92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3410 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_3410  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 433 aa  894    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.736979  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1369  hypothetical protein  50.31 
 
 		 471 aa  326  6e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1025  Radical SAM domain protein  45.91 
 
 		 409 aa  320  3e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2157  radical SAM domain-containing protein  30.04 
 
 		 343 aa  110  5e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.350893  hitchhiker  0.000485535 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00200  pyruvate formate-lyase activating-like enzyme  29 
 
 		 464 aa  106  7e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.158297  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1063  Radical SAM domain protein  27.17 
 
 		 350 aa  104  3e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.540032  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0464  radical SAM domain-containing protein  25.64 
 
 		 353 aa  97.8  4e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2101  radical SAM family protein  26.36 
 
 		 417 aa  96.7  8e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0983  radical SAM domain-containing protein  23.9 
 
 		 380 aa  93.6  6e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.156314  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0772  Radical SAM domain protein  27.49 
 
 		 353 aa  93.2  9e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00827536  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1387  radical SAM family protein  27.93 
 
 		 441 aa  92.4  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2925  Radical SAM domain protein  29.41 
 
 		 440 aa  90.5  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000258536  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0273  hypothetical protein  29.84 
 
 		 353 aa  88.2  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.888723  normal  0.245364 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0439  radical SAM domain-containing protein  24.65 
 
 		 371 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0016  radical SAM domain-containing protein  25.15 
 
 		 344 aa  85.9  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.238462  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0398  radical SAM domain-containing protein  25.12 
 
 		 371 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0698777  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0508  radical SAM domain-containing protein  23.39 
 
 		 373 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1481  radical SAM domain-containing protein  24.88 
 
 		 371 aa  84  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0924558  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05050  pyruvate formate-lyase activating-like enzyme  25.23 
 
 		 457 aa  82.4  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0936  Radical SAM domain protein  24.74 
 
 		 343 aa  82.4  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.674566 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0043  radical SAM family Fe-S protein  30.46 
 
 		 348 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0312  Radical SAM domain protein  25.78 
 
 		 332 aa  80.5  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.139539 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1901  radical SAM domain-containing protein  26.32 
 
 		 298 aa  79  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.844314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1246  Radical SAM domain protein  24.81 
 
 		 346 aa  77  0.0000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1327  Radical SAM domain protein  28.04 
 
 		 375 aa  74.7  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000215386  hitchhiker  0.00000524996 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0964  radical SAM domain-containing protein  24.18 
 
 		 300 aa  74.3  0.000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2369  Radical SAM domain protein  28.78 
 
 		 435 aa  73.9  0.000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0697954  normal  0.318858 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0768  radical SAM domain-containing protein  23.92 
 
 		 300 aa  73.2  0.000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00853946 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1383  Radical SAM domain protein  25.25 
 
 		 331 aa  71.6  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632636  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3338  Radical SAM domain protein  24.65 
 
 		 331 aa  71.2  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0784  radical SAM family protein  24.17 
 
 		 337 aa  70.9  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00132902  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1789  radical SAM domain-containing protein  25.82 
 
 		 341 aa  68.2  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0106  Radical SAM domain protein  26.74 
 
 		 343 aa  68.2  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1414  radical SAM domain-containing protein  25.37 
 
 		 290 aa  65.5  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0117  hypothetical protein  25.63 
 
 		 334 aa  61.6  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2062  radical SAM domain-containing protein  26.48 
 
 		 341 aa  61.6  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.539759 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1148  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.64 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4316  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  38.1 
 
 		 338 aa  54.7  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.904735  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3318  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.33 
 
 		 333 aa  53.5  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1159  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.81 
 
 		 330 aa  51.2  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.263056  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0734  Radical SAM domain protein  27.7 
 
 		 401 aa  51.2  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2921  radical SAM domain-containing protein  28.98 
 
 		 324 aa  50.4  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.925202  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0726  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.2 
 
 		 324 aa  50.1  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00130382 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4668  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.83 
 
 		 326 aa  50.1  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2766  radical SAM family Fe-S protein  28.57 
 
 		 340 aa  49.3  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2268  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.32 
 
 		 325 aa  49.7  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1476  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.87 
 
 		 299 aa  48.5  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1265  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.32 
 
 		 336 aa  47.8  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.522887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1468  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.65 
 
 		 388 aa  47.8  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.724446  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1590  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.32 
 
 		 316 aa  47.8  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2646  radical SAM family protein  34.86 
 
 		 723 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1555  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.08 
 
 		 348 aa  47  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0700995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1061  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.59 
 
 		 369 aa  47  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000361743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1935  radical SAM domain-containing protein  27.68 
 
 		 404 aa  46.6  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.100874 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2276  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.23 
 
 		 396 aa  46.6  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2923  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.81 
 
 		 369 aa  45.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0273757  normal  0.545573 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  20.74 
 
 		 427 aa  46.2  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  26.35 
 
 		 349 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0159  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.15 
 
 		 322 aa  46.2  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000610838  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1480  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.25 
 
 		 332 aa  46.2  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.498315  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2335  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.15 
 
 		 340 aa  45.8  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.228355  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2293  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.15 
 
 		 340 aa  45.8  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1689  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.51 
 
 		 376 aa  45.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0925  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  27.87 
 
 		 339 aa  45.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1734  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.55 
 
 		 329 aa  45.1  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0817  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.86 
 
 		 370 aa  45.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00537332  normal  0.704127 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2198  radical SAM domain-containing protein  25.43 
 
 		 373 aa  45.1  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0314345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0182  radical SAM domain-containing protein  27.47 
 
 		 334 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.505974  normal  0.796487 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0297  pyruvate formate-lyase activating enzyme  31.36 
 
 		 247 aa  44.3  0.004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1947  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.45 
 
 		 329 aa  44.7  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.386779 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1039  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.6 
 
 		 373 aa  44.7  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.491937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1151  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  27.59 
 
 		 373 aa  44.7  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00861011 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15625  predicted protein  32.77 
 
 		 335 aa  44.3  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2110  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.46 
 
 		 356 aa  44.7  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2292  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.03 
 
 		 381 aa  44.3  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0322  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.77 
 
 		 298 aa  43.9  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2804  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.09 
 
 		 341 aa  44.3  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.933845  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2768  molybdopterin biosynthesis, protein A  24.35 
 
 		 333 aa  43.5  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149516  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0709  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  27.61 
 
 		 353 aa  43.5  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0323  Radical SAM domain protein  23.42 
 
 		 265 aa  43.5  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0373  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.36 
 
 		 323 aa  43.5  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2450  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.6 
 
 		 359 aa  43.5  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3289  Radical SAM domain protein  30.51 
 
 		 351 aa  43.5  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0969  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.8 
 
 		 373 aa  43.5  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112196  normal  0.243717 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1348  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30 
 
 		 329 aa  43.5  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0904  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.8 
 
 		 373 aa  43.5  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0102552  normal  0.0824176 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1590  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.55 
 
 		 298 aa  43.5  0.008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.370128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1033  radical SAM domain-containing protein  23.56 
 
 		 287 aa  43.1  0.009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2441  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.35 
 
 		 395 aa  43.1  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0164465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  26.89 
 
 		 404 aa  43.1  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0157  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.71 
 
 		 320 aa  43.1  0.009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1440  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.39 
 
 		 312 aa  43.1  0.01  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>