36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0117 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0117  hypothetical protein  100 
 
 		 334 aa  696    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1789  radical SAM domain-containing protein  55.56 
 
 		 341 aa  381  1e-105  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2062  radical SAM domain-containing protein  53.61 
 
 		 341 aa  363  2e-99  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.539759 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0106  Radical SAM domain protein  55.56 
 
 		 343 aa  362  4e-99  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0784  radical SAM family protein  51.23 
 
 		 337 aa  328  6e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00132902  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0043  radical SAM family Fe-S protein  46.11 
 
 		 348 aa  290  3e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0273  hypothetical protein  43.79 
 
 		 353 aa  278  1e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.888723  normal  0.245364 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0936  Radical SAM domain protein  37.65 
 
 		 343 aa  227  2e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.674566 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1246  Radical SAM domain protein  37.35 
 
 		 346 aa  224  2e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0016  radical SAM domain-containing protein  38.87 
 
 		 344 aa  223  3e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.238462  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0312  Radical SAM domain protein  37.05 
 
 		 332 aa  220  3e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.139539 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3338  Radical SAM domain protein  37.16 
 
 		 331 aa  211  2e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0508  radical SAM domain-containing protein  37.18 
 
 		 373 aa  209  5e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1383  Radical SAM domain protein  36.04 
 
 		 331 aa  206  4e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632636  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0772  Radical SAM domain protein  38.91 
 
 		 353 aa  204  1e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00827536  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0398  radical SAM domain-containing protein  35.41 
 
 		 371 aa  193  3e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0698777  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0439  radical SAM domain-containing protein  35.29 
 
 		 371 aa  188  1e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1481  radical SAM domain-containing protein  34.84 
 
 		 371 aa  187  2e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0924558  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1063  Radical SAM domain protein  34.48 
 
 		 350 aa  175  8e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.540032  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0983  radical SAM domain-containing protein  33.99 
 
 		 380 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.156314  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2157  radical SAM domain-containing protein  33.57 
 
 		 343 aa  168  9e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.350893  hitchhiker  0.000485535 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1901  radical SAM domain-containing protein  34.56 
 
 		 298 aa  146  5e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.844314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0768  radical SAM domain-containing protein  34.32 
 
 		 300 aa  145  1e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00853946 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1414  radical SAM domain-containing protein  34.32 
 
 		 290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0964  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0464  radical SAM domain-containing protein  35.11 
 
 		 353 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1369  hypothetical protein  26.09 
 
 		 471 aa  87  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2369  Radical SAM domain protein  29.11 
 
 		 435 aa  72.4  0.000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0697954  normal  0.318858 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1025  Radical SAM domain protein  28.4 
 
 		 409 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3410  Radical SAM domain protein  25.63 
 
 		 433 aa  62  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.736979  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00200  pyruvate formate-lyase activating-like enzyme  23.9 
 
 		 464 aa  57.4  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.158297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1387  radical SAM family protein  30.6 
 
 		 441 aa  57.8  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2925  Radical SAM domain protein  24.07 
 
 		 440 aa  48.5  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000258536  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05050  pyruvate formate-lyase activating-like enzyme  24.13 
 
 		 457 aa  43.5  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3364  radical SAM domain-containing protein  28.28 
 
 		 484 aa  42.7  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.155713  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1561  radical SAM domain-containing protein  30.23 
 
 		 455 aa  42.7  0.009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>