34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0312 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0312  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 332 aa  689    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.139539 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0936  Radical SAM domain protein  83.73 
 
 		 343 aa  583  1.0000000000000001e-165  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.674566 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3338  Radical SAM domain protein  86.45 
 
 		 331 aa  580  1e-164  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1383  Radical SAM domain protein  84.34 
 
 		 331 aa  576  1.0000000000000001e-163  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632636  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1246  Radical SAM domain protein  80.66 
 
 		 346 aa  575  1.0000000000000001e-163  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0273  hypothetical protein  42.98 
 
 		 353 aa  286  2e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.888723  normal  0.245364 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0043  radical SAM family Fe-S protein  44.28 
 
 		 348 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0106  Radical SAM domain protein  42.86 
 
 		 343 aa  250  3e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0016  radical SAM domain-containing protein  41.96 
 
 		 344 aa  247  2e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.238462  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0784  radical SAM family protein  40.48 
 
 		 337 aa  245  9e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00132902  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1789  radical SAM domain-containing protein  42.86 
 
 		 341 aa  239  6.999999999999999e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0772  Radical SAM domain protein  39.12 
 
 		 353 aa  238  1e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00827536  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2062  radical SAM domain-containing protein  40.23 
 
 		 341 aa  234  1.0000000000000001e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.539759 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0117  hypothetical protein  37.05 
 
 		 334 aa  220  3e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0508  radical SAM domain-containing protein  33.9 
 
 		 373 aa  197  3e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1481  radical SAM domain-containing protein  33.8 
 
 		 371 aa  190  4e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0924558  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0983  radical SAM domain-containing protein  33.62 
 
 		 380 aa  187  2e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.156314  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0439  radical SAM domain-containing protein  33.52 
 
 		 371 aa  186  4e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0398  radical SAM domain-containing protein  33.62 
 
 		 371 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0698777  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1063  Radical SAM domain protein  36.36 
 
 		 350 aa  178  9e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.540032  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2157  radical SAM domain-containing protein  34.88 
 
 		 343 aa  171  2e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.350893  hitchhiker  0.000485535 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0464  radical SAM domain-containing protein  31.29 
 
 		 353 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0768  radical SAM domain-containing protein  33.21 
 
 		 300 aa  129  6e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00853946 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0964  radical SAM domain-containing protein  30.4 
 
 		 300 aa  124  3e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1901  radical SAM domain-containing protein  30.51 
 
 		 298 aa  122  8e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.844314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1414  radical SAM domain-containing protein  29.41 
 
 		 290 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1369  hypothetical protein  27.63 
 
 		 471 aa  108  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1025  Radical SAM domain protein  28.96 
 
 		 409 aa  96.3  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3410  Radical SAM domain protein  25.72 
 
 		 433 aa  79  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.736979  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00200  pyruvate formate-lyase activating-like enzyme  28.04 
 
 		 464 aa  65.1  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.158297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1387  radical SAM family protein  29.44 
 
 		 441 aa  58.5  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2925  Radical SAM domain protein  31.62 
 
 		 440 aa  55.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000258536  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05050  pyruvate formate-lyase activating-like enzyme  29.23 
 
 		 457 aa  52  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2369  Radical SAM domain protein  25.59 
 
 		 435 aa  49.3  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0697954  normal  0.318858 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>