92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_00200 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_00200  pyruvate formate-lyase activating-like enzyme  100 
 
 		 464 aa  971    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.158297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2369  Radical SAM domain protein  45.97 
 
 		 435 aa  333  5e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0697954  normal  0.318858 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2925  Radical SAM domain protein  41.01 
 
 		 440 aa  322  8e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000258536  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1387  radical SAM family protein  38.31 
 
 		 441 aa  306  6e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05050  pyruvate formate-lyase activating-like enzyme  37.17 
 
 		 457 aa  265  8.999999999999999e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2101  radical SAM family protein  35 
 
 		 417 aa  236  8e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3410  Radical SAM domain protein  29 
 
 		 433 aa  106  8e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.736979  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1025  Radical SAM domain protein  28.74 
 
 		 409 aa  93.2  8e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0464  radical SAM domain-containing protein  24.42 
 
 		 353 aa  82.4  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0983  radical SAM domain-containing protein  23.08 
 
 		 380 aa  81.3  0.00000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.156314  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1063  Radical SAM domain protein  23.4 
 
 		 350 aa  77  0.0000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.540032  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1369  hypothetical protein  24.72 
 
 		 471 aa  76.6  0.0000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0772  Radical SAM domain protein  24.4 
 
 		 353 aa  75.9  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00827536  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0043  radical SAM family Fe-S protein  22.51 
 
 		 348 aa  73.2  0.000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2157  radical SAM domain-containing protein  23.37 
 
 		 343 aa  70.5  0.00000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.350893  hitchhiker  0.000485535 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1246  Radical SAM domain protein  28.44 
 
 		 346 aa  70.1  0.00000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1481  radical SAM domain-containing protein  22.49 
 
 		 371 aa  66.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0924558  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0398  radical SAM domain-containing protein  22.33 
 
 		 371 aa  66.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0698777  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0936  Radical SAM domain protein  29.33 
 
 		 343 aa  65.1  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.674566 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0312  Radical SAM domain protein  28.04 
 
 		 332 aa  65.1  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.139539 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0273  hypothetical protein  25.58 
 
 		 353 aa  63.5  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.888723  normal  0.245364 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3338  Radical SAM domain protein  35.2 
 
 		 331 aa  62.4  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0508  radical SAM domain-containing protein  18.64 
 
 		 373 aa  62.4  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0439  radical SAM domain-containing protein  20.93 
 
 		 371 aa  61.6  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0016  radical SAM domain-containing protein  22.57 
 
 		 344 aa  58.9  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.238462  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  35.71 
 
 		 349 aa  57.8  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0117  hypothetical protein  23.9 
 
 		 334 aa  57.4  0.0000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0784  radical SAM family protein  21.53 
 
 		 337 aa  57  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00132902  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5965  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  34.13 
 
 		 387 aa  57  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0233125 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1383  Radical SAM domain protein  32 
 
 		 331 aa  56.6  0.0000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632636  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5162  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  30.95 
 
 		 379 aa  53.5  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.426022 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5119  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  30.95 
 
 		 379 aa  53.5  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.830153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3249  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  30.95 
 
 		 379 aa  53.5  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.384282  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5901  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  32.08 
 
 		 374 aa  51.2  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.630073 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6168  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  31.13 
 
 		 374 aa  50.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0169631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6512  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  33.33 
 
 		 405 aa  50.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.397453  normal  0.0847554 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3053  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  35.45 
 
 		 385 aa  50.1  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3544  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.24 
 
 		 464 aa  50.1  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2456  coenzyme PQQ biosynthesis protein E  28.57 
 
 		 370 aa  49.3  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152479  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2859  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  38.68 
 
 		 330 aa  50.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00116324  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2470  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  31.19 
 
 		 407 aa  49.7  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.616066 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2588  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  32.73 
 
 		 414 aa  49.3  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0973479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2062  radical SAM domain-containing protein  22.22 
 
 		 341 aa  49.3  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.539759 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1680  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.82 
 
 		 397 aa  48.9  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.725852 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0292  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  32.74 
 
 		 386 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.876947 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1280  Radical SAM domain protein  29.91 
 
 		 346 aa  48.9  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2836  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  27.13 
 
 		 381 aa  49.3  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2492  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  32.11 
 
 		 400 aa  47.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.250234  normal  0.0827229 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2098  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  32.11 
 
 		 400 aa  47.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.456256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1702  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.56 
 
 		 375 aa  47.8  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.475579 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6304  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  31.43 
 
 		 398 aa  47.4  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4038  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  33.33 
 
 		 370 aa  47.4  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2175  coenzyme PQQ biosynthesis protein E  26.01 
 
 		 350 aa  47.4  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.842186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0106  Radical SAM domain protein  24.04 
 
 		 343 aa  47  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  33.64 
 
 		 358 aa  46.6  0.0009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1449  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  27.91 
 
 		 373 aa  46.2  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0775464  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1279  Radical SAM domain protein  36.7 
 
 		 327 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000563551 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1769  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.9 
 
 		 384 aa  46.2  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.866742 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1789  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 341 aa  46.2  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0848  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  33.02 
 
 		 371 aa  45.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0729  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  30.36 
 
 		 380 aa  45.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701014  normal  0.10573 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3915  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  32.38 
 
 		 375 aa  45.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1151  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  32.38 
 
 		 373 aa  45.8  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00861011 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0516  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  24.31 
 
 		 381 aa  45.1  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0376  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  30.19 
 
 		 376 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  27.12 
 
 		 479 aa  45.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  32.81 
 
 		 413 aa  45.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0768  radical SAM domain-containing protein  19.66 
 
 		 300 aa  45.1  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00853946 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  24.74 
 
 		 565 aa  45.1  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  29.73 
 
 		 381 aa  45.1  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2153  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.3 
 
 		 384 aa  44.7  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.666004  normal  0.11423 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1817  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.3 
 
 		 384 aa  44.7  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0509  coenzyme PQQ synthesis protein E  30.56 
 
 		 389 aa  44.7  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4674  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  30.56 
 
 		 389 aa  44.7  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0689  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  30.48 
 
 		 389 aa  44.7  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.62446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  39.08 
 
 		 346 aa  44.3  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0454  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  31.13 
 
 		 368 aa  44.7  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0405  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  28.57 
 
 		 386 aa  44.7  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0024  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  33.33 
 
 		 309 aa  44.3  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4827  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  30.19 
 
 		 382 aa  44.3  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.900722 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1362  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.59 
 
 		 458 aa  44.3  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.82538  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  33.65 
 
 		 380 aa  44.3  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01588  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  32.11 
 
 		 372 aa  43.9  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.150744  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5988  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  32.41 
 
 		 379 aa  43.5  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.257809  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5768  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.19 
 
 		 379 aa  43.9  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.922128  normal  0.949586 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3366  radical SAM family protein  30.58 
 
 		 374 aa  43.5  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0273275 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0790  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  27.88 
 
 		 380 aa  43.5  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2446  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  27.88 
 
 		 380 aa  43.5  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.121554  normal  0.0228236 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3319  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  29.81 
 
 		 381 aa  43.5  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.328193 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  25.84 
 
 		 418 aa  43.5  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0401  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  29.25 
 
 		 376 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2366  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.77 
 
 		 332 aa  43.1  0.01  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>