36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0772 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0772  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 353 aa  730    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00827536  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0043  radical SAM family Fe-S protein  46.06 
 
 		 348 aa  299  4e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0273  hypothetical protein  45.64 
 
 		 353 aa  294  2e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.888723  normal  0.245364 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1481  radical SAM domain-containing protein  38.95 
 
 		 371 aa  263  4e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0924558  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0016  radical SAM domain-containing protein  44.12 
 
 		 344 aa  262  6.999999999999999e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.238462  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0439  radical SAM domain-containing protein  38.67 
 
 		 371 aa  259  4e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0936  Radical SAM domain protein  40.58 
 
 		 343 aa  257  2e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.674566 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0983  radical SAM domain-containing protein  40.44 
 
 		 380 aa  256  4e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.156314  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3338  Radical SAM domain protein  41.98 
 
 		 331 aa  256  5e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0784  radical SAM family protein  42.42 
 
 		 337 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00132902  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0398  radical SAM domain-containing protein  38.29 
 
 		 371 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0698777  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0508  radical SAM domain-containing protein  39 
 
 		 373 aa  253  3e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1383  Radical SAM domain protein  41.52 
 
 		 331 aa  249  7e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632636  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1246  Radical SAM domain protein  40 
 
 		 346 aa  240  2e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0312  Radical SAM domain protein  39.12 
 
 		 332 aa  238  1e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.139539 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0106  Radical SAM domain protein  43.87 
 
 		 343 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2062  radical SAM domain-containing protein  39.09 
 
 		 341 aa  233  4.0000000000000004e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.539759 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1789  radical SAM domain-containing protein  36.95 
 
 		 341 aa  229  5e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1063  Radical SAM domain protein  37.89 
 
 		 350 aa  219  5e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.540032  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2157  radical SAM domain-containing protein  37.61 
 
 		 343 aa  215  9.999999999999999e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.350893  hitchhiker  0.000485535 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0117  hypothetical protein  38.91 
 
 		 334 aa  204  2e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0464  radical SAM domain-containing protein  37.72 
 
 		 353 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0768  radical SAM domain-containing protein  34.64 
 
 		 300 aa  167  4e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00853946 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0964  radical SAM domain-containing protein  34.94 
 
 		 300 aa  161  1e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1901  radical SAM domain-containing protein  34.33 
 
 		 298 aa  156  6e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.844314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1414  radical SAM domain-containing protein  35.69 
 
 		 290 aa  156  7e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1369  hypothetical protein  27.73 
 
 		 471 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1025  Radical SAM domain protein  26.67 
 
 		 409 aa  95.1  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3410  Radical SAM domain protein  27.49 
 
 		 433 aa  93.2  6e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.736979  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00200  pyruvate formate-lyase activating-like enzyme  24.4 
 
 		 464 aa  75.9  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.158297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2925  Radical SAM domain protein  26.61 
 
 		 440 aa  70.9  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000258536  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1387  radical SAM family protein  26.32 
 
 		 441 aa  71.2  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05050  pyruvate formate-lyase activating-like enzyme  24 
 
 		 457 aa  60.5  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2101  radical SAM family protein  24.8 
 
 		 417 aa  57.4  0.0000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2369  Radical SAM domain protein  24.06 
 
 		 435 aa  56.6  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0697954  normal  0.318858 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1327  Radical SAM domain protein  22.71 
 
 		 375 aa  43.9  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000215386  hitchhiker  0.00000524996 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>