43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2157 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_2157  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 343 aa  701    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.350893  hitchhiker  0.000485535 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1063  Radical SAM domain protein  59.71 
 
 		 350 aa  419  1e-116  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.540032  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0772  Radical SAM domain protein  37.61 
 
 		 353 aa  215  9.999999999999999e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00827536  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0439  radical SAM domain-containing protein  38.85 
 
 		 371 aa  212  1e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0043  radical SAM family Fe-S protein  41.89 
 
 		 348 aa  211  2e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0398  radical SAM domain-containing protein  39.25 
 
 		 371 aa  211  2e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0698777  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0508  radical SAM domain-containing protein  38.08 
 
 		 373 aa  210  3e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0273  hypothetical protein  37.43 
 
 		 353 aa  209  8e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.888723  normal  0.245364 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1481  radical SAM domain-containing protein  40.07 
 
 		 371 aa  207  2e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0924558  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0983  radical SAM domain-containing protein  37.25 
 
 		 380 aa  202  9e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.156314  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0016  radical SAM domain-containing protein  37.63 
 
 		 344 aa  192  7e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.238462  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0464  radical SAM domain-containing protein  37.26 
 
 		 353 aa  186  4e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0106  Radical SAM domain protein  36.75 
 
 		 343 aa  186  6e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1246  Radical SAM domain protein  35.33 
 
 		 346 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0936  Radical SAM domain protein  38.97 
 
 		 343 aa  181  1e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.674566 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2062  radical SAM domain-containing protein  35.27 
 
 		 341 aa  180  2.9999999999999997e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.539759 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1789  radical SAM domain-containing protein  34.14 
 
 		 341 aa  177  2e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0768  radical SAM domain-containing protein  36.73 
 
 		 300 aa  177  3e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00853946 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1901  radical SAM domain-containing protein  37.55 
 
 		 298 aa  175  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.844314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3338  Radical SAM domain protein  38.6 
 
 		 331 aa  172  5.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0784  radical SAM family protein  31.8 
 
 		 337 aa  171  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00132902  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1414  radical SAM domain-containing protein  37.17 
 
 		 290 aa  171  1e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0312  Radical SAM domain protein  34.88 
 
 		 332 aa  171  2e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.139539 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0117  hypothetical protein  33.57 
 
 		 334 aa  168  1e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0964  radical SAM domain-containing protein  35.36 
 
 		 300 aa  167  2e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1383  Radical SAM domain protein  37.41 
 
 		 331 aa  167  2.9999999999999998e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632636  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1369  hypothetical protein  33.84 
 
 		 471 aa  138  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1025  Radical SAM domain protein  33.21 
 
 		 409 aa  122  8e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3410  Radical SAM domain protein  30.04 
 
 		 433 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.736979  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05050  pyruvate formate-lyase activating-like enzyme  26.69 
 
 		 457 aa  92  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2369  Radical SAM domain protein  28.52 
 
 		 435 aa  84.3  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0697954  normal  0.318858 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2101  radical SAM family protein  27.71 
 
 		 417 aa  83.6  0.000000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1387  radical SAM family protein  27.61 
 
 		 441 aa  79  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2925  Radical SAM domain protein  23.85 
 
 		 440 aa  77  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000258536  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00200  pyruvate formate-lyase activating-like enzyme  23.37 
 
 		 464 aa  70.5  0.00000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.158297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1327  Radical SAM domain protein  24.26 
 
 		 375 aa  62  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000215386  hitchhiker  0.00000524996 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2836  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  24.71 
 
 		 381 aa  46.2  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2921  radical SAM domain-containing protein  23.53 
 
 		 324 aa  45.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.925202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1926  radical SAM domain-containing protein  28.81 
 
 		 347 aa  44.3  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.265306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  24.59 
 
 		 380 aa  44.7  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0739  radical SAM domain-containing protein  28.9 
 
 		 347 aa  43.9  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  24.79 
 
 		 462 aa  43.5  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  24.59 
 
 		 384 aa  42.7  0.009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>