61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0398 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1481  radical SAM domain-containing protein  91.14 
 
 		 371 aa  661    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0924558  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0439  radical SAM domain-containing protein  90 
 
 		 371 aa  658    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0398  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 371 aa  737    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0698777  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0508  radical SAM domain-containing protein  72.22 
 
 		 373 aa  519  1e-146  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0983  radical SAM domain-containing protein  61.85 
 
 		 380 aa  434  1e-121  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.156314  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0772  Radical SAM domain protein  38.29 
 
 		 353 aa  254  2.0000000000000002e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00827536  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0273  hypothetical protein  39.14 
 
 		 353 aa  228  9e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.888723  normal  0.245364 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0043  radical SAM family Fe-S protein  38.97 
 
 		 348 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1063  Radical SAM domain protein  37.4 
 
 		 350 aa  217  2e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.540032  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0784  radical SAM family protein  35.98 
 
 		 337 aa  212  7.999999999999999e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00132902  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2062  radical SAM domain-containing protein  38.63 
 
 		 341 aa  211  2e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.539759 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2157  radical SAM domain-containing protein  39.25 
 
 		 343 aa  211  2e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.350893  hitchhiker  0.000485535 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1789  radical SAM domain-containing protein  35.53 
 
 		 341 aa  210  3e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0016  radical SAM domain-containing protein  34.96 
 
 		 344 aa  203  5e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.238462  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0106  Radical SAM domain protein  38.3 
 
 		 343 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0936  Radical SAM domain protein  33.52 
 
 		 343 aa  194  2e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.674566 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0117  hypothetical protein  35.41 
 
 		 334 aa  194  3e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0312  Radical SAM domain protein  34.08 
 
 		 332 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.139539 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3338  Radical SAM domain protein  34.17 
 
 		 331 aa  183  4.0000000000000006e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1246  Radical SAM domain protein  32.68 
 
 		 346 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1383  Radical SAM domain protein  33.05 
 
 		 331 aa  176  5e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632636  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1901  radical SAM domain-containing protein  34.67 
 
 		 298 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.844314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0964  radical SAM domain-containing protein  33.69 
 
 		 300 aa  166  8e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0464  radical SAM domain-containing protein  33.02 
 
 		 353 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0768  radical SAM domain-containing protein  32.85 
 
 		 300 aa  162  6e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00853946 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1414  radical SAM domain-containing protein  33.09 
 
 		 290 aa  161  2e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1369  hypothetical protein  25.67 
 
 		 471 aa  124  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1025  Radical SAM domain protein  30.66 
 
 		 409 aa  105  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2925  Radical SAM domain protein  31.92 
 
 		 440 aa  90.1  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000258536  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2369  Radical SAM domain protein  27.57 
 
 		 435 aa  85.9  9e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0697954  normal  0.318858 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05050  pyruvate formate-lyase activating-like enzyme  24.49 
 
 		 457 aa  85.9  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3410  Radical SAM domain protein  25.12 
 
 		 433 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.736979  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2101  radical SAM family protein  28.16 
 
 		 417 aa  83.6  0.000000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1387  radical SAM family protein  29.28 
 
 		 441 aa  81.3  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00200  pyruvate formate-lyase activating-like enzyme  22.33 
 
 		 464 aa  67  0.0000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.158297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1327  Radical SAM domain protein  23.83 
 
 		 375 aa  66.6  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000215386  hitchhiker  0.00000524996 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2492  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  28.42 
 
 		 400 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.250234  normal  0.0827229 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5901  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  27.57 
 
 		 374 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.630073 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0292  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  27.86 
 
 		 386 aa  47.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.876947 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6168  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  27.57 
 
 		 374 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0169631  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2098  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.8 
 
 		 400 aa  47.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.456256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4038  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  28.47 
 
 		 370 aa  47.4  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0888  FO synthase  25 
 
 		 836 aa  46.6  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1782  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.76 
 
 		 389 aa  46.2  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.449437  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0107  biotin synthase  25.67 
 
 		 344 aa  45.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.156568  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1928  biotin synthase  24.88 
 
 		 376 aa  45.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000208086  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5162  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  32.23 
 
 		 379 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.426022 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5965  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  27.03 
 
 		 387 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0233125 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5119  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  32.23 
 
 		 379 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.830153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3249  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  32.23 
 
 		 379 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.384282  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1019  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  32.46 
 
 		 328 aa  45.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.33881  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4674  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  30.46 
 
 		 389 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0597  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.91 
 
 		 348 aa  44.3  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2881  hypothetical protein  27.46 
 
 		 348 aa  44.3  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0587  radical SAM family protein  28.04 
 
 		 376 aa  43.9  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1449  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25 
 
 		 373 aa  44.3  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0775464  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0729  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25 
 
 		 380 aa  43.5  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701014  normal  0.10573 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0946  FO synthase  24.19 
 
 		 860 aa  43.5  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0509  coenzyme PQQ synthesis protein E  29.8 
 
 		 389 aa  43.1  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2588  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  31.71 
 
 		 414 aa  42.7  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0973479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2249  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  29.3 
 
 		 371 aa  42.7  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0357225  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>