24 
 
 		 166 aa  117  7e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0024  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  43.66 
 
 		 157 aa  117  7e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.375225  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0024  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  43.66 
 
 		 157 aa  117  7e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000154554  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2385  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  41.4 
 
 		 166 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1137  CheD  40.4 
 
 		 166 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0176263  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3146  CheD  45.38 
 
 		 173 aa  115  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2146  CheD  41.67 
 
 		 160 aa  115  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00139115  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0493  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  41.61 
 
 		 161 aa  115  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1665  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  42.95 
 
 		 162 aa  114  6e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00633684  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1308  CheD  38.67 
 
 		 163 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.950792  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1334  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  43.7 
 
 		 137 aa  114  6.9999999999999995e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.104931  normal  0.313636 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0955  CheD, stimulates methylation of MCP protein  43.85 
 
 		 173 aa  113  7.999999999999999e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07640  chemotaxis protein CheD  39.04 
 
 		 158 aa  111  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000135078  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4129  CheD  39.86 
 
 		 160 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000670022  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0982  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  41.55 
 
 		 151 aa  111  5e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2029  CheD, stimulates methylation of MCP protein  37.74 
 
 		 165 aa  110  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1432  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  41.55 
 
 		 160 aa  111  5e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0382  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  38.73 
 
 		 159 aa  110  6e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0800  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  37.97 
 
 		 167 aa  110  7.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0621769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1854  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  40.91 
 
 		 164 aa  107  5e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1417  CheD  44.19 
 
 		 145 aa  103  7e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0653716  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0941  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  38.76 
 
 		 163 aa  103  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.326065  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1372  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  33.54 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.239439  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2485  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  34.18 
 
 		 159 aa  101  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.380035  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2581  CheD  36.3 
 
 		 159 aa  101  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1201  CheD-like chemotaxis protein  40.4 
 
 		 162 aa  97.8  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.331529  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3300  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.23 
 
 		 170 aa  95.5  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0662  CheD, stimulates methylation of MCP protein  37.01 
 
 		 163 aa  95.9  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.436046  normal  0.296152 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1421  CheD  37.58 
 
 		 160 aa  95.1  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.216006  normal  0.348077 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0712  CheD  35.14 
 
 		 157 aa  94  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0638  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  31.47 
 
 		 171 aa  92.8  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3209  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  36.72 
 
 		 162 aa  93.6  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000200637 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0877  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  36.91 
 
 		 161 aa  93.6  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.312761  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3472  hypothetical protein  35.71 
 
 		 156 aa  92.4  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.771884 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0604  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  31.03 
 
 		 171 aa  92  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0629  CheD  30.34 
 
 		 171 aa  90.5  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1310  CheD  34.85 
 
 		 161 aa  89  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0701  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  31.21 
 
 		 167 aa  88.6  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0356622  normal  0.347186 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0909  chemotaxis protein CheD, putative  32.87 
 
 		 168 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0782  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32.87 
 
 		 177 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.896881 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1986  CheD family protein  33.8 
 
 		 156 aa  87.8  5e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0103025  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0061  CheD, stimulates methylation of MCP protein  34.93 
 
 		 173 aa  87.4  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0398  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  32.68 
 
 		 183 aa  86.7  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.152516 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0363  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  35.2 
 
 		 220 aa  85.9  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.3362  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1382  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  34.42 
 
 		 201 aa  84.7  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0088  CheD  32.89 
 
 		 197 aa  84  7e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1007  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  31.3 
 
 		 157 aa  84  8e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000449804  normal  0.590403 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0431  hypothetical protein  33.86 
 
 		 173 aa  84  8e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.13773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0977  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  34.27 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3294  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  31.21 
 
 		 175 aa  83.2  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.370177 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0439  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  33.78 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00596403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1782  CheD  31.37 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.544534 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2899  CheD, stimulates methylation of MCP protein  34.46 
 
 		 198 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5563900000000001e-18 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0955  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.06 
 
 		 171 aa  82.4  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.301241  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1596  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  29.8 
 
 		 165 aa  82  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4342  hypothetical protein  32.24 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2983  CheD, stimulates methylation of MCP protein  31.37 
 
 		 175 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1527  hypothetical protein  31.76 
 
 		 160 aa  81.6  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.101375 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1321  CheD, stimulates methylation of MCP protein  30 
 
 		 194 aa  81.3  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.776014  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3201  chemotaxis protein CheD, putative  30.67 
 
 		 162 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.945605  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2617  CheD, stimulates methylation of MCP protein  29.73 
 
 		 165 aa  79  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0235  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  31.25 
 
 		 172 aa  78.2  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.367659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0669  CheD, stimulates methylation of MCP protein  34.03 
 
 		 163 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0620166  normal  0.293268 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0610  hypothetical protein  30.52 
 
 		 209 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000882813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2419  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  28.67 
 
 		 160 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.333698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0877  hypothetical protein  30.5 
 
 		 186 aa  77  0.00000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3103  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  32.47 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22580  chemotaxis protein CheD  39.17 
 
 		 168 aa  76.6  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2326  chemotaxis protein CheD, putative  33.11 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3061  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  31.72 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.583013  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0153  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32.47 
 
 		 233 aa  75.5  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0648  hypothetical protein  30.16 
 
 		 170 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0642567  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2563  CheD  34.01 
 
 		 175 aa  75.5  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.236478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1613  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  30.87 
 
 		 191 aa  75.1  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166674  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3150  hypothetical protein  31.79 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3787  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  31.72 
 
 		 245 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.54993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2161  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  31.79 
 
 		 216 aa  74.7  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.847826  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1441  CheD  34.56 
 
 		 191 aa  74.7  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0726  chemotaxis protein CheD, putative  31.17 
 
 		 220 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.345445  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0169  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.33 
 
 		 273 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.413087 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4165  CheD  34.9 
 
 		 236 aa  73.6  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4053  CheD  34.9 
 
 		 236 aa  73.6  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3212  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  29.14 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2362  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  32.03 
 
 		 198 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.45026  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2173  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  29.66 
 
 		 242 aa  72.8  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0902871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2889  catalytic domain of components of various dehydrogenase complexes  29.84 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0123  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32.31 
 
 		 250 aa  72  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3810  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32.31 
 
 		 271 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3303  hypothetical protein  34.09 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3178  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32.31 
 
 		 234 aa  72  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0242  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32.84 
 
 		 247 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2847  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32.84 
 
 		 247 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169491  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>