34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1383 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_1383  Radical SAM domain protein  100 
 
 
331 aa  682    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632636  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3338  Radical SAM domain protein  89.43 
 
 
331 aa  601  1.0000000000000001e-171  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0312  Radical SAM domain protein  84.34 
 
 
332 aa  597  1e-170  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.139539 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0936  Radical SAM domain protein  83.99 
 
 
343 aa  585  1e-166  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.674566 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1246  Radical SAM domain protein  79.09 
 
 
346 aa  562  1.0000000000000001e-159  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0273  hypothetical protein  44.41 
 
 
353 aa  293  2e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.888723  normal  0.245364 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0043  radical SAM family Fe-S protein  43.66 
 
 
348 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0772  Radical SAM domain protein  41.52 
 
 
353 aa  251  1e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00827536  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1789  radical SAM domain-containing protein  42.77 
 
 
341 aa  243  3e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0016  radical SAM domain-containing protein  40.6 
 
 
344 aa  243  5e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.238462  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0106  Radical SAM domain protein  40.96 
 
 
343 aa  240  2e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0784  radical SAM family protein  39.39 
 
 
337 aa  236  4e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00132902  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2062  radical SAM domain-containing protein  39.7 
 
 
341 aa  233  5e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.539759 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0117  hypothetical protein  36.04 
 
 
334 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0508  radical SAM domain-containing protein  33.62 
 
 
373 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1481  radical SAM domain-containing protein  34.09 
 
 
371 aa  186  5e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0924558  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0439  radical SAM domain-containing protein  35 
 
 
371 aa  185  8e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0398  radical SAM domain-containing protein  33.9 
 
 
371 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0698777  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0983  radical SAM domain-containing protein  33.05 
 
 
380 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.156314  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1063  Radical SAM domain protein  36.27 
 
 
350 aa  182  8.000000000000001e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.540032  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2157  radical SAM domain-containing protein  37.41 
 
 
343 aa  175  9.999999999999999e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.350893  hitchhiker  0.000485535 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0464  radical SAM domain-containing protein  30.37 
 
 
353 aa  134  3e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0768  radical SAM domain-containing protein  32.49 
 
 
300 aa  127  3e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00853946 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0964  radical SAM domain-containing protein  32.6 
 
 
300 aa  124  2e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1901  radical SAM domain-containing protein  29.85 
 
 
298 aa  122  7e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.844314  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1369  hypothetical protein  29.04 
 
 
471 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1414  radical SAM domain-containing protein  29.63 
 
 
290 aa  109  6e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1025  Radical SAM domain protein  30.91 
 
 
409 aa  100  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3410  Radical SAM domain protein  26.36 
 
 
433 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.736979  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00200  pyruvate formate-lyase activating-like enzyme  25.82 
 
 
464 aa  60.8  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.158297  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1387  radical SAM family protein  27.59 
 
 
441 aa  59.3  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2925  Radical SAM domain protein  30 
 
 
440 aa  57  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000258536  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05050  pyruvate formate-lyase activating-like enzyme  25.93 
 
 
457 aa  56.6  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2369  Radical SAM domain protein  24.06 
 
 
435 aa  47.4  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0697954  normal  0.318858 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>