42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0043 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_0043  radical SAM family Fe-S protein  100 
 
 		 348 aa  719    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0273  hypothetical protein  54.11 
 
 		 353 aa  384  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.888723  normal  0.245364 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0016  radical SAM domain-containing protein  48.42 
 
 		 344 aa  331  9e-90  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.238462  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0772  Radical SAM domain protein  46.06 
 
 		 353 aa  299  4e-80  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00827536  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0784  radical SAM family protein  44.81 
 
 		 337 aa  290  2e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00132902  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0117  hypothetical protein  46.11 
 
 		 334 aa  290  3e-77  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0936  Radical SAM domain protein  45.13 
 
 		 343 aa  287  2e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.674566 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1246  Radical SAM domain protein  45.43 
 
 		 346 aa  283  4.0000000000000003e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3338  Radical SAM domain protein  46.15 
 
 		 331 aa  282  5.000000000000001e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1789  radical SAM domain-containing protein  43.88 
 
 		 341 aa  275  9e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0312  Radical SAM domain protein  44.28 
 
 		 332 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.139539 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0106  Radical SAM domain protein  43.06 
 
 		 343 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1383  Radical SAM domain protein  43.66 
 
 		 331 aa  268  1e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632636  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2062  radical SAM domain-containing protein  43.45 
 
 		 341 aa  266  5e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.539759 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0439  radical SAM domain-containing protein  40.97 
 
 		 371 aa  225  7e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0398  radical SAM domain-containing protein  38.97 
 
 		 371 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0698777  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0508  radical SAM domain-containing protein  37.43 
 
 		 373 aa  219  6e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1481  radical SAM domain-containing protein  38.11 
 
 		 371 aa  216  5e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0924558  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2157  radical SAM domain-containing protein  41.89 
 
 		 343 aa  211  2e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.350893  hitchhiker  0.000485535 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0983  radical SAM domain-containing protein  38.35 
 
 		 380 aa  204  2e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.156314  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1063  Radical SAM domain protein  40.65 
 
 		 350 aa  194  2e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.540032  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0464  radical SAM domain-containing protein  35.84 
 
 		 353 aa  156  4e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0768  radical SAM domain-containing protein  35.29 
 
 		 300 aa  155  7e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00853946 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1901  radical SAM domain-containing protein  35.79 
 
 		 298 aa  154  1e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.844314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1414  radical SAM domain-containing protein  35.82 
 
 		 290 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0964  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1369  hypothetical protein  28.71 
 
 		 471 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1025  Radical SAM domain protein  30.29 
 
 		 409 aa  97.8  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2925  Radical SAM domain protein  30.41 
 
 		 440 aa  85.9  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000258536  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3410  Radical SAM domain protein  27.98 
 
 		 433 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.736979  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2101  radical SAM family protein  27.55 
 
 		 417 aa  80.9  0.00000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1387  radical SAM family protein  27.97 
 
 		 441 aa  75.1  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00200  pyruvate formate-lyase activating-like enzyme  21.89 
 
 		 464 aa  73.6  0.000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.158297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05050  pyruvate formate-lyase activating-like enzyme  28.57 
 
 		 457 aa  71.6  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2369  Radical SAM domain protein  28.77 
 
 		 435 aa  70.9  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0697954  normal  0.318858 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0081  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  33.62 
 
 		 373 aa  52.8  0.000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0857  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  27.49 
 
 		 378 aa  45.8  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2492  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  32.71 
 
 		 400 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.250234  normal  0.0827229 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2098  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  32.71 
 
 		 400 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.456256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1468  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.48 
 
 		 388 aa  43.5  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.724446  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2836  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.64 
 
 		 381 aa  43.1  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1680  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  31.78 
 
 		 397 aa  43.1  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.725852 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>