41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0273 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0273  hypothetical protein  100 
 
 		 353 aa  718    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.888723  normal  0.245364 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0043  radical SAM family Fe-S protein  54.11 
 
 		 348 aa  384  1e-105  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0016  radical SAM domain-containing protein  49.43 
 
 		 344 aa  353  2e-96  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.238462  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0106  Radical SAM domain protein  46.82 
 
 		 343 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1789  radical SAM domain-containing protein  46.55 
 
 		 341 aa  305  9.000000000000001e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0784  radical SAM family protein  44.41 
 
 		 337 aa  301  1e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00132902  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0936  Radical SAM domain protein  44.71 
 
 		 343 aa  297  2e-79  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.674566 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3338  Radical SAM domain protein  45.16 
 
 		 331 aa  295  6e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2062  radical SAM domain-containing protein  46.18 
 
 		 341 aa  295  6e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.539759 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0772  Radical SAM domain protein  45.64 
 
 		 353 aa  294  2e-78  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00827536  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1383  Radical SAM domain protein  44.28 
 
 		 331 aa  287  2e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632636  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1246  Radical SAM domain protein  43.86 
 
 		 346 aa  287  2e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0312  Radical SAM domain protein  42.98 
 
 		 332 aa  286  2.9999999999999996e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.139539 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0117  hypothetical protein  43.79 
 
 		 334 aa  278  1e-73  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0508  radical SAM domain-containing protein  40.4 
 
 		 373 aa  232  8.000000000000001e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0439  radical SAM domain-containing protein  39.48 
 
 		 371 aa  228  9e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0398  radical SAM domain-containing protein  39.14 
 
 		 371 aa  228  1e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0698777  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1481  radical SAM domain-containing protein  38.86 
 
 		 371 aa  228  1e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0924558  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0983  radical SAM domain-containing protein  37.67 
 
 		 380 aa  212  7.999999999999999e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.156314  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2157  radical SAM domain-containing protein  37.43 
 
 		 343 aa  209  8e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.350893  hitchhiker  0.000485535 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1063  Radical SAM domain protein  40.35 
 
 		 350 aa  204  2e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.540032  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0464  radical SAM domain-containing protein  34.62 
 
 		 353 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0768  radical SAM domain-containing protein  36.82 
 
 		 300 aa  155  9e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00853946 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1901  radical SAM domain-containing protein  35.07 
 
 		 298 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.844314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0964  radical SAM domain-containing protein  33.83 
 
 		 300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1414  radical SAM domain-containing protein  35.45 
 
 		 290 aa  145  9e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1369  hypothetical protein  32.37 
 
 		 471 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1025  Radical SAM domain protein  30.85 
 
 		 409 aa  96.3  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3410  Radical SAM domain protein  29.84 
 
 		 433 aa  88.6  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.736979  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2925  Radical SAM domain protein  30 
 
 		 440 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000258536  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1387  radical SAM family protein  29.58 
 
 		 441 aa  72.8  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2101  radical SAM family protein  29.95 
 
 		 417 aa  72  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00200  pyruvate formate-lyase activating-like enzyme  25.58 
 
 		 464 aa  63.5  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.158297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2369  Radical SAM domain protein  26.21 
 
 		 435 aa  62.4  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0697954  normal  0.318858 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05050  pyruvate formate-lyase activating-like enzyme  25 
 
 		 457 aa  58.2  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2450  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  39.25 
 
 		 359 aa  52.8  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0301  radical SAM family Fe-S protein  29.95 
 
 		 206 aa  47.4  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.239452  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2288  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.03 
 
 		 375 aa  43.5  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1969  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.37 
 
 		 384 aa  43.1  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.046264  normal  0.222604 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38780  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.37 
 
 		 381 aa  42.7  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3305  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.37 
 
 		 370 aa  42.7  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>