39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0508 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0508  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
373 aa  726    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0398  radical SAM domain-containing protein  72.22 
 
 
371 aa  519  1e-146  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0698777  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1481  radical SAM domain-containing protein  71.94 
 
 
371 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0924558  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0439  radical SAM domain-containing protein  70.47 
 
 
371 aa  511  1e-144  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0983  radical SAM domain-containing protein  60.16 
 
 
380 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.156314  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0772  Radical SAM domain protein  39 
 
 
353 aa  253  3e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00827536  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0273  hypothetical protein  40.4 
 
 
353 aa  232  8.000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.888723  normal  0.245364 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0043  radical SAM family Fe-S protein  37.43 
 
 
348 aa  219  6e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0016  radical SAM domain-containing protein  35.24 
 
 
344 aa  218  1e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.238462  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1063  Radical SAM domain protein  41.73 
 
 
350 aa  215  9e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.540032  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2157  radical SAM domain-containing protein  38.33 
 
 
343 aa  210  3e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.350893  hitchhiker  0.000485535 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2062  radical SAM domain-containing protein  39.29 
 
 
341 aa  210  3e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.539759 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1789  radical SAM domain-containing protein  33.52 
 
 
341 aa  210  4e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0117  hypothetical protein  37.18 
 
 
334 aa  209  5e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0936  Radical SAM domain protein  33.43 
 
 
343 aa  207  3e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.674566 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0106  Radical SAM domain protein  38.38 
 
 
343 aa  207  3e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0312  Radical SAM domain protein  33.9 
 
 
332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.139539 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0784  radical SAM family protein  35.28 
 
 
337 aa  197  3e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00132902  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3338  Radical SAM domain protein  35.61 
 
 
331 aa  196  8.000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1246  Radical SAM domain protein  33.81 
 
 
346 aa  193  3e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1383  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 
331 aa  182  8.000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632636  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0768  radical SAM domain-containing protein  33.7 
 
 
300 aa  161  1e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00853946 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0464  radical SAM domain-containing protein  33.45 
 
 
353 aa  162  1e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1901  radical SAM domain-containing protein  33.57 
 
 
298 aa  160  3e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.844314  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0964  radical SAM domain-containing protein  31.34 
 
 
300 aa  153  4e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1414  radical SAM domain-containing protein  32.61 
 
 
290 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1369  hypothetical protein  28.66 
 
 
471 aa  129  6e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1025  Radical SAM domain protein  28.37 
 
 
409 aa  103  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3410  Radical SAM domain protein  23.39 
 
 
433 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.736979  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05050  pyruvate formate-lyase activating-like enzyme  25.17 
 
 
457 aa  81.3  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2369  Radical SAM domain protein  26.39 
 
 
435 aa  80.1  0.00000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0697954  normal  0.318858 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2925  Radical SAM domain protein  27.95 
 
 
440 aa  79  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000258536  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2101  radical SAM family protein  29.21 
 
 
417 aa  77.8  0.0000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1387  radical SAM family protein  26.56 
 
 
441 aa  71.2  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00200  pyruvate formate-lyase activating-like enzyme  18.64 
 
 
464 aa  62.4  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.158297  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1327  Radical SAM domain protein  23.15 
 
 
375 aa  56.2  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000215386  hitchhiker  0.00000524996 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1449  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  23.39 
 
 
373 aa  45.8  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0775464  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2881  hypothetical protein  22.99 
 
 
348 aa  43.5  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1782  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.76 
 
 
389 aa  43.1  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.449437  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>