32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1414 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1414  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
290 aa  592  1e-168  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0768  radical SAM domain-containing protein  79.24 
 
 
300 aa  486  1e-136  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00853946 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1901  radical SAM domain-containing protein  77.85 
 
 
298 aa  478  1e-134  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.844314  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0964  radical SAM domain-containing protein  71.03 
 
 
300 aa  435  1e-121  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2157  radical SAM domain-containing protein  37.17 
 
 
343 aa  171  1e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.350893  hitchhiker  0.000485535 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0784  radical SAM family protein  34.43 
 
 
337 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00132902  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0464  radical SAM domain-containing protein  36.82 
 
 
353 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0106  Radical SAM domain protein  38.06 
 
 
343 aa  160  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0398  radical SAM domain-containing protein  33.09 
 
 
371 aa  161  2e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0698777  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1063  Radical SAM domain protein  35.66 
 
 
350 aa  159  5e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.540032  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0439  radical SAM domain-containing protein  33.21 
 
 
371 aa  157  3e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0772  Radical SAM domain protein  35.69 
 
 
353 aa  156  5.0000000000000005e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00827536  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2062  radical SAM domain-containing protein  37.09 
 
 
341 aa  155  5.0000000000000005e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.539759 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1481  radical SAM domain-containing protein  32.72 
 
 
371 aa  154  1e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0924558  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0508  radical SAM domain-containing protein  32.36 
 
 
373 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0983  radical SAM domain-containing protein  34.91 
 
 
380 aa  150  2e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.156314  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0043  radical SAM family Fe-S protein  35.82 
 
 
348 aa  149  8e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1789  radical SAM domain-containing protein  38.01 
 
 
341 aa  147  3e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0273  hypothetical protein  35.45 
 
 
353 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.888723  normal  0.245364 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0117  hypothetical protein  34.32 
 
 
334 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0016  radical SAM domain-containing protein  34.96 
 
 
344 aa  135  9e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.238462  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0936  Radical SAM domain protein  31.73 
 
 
343 aa  119  7e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.674566 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1246  Radical SAM domain protein  31 
 
 
346 aa  115  8.999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0312  Radical SAM domain protein  29.41 
 
 
332 aa  108  7.000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.139539 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3338  Radical SAM domain protein  28.01 
 
 
331 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1383  Radical SAM domain protein  29.26 
 
 
331 aa  107  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632636  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1025  Radical SAM domain protein  27.24 
 
 
409 aa  86.7  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1369  hypothetical protein  25.2 
 
 
471 aa  80.1  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3410  Radical SAM domain protein  25.37 
 
 
433 aa  65.5  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.736979  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0081  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  31.72 
 
 
373 aa  50.1  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  22.09 
 
 
427 aa  45.4  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38780  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.61 
 
 
381 aa  42.4  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>