70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Moth_1387 on replicon NC_007644
Organism: Moorella thermoacetica ATCC 39073



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007644  Moth_1387  radical SAM family protein  100 
 
 
441 aa  910    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2925  Radical SAM domain protein  58.05 
 
 
440 aa  552  1e-156  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000258536  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05050  pyruvate formate-lyase activating-like enzyme  41.33 
 
 
457 aa  348  1e-94  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2101  radical SAM family protein  39.81 
 
 
417 aa  323  3e-87  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00200  pyruvate formate-lyase activating-like enzyme  38.31 
 
 
464 aa  306  5.0000000000000004e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.158297  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2369  Radical SAM domain protein  40.52 
 
 
435 aa  298  2e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0697954  normal  0.318858 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1369  hypothetical protein  32.97 
 
 
471 aa  118  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1025  Radical SAM domain protein  31.78 
 
 
409 aa  106  9e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3410  Radical SAM domain protein  27.59 
 
 
433 aa  92.8  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.736979  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1481  radical SAM domain-containing protein  27.52 
 
 
371 aa  82.8  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0924558  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0398  radical SAM domain-containing protein  29.28 
 
 
371 aa  81.6  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0698777  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0439  radical SAM domain-containing protein  26.18 
 
 
371 aa  80.1  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2157  radical SAM domain-containing protein  27.61 
 
 
343 aa  79  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.350893  hitchhiker  0.000485535 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0016  radical SAM domain-containing protein  22.85 
 
 
344 aa  76.3  0.0000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.238462  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0043  radical SAM family Fe-S protein  27.97 
 
 
348 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0983  radical SAM domain-containing protein  27.52 
 
 
380 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.156314  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0273  hypothetical protein  29.58 
 
 
353 aa  72.8  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.888723  normal  0.245364 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0464  radical SAM domain-containing protein  27.13 
 
 
353 aa  72.4  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0508  radical SAM domain-containing protein  26.56 
 
 
373 aa  71.6  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0772  Radical SAM domain protein  26.32 
 
 
353 aa  71.2  0.00000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00827536  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1063  Radical SAM domain protein  23.05 
 
 
350 aa  70.1  0.00000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.540032  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1789  radical SAM domain-containing protein  30.57 
 
 
341 aa  67  0.0000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1327  Radical SAM domain protein  25.24 
 
 
375 aa  64.3  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000215386  hitchhiker  0.00000524996 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0784  radical SAM family protein  26.58 
 
 
337 aa  63.9  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00132902  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0312  Radical SAM domain protein  29.44 
 
 
332 aa  58.5  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.139539 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0117  hypothetical protein  30.6 
 
 
334 aa  57.8  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0936  Radical SAM domain protein  29.11 
 
 
343 aa  57.4  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.674566 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2062  radical SAM domain-containing protein  25.72 
 
 
341 aa  57.8  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.539759 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1383  Radical SAM domain protein  26.44 
 
 
331 aa  55.5  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632636  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1246  Radical SAM domain protein  28.17 
 
 
346 aa  54.3  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3338  Radical SAM domain protein  27.57 
 
 
331 aa  54.3  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0106  Radical SAM domain protein  24.34 
 
 
343 aa  53.9  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2559  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.74 
 
 
342 aa  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2189  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.74 
 
 
342 aa  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28518  hitchhiker  0.000000328904 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1203  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.23 
 
 
308 aa  50.4  0.00006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.31848  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01588  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  28.99 
 
 
372 aa  49.7  0.00009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.150744  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1170  pyruvate formate-lyase activating enzyme  26.07 
 
 
235 aa  49.3  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.763287  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0911  radical SAM domain-containing protein  28.1 
 
 
287 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.833054 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1357  pyruvate formate-lyase activating enzyme  27.5 
 
 
235 aa  48.9  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0857  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  30.36 
 
 
378 aa  48.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0672  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.88 
 
 
332 aa  48.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1972  radical SAM domain-containing protein  25.6 
 
 
275 aa  47.8  0.0004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.396519  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0301  radical SAM:molybdenum cofactor synthesis-like  26.45 
 
 
326 aa  47.8  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1680  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  29.57 
 
 
397 aa  46.2  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.725852 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1734  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.46 
 
 
329 aa  46.2  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2249  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  28.7 
 
 
371 aa  46.2  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0357225  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1542  pyruvate formate-lyase activating enzyme  26.95 
 
 
259 aa  45.4  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00863407  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01630  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  27.12 
 
 
333 aa  45.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1210  Radical SAM domain protein  28 
 
 
529 aa  45.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0217  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.44 
 
 
437 aa  45.8  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1279  Radical SAM domain protein  35.51 
 
 
327 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000563551 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6512  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  30.63 
 
 
405 aa  45.8  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.397453  normal  0.0847554 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2372  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.35 
 
 
341 aa  45.1  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.760376  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38780  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  28.95 
 
 
381 aa  44.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  24.46 
 
 
381 aa  44.3  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3053  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  33.03 
 
 
385 aa  44.3  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1634  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  24.43 
 
 
424 aa  44.7  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00241084  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3366  radical SAM family protein  26.19 
 
 
374 aa  43.9  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0273275 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1081  pyruvate formate-lyase activating  35.23 
 
 
267 aa  44.3  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.257983  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2981  pyruvate formate-lyase activating  35.23 
 
 
267 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.743712  normal  0.290746 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0292  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  30.97 
 
 
386 aa  43.9  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.876947 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3544  Elongator protein 3/MiaB/NifB  30.51 
 
 
464 aa  43.9  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0678  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  27.69 
 
 
424 aa  43.5  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0514333  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2470  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  27.52 
 
 
407 aa  43.5  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.616066 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1762  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.46 
 
 
333 aa  43.5  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.114768 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2268  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.85 
 
 
325 aa  43.5  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3249  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  29.73 
 
 
379 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.384282  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5119  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  29.73 
 
 
379 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.830153  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1268  radical SAM family Fe-S protein  25 
 
 
312 aa  43.1  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.45793  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5162  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  29.73 
 
 
379 aa  43.1  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.426022 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>