40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1063 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1063  Radical SAM domain protein  100 
 
 
350 aa  708    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.540032  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2157  radical SAM domain-containing protein  59.71 
 
 
343 aa  419  1e-116  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.350893  hitchhiker  0.000485535 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0772  Radical SAM domain protein  37.89 
 
 
353 aa  219  5e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00827536  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0398  radical SAM domain-containing protein  37.71 
 
 
371 aa  216  5e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0698777  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1481  radical SAM domain-containing protein  38.04 
 
 
371 aa  215  9e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0924558  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0508  radical SAM domain-containing protein  41.73 
 
 
373 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0439  radical SAM domain-containing protein  38.19 
 
 
371 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0273  hypothetical protein  40.35 
 
 
353 aa  204  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.888723  normal  0.245364 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0983  radical SAM domain-containing protein  41.94 
 
 
380 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.156314  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0464  radical SAM domain-containing protein  38.6 
 
 
353 aa  195  9e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0043  radical SAM family Fe-S protein  40.65 
 
 
348 aa  194  2e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1789  radical SAM domain-containing protein  34.41 
 
 
341 aa  193  4e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0784  radical SAM family protein  37.23 
 
 
337 aa  187  3e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00132902  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1246  Radical SAM domain protein  38.55 
 
 
346 aa  184  3e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0016  radical SAM domain-containing protein  35.84 
 
 
344 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.238462  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0312  Radical SAM domain protein  36.36 
 
 
332 aa  178  1e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.139539 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0936  Radical SAM domain protein  33.73 
 
 
343 aa  178  1e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.674566 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2062  radical SAM domain-containing protein  34.71 
 
 
341 aa  178  1e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.539759 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0117  hypothetical protein  34.48 
 
 
334 aa  175  9e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1383  Radical SAM domain protein  36.97 
 
 
331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632636  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0106  Radical SAM domain protein  34.52 
 
 
343 aa  171  1e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3338  Radical SAM domain protein  36.99 
 
 
331 aa  171  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0964  radical SAM domain-containing protein  36.43 
 
 
300 aa  169  9e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1901  radical SAM domain-containing protein  37.5 
 
 
298 aa  166  8e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.844314  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0768  radical SAM domain-containing protein  34.78 
 
 
300 aa  160  3e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00853946 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1414  radical SAM domain-containing protein  35.66 
 
 
290 aa  159  6e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1369  hypothetical protein  31.03 
 
 
471 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1025  Radical SAM domain protein  29.89 
 
 
409 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3410  Radical SAM domain protein  27.17 
 
 
433 aa  104  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.736979  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05050  pyruvate formate-lyase activating-like enzyme  25.17 
 
 
457 aa  86.3  7e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2369  Radical SAM domain protein  25.19 
 
 
435 aa  77  0.0000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0697954  normal  0.318858 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00200  pyruvate formate-lyase activating-like enzyme  23.4 
 
 
464 aa  76.6  0.0000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.158297  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1327  Radical SAM domain protein  23.49 
 
 
375 aa  75.9  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000215386  hitchhiker  0.00000524996 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2101  radical SAM family protein  27.48 
 
 
417 aa  75.1  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1387  radical SAM family protein  23.05 
 
 
441 aa  70.1  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2925  Radical SAM domain protein  21.85 
 
 
440 aa  69.7  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000258536  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0587  radical SAM family protein  27.1 
 
 
376 aa  46.6  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2249  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  29.09 
 
 
371 aa  45.8  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0357225  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  26.27 
 
 
462 aa  44.3  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0354  radical SAM domain-containing protein  29.85 
 
 
377 aa  43.5  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.880417 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>