35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3338 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_3338  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 331 aa  681    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1383  Radical SAM domain protein  89.43 
 
 		 331 aa  602  1.0000000000000001e-171  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632636  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0312  Radical SAM domain protein  86.45 
 
 		 332 aa  601  1.0000000000000001e-171  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.139539 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0936  Radical SAM domain protein  86.67 
 
 		 343 aa  592  1e-168  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.674566 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1246  Radical SAM domain protein  79.39 
 
 		 346 aa  558  1e-158  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0273  hypothetical protein  45.29 
 
 		 353 aa  301  8.000000000000001e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.888723  normal  0.245364 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0043  radical SAM family Fe-S protein  46.15 
 
 		 348 aa  288  8e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0772  Radical SAM domain protein  41.98 
 
 		 353 aa  258  7e-68  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00827536  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0016  radical SAM domain-containing protein  42.39 
 
 		 344 aa  258  1e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.238462  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0106  Radical SAM domain protein  42.77 
 
 		 343 aa  250  2e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0784  radical SAM family protein  41.21 
 
 		 337 aa  249  6e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00132902  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1789  radical SAM domain-containing protein  41.69 
 
 		 341 aa  239  5.999999999999999e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2062  radical SAM domain-containing protein  38.76 
 
 		 341 aa  228  2e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.539759 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0117  hypothetical protein  37.16 
 
 		 334 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0508  radical SAM domain-containing protein  35.9 
 
 		 373 aa  203  4e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1481  radical SAM domain-containing protein  34.65 
 
 		 371 aa  194  3e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0924558  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0398  radical SAM domain-containing protein  35.01 
 
 		 371 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0698777  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0983  radical SAM domain-containing protein  34.75 
 
 		 380 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.156314  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0439  radical SAM domain-containing protein  35.11 
 
 		 371 aa  189  7e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2157  radical SAM domain-containing protein  38.25 
 
 		 343 aa  180  2.9999999999999997e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.350893  hitchhiker  0.000485535 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1063  Radical SAM domain protein  36.3 
 
 		 350 aa  179  8e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.540032  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0464  radical SAM domain-containing protein  31.32 
 
 		 353 aa  138  2e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0768  radical SAM domain-containing protein  30.25 
 
 		 300 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00853946 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0964  radical SAM domain-containing protein  30.4 
 
 		 300 aa  122  6e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1901  radical SAM domain-containing protein  29.89 
 
 		 298 aa  120  3e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.844314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1414  radical SAM domain-containing protein  28.37 
 
 		 290 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1369  hypothetical protein  27.96 
 
 		 471 aa  105  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1025  Radical SAM domain protein  28.96 
 
 		 409 aa  98.6  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3410  Radical SAM domain protein  24.82 
 
 		 433 aa  76.3  0.0000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.736979  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00200  pyruvate formate-lyase activating-like enzyme  27.09 
 
 		 464 aa  67.4  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.158297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1387  radical SAM family protein  28.97 
 
 		 441 aa  58.5  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2925  Radical SAM domain protein  29.52 
 
 		 440 aa  56.6  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000258536  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05050  pyruvate formate-lyase activating-like enzyme  25.12 
 
 		 457 aa  53.9  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2369  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 435 aa  49.3  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0697954  normal  0.318858 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2101  radical SAM family protein  23.51 
 
 		 417 aa  44.3  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>