41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0983 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_0983  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
380 aa  754    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.156314  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1481  radical SAM domain-containing protein  64.35 
 
 
371 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0924558  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0439  radical SAM domain-containing protein  62.22 
 
 
371 aa  437  1e-121  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0398  radical SAM domain-containing protein  62.67 
 
 
371 aa  435  1e-121  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0698777  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0508  radical SAM domain-containing protein  61.5 
 
 
373 aa  418  1e-116  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0772  Radical SAM domain protein  40.44 
 
 
353 aa  257  2e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00827536  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0016  radical SAM domain-containing protein  36.83 
 
 
344 aa  225  9e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.238462  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0273  hypothetical protein  38.21 
 
 
353 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.888723  normal  0.245364 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1063  Radical SAM domain protein  42.29 
 
 
350 aa  209  9e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.540032  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0043  radical SAM family Fe-S protein  38.35 
 
 
348 aa  205  1e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2157  radical SAM domain-containing protein  37.25 
 
 
343 aa  202  7e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.350893  hitchhiker  0.000485535 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0936  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 
343 aa  194  3e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.674566 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0784  radical SAM family protein  35.93 
 
 
337 aa  193  4e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00132902  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0312  Radical SAM domain protein  33.62 
 
 
332 aa  189  8e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.139539 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1246  Radical SAM domain protein  34.45 
 
 
346 aa  186  9e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3338  Radical SAM domain protein  35.49 
 
 
331 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2062  radical SAM domain-containing protein  36.3 
 
 
341 aa  184  3e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.539759 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1789  radical SAM domain-containing protein  32.14 
 
 
341 aa  182  1e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1383  Radical SAM domain protein  33.05 
 
 
331 aa  177  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632636  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0117  hypothetical protein  33.99 
 
 
334 aa  176  7e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0106  Radical SAM domain protein  34.27 
 
 
343 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0464  radical SAM domain-containing protein  37.23 
 
 
353 aa  171  3e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0964  radical SAM domain-containing protein  35.38 
 
 
300 aa  157  3e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1901  radical SAM domain-containing protein  35.53 
 
 
298 aa  154  2e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.844314  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0768  radical SAM domain-containing protein  35.53 
 
 
300 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00853946 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1414  radical SAM domain-containing protein  35.27 
 
 
290 aa  151  2e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1369  hypothetical protein  30.66 
 
 
471 aa  129  8.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1025  Radical SAM domain protein  27.64 
 
 
409 aa  103  7e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3410  Radical SAM domain protein  24.26 
 
 
433 aa  97.1  5e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.736979  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2369  Radical SAM domain protein  26.25 
 
 
435 aa  92.4  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0697954  normal  0.318858 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05050  pyruvate formate-lyase activating-like enzyme  25.85 
 
 
457 aa  91.3  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2925  Radical SAM domain protein  25.4 
 
 
440 aa  87  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000258536  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00200  pyruvate formate-lyase activating-like enzyme  23.08 
 
 
464 aa  84.3  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.158297  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2101  radical SAM family protein  29.9 
 
 
417 aa  83.2  0.000000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1387  radical SAM family protein  27.52 
 
 
441 aa  77  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1327  Radical SAM domain protein  22.81 
 
 
375 aa  61.2  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000215386  hitchhiker  0.00000524996 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0221  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.36 
 
 
322 aa  47.8  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0729  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  22.5 
 
 
380 aa  44.7  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701014  normal  0.10573 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2470  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.24 
 
 
407 aa  43.9  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.616066 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2623  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  28.36 
 
 
385 aa  43.9  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0587  radical SAM family protein  26.36 
 
 
376 aa  43.9  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>