32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1901 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1901  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 298 aa  609  1e-173  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.844314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1414  radical SAM domain-containing protein  77.85 
 
 		 290 aa  478  1e-134  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0768  radical SAM domain-containing protein  74.41 
 
 		 300 aa  473  1e-132  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00853946 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0964  radical SAM domain-containing protein  72.24 
 
 		 300 aa  449  1e-125  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2157  radical SAM domain-containing protein  37.55 
 
 		 343 aa  175  9.999999999999999e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.350893  hitchhiker  0.000485535 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0464  radical SAM domain-containing protein  36.65 
 
 		 353 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0398  radical SAM domain-containing protein  34.67 
 
 		 371 aa  167  2e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0698777  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1063  Radical SAM domain protein  37.5 
 
 		 350 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.540032  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0439  radical SAM domain-containing protein  33.46 
 
 		 371 aa  161  1e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0508  radical SAM domain-containing protein  33.57 
 
 		 373 aa  160  2e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0784  radical SAM family protein  34.34 
 
 		 337 aa  159  6e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00132902  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1481  radical SAM domain-containing protein  33.82 
 
 		 371 aa  159  7e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0924558  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0772  Radical SAM domain protein  34.33 
 
 		 353 aa  156  4e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00827536  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0106  Radical SAM domain protein  35.42 
 
 		 343 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2062  radical SAM domain-containing protein  37.68 
 
 		 341 aa  155  6e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.539759 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0043  radical SAM family Fe-S protein  35.79 
 
 		 348 aa  154  1e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0983  radical SAM domain-containing protein  35.16 
 
 		 380 aa  154  2e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.156314  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0273  hypothetical protein  35.07 
 
 		 353 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.888723  normal  0.245364 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1789  radical SAM domain-containing protein  35.82 
 
 		 341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0117  hypothetical protein  34.56 
 
 		 334 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0016  radical SAM domain-containing protein  35.14 
 
 		 344 aa  143  4e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.238462  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0936  Radical SAM domain protein  30.74 
 
 		 343 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.674566 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1246  Radical SAM domain protein  30.74 
 
 		 346 aa  125  6e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0312  Radical SAM domain protein  30.51 
 
 		 332 aa  122  7e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.139539 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1383  Radical SAM domain protein  29.48 
 
 		 331 aa  119  4.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632636  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3338  Radical SAM domain protein  29 
 
 		 331 aa  118  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1025  Radical SAM domain protein  27.44 
 
 		 409 aa  101  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1369  hypothetical protein  25.51 
 
 		 471 aa  90.9  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3410  Radical SAM domain protein  26.32 
 
 		 433 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.736979  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2719  pyruvate formate-lyase activating enzyme  23.76 
 
 		 241 aa  43.1  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2101  radical SAM family protein  22.16 
 
 		 417 aa  42.7  0.008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38780  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  24.67 
 
 		 381 aa  42.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>