31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0768 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_0768  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
300 aa  613  1e-175  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00853946 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1414  radical SAM domain-containing protein  79.24 
 
 
290 aa  486  1e-136  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1901  radical SAM domain-containing protein  74.41 
 
 
298 aa  473  1e-132  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.844314  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0964  radical SAM domain-containing protein  68.77 
 
 
300 aa  439  9.999999999999999e-123  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2157  radical SAM domain-containing protein  36.73 
 
 
343 aa  177  2e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.350893  hitchhiker  0.000485535 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0772  Radical SAM domain protein  34.64 
 
 
353 aa  167  2.9999999999999998e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00827536  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0106  Radical SAM domain protein  36.57 
 
 
343 aa  166  4e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0784  radical SAM family protein  32.89 
 
 
337 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00132902  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0398  radical SAM domain-containing protein  32.85 
 
 
371 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0698777  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0508  radical SAM domain-containing protein  33.7 
 
 
373 aa  161  1e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0464  radical SAM domain-containing protein  36.88 
 
 
353 aa  161  2e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1063  Radical SAM domain protein  34.78 
 
 
350 aa  160  2e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.540032  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2062  radical SAM domain-containing protein  35.13 
 
 
341 aa  159  4e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.539759 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1789  radical SAM domain-containing protein  36.33 
 
 
341 aa  158  1e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0439  radical SAM domain-containing protein  32.6 
 
 
371 aa  158  1e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0043  radical SAM family Fe-S protein  35.29 
 
 
348 aa  155  6e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0273  hypothetical protein  36.82 
 
 
353 aa  155  7e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.888723  normal  0.245364 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1481  radical SAM domain-containing protein  32.6 
 
 
371 aa  152  8e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0924558  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0983  radical SAM domain-containing protein  35.53 
 
 
380 aa  150  2e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.156314  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0117  hypothetical protein  34.32 
 
 
334 aa  145  1e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0016  radical SAM domain-containing protein  35.06 
 
 
344 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.238462  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0936  Radical SAM domain protein  33.7 
 
 
343 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.674566 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1246  Radical SAM domain protein  31.72 
 
 
346 aa  133  3e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0312  Radical SAM domain protein  33.21 
 
 
332 aa  129  5.0000000000000004e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.139539 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3338  Radical SAM domain protein  29.54 
 
 
331 aa  125  7e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1383  Radical SAM domain protein  31.77 
 
 
331 aa  125  9e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632636  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1025  Radical SAM domain protein  25.86 
 
 
409 aa  95.1  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1369  hypothetical protein  24.28 
 
 
471 aa  87  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3410  Radical SAM domain protein  23.92 
 
 
433 aa  73.6  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.736979  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00200  pyruvate formate-lyase activating-like enzyme  19.31 
 
 
464 aa  45.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.158297  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1449  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.81 
 
 
373 aa  42.7  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0775464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>