More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_00050 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B5315  DNA gyrase subunit B  51.4 
 
 
640 aa  635    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.021698  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00060  DNA gyrase subunit B  62.92 
 
 
654 aa  839    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0159442  normal  0.243862 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0006  DNA gyrase, B subunit  73.49 
 
 
681 aa  983    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1702  DNA gyrase, B subunit  50.51 
 
 
654 aa  655    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.118209 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0002  DNA gyrase, B subunit  50.6 
 
 
638 aa  639    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0015  DNA gyrase, B subunit  51.37 
 
 
644 aa  673    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000401037  normal  0.862842 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2549  DNA gyrase, B subunit  54.4 
 
 
643 aa  666    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0041  DNA gyrase, B subunit  63.48 
 
 
691 aa  846    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0006  DNA gyrase subunit B  71.6 
 
 
685 aa  935    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0007  DNA gyrase, B subunit  50.81 
 
 
642 aa  656    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000235506  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0006  DNA gyrase, B subunit  53.91 
 
 
642 aa  687    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.965796  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1407  DNA gyrase, B subunit  50.21 
 
 
656 aa  639    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.68269  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1432  DNA gyrase subunit B  64.6 
 
 
696 aa  860    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0623  DNA gyrase subunit B  52.96 
 
 
650 aa  648    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00302751  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  54.29 
 
 
640 aa  719    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0005  DNA gyrase, B subunit  54.69 
 
 
640 aa  658    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0007  DNA gyrase, B subunit  63.52 
 
 
670 aa  815    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1048  DNA gyrase, B subunit  49.44 
 
 
665 aa  648    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.903378  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0005  DNA gyrase, B subunit  64.02 
 
 
685 aa  856    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  51.77 
 
 
650 aa  674    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000273734  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2717  DNA gyrase, B subunit  52.99 
 
 
649 aa  699    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3685  DNA gyrase, B subunit  51.61 
 
 
636 aa  680    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.50658  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00060  DNA gyrase subunit B  75.48 
 
 
683 aa  1006    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0005  DNA gyrase subunit B  54.16 
 
 
640 aa  667    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00215329  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0008  DNA gyrase, B subunit  59.16 
 
 
719 aa  804    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107754  hitchhiker  0.00597045 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00050  DNA gyrase subunit B  56.68 
 
 
645 aa  723    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0377504  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2254  DNA gyrase, B subunit  50.3 
 
 
646 aa  637    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0006  DNA gyrase subunit B  63.77 
 
 
661 aa  827    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.60604  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00050  DNA gyrase subunit B  100 
 
 
720 aa  1478    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0006  DNA gyrase, B subunit  54.16 
 
 
635 aa  662    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.98095 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0015  DNA gyrase, B subunit  52.05 
 
 
643 aa  664    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00473367  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  53.77 
 
 
633 aa  694    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0412  DNA gyrase subunit B  49.57 
 
 
651 aa  638    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000264952  decreased coverage  0.0001901 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0005  DNA gyrase, B subunit  53.62 
 
 
633 aa  672    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0016  DNA gyrase, B subunit  50.29 
 
 
649 aa  652    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00028541  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0010  DNA gyrase, B subunit  51.17 
 
 
644 aa  639    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000291276  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0005  DNA gyrase, B subunit  54.93 
 
 
636 aa  649    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0029  DNA gyrase, B subunit  51.18 
 
 
637 aa  649    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0087  DNA gyrase subunit B  51.67 
 
 
655 aa  637    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1547  DNA gyrase, B subunit  51.18 
 
 
635 aa  660    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00189026  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  55.24 
 
 
633 aa  713    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000695632  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0822  DNA gyrase subunit B  61.4 
 
 
675 aa  824    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.795596  normal  0.437658 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0006  DNA gyrase, B subunit  67.3 
 
 
649 aa  877    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0006  DNA gyrase subunit B  79.31 
 
 
695 aa  1099    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000061906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0007  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  64.61 
 
 
647 aa  831    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00100  DNA gyrase subunit B  68.48 
 
 
711 aa  880    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0006  DNA gyrase subunit B  61.8 
 
 
661 aa  833    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.925878  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00050  DNA gyrase subunit B  55.46 
 
 
648 aa  714    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000300089  hitchhiker  0.00265407 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  55.28 
 
 
644 aa  711    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  52.72 
 
 
634 aa  683    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0006  DNA gyrase, B subunit  65.79 
 
 
686 aa  873    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00629788 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0006  DNA gyrase subunit B  61.93 
 
 
679 aa  773    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.216936  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00060  DNA gyrase subunit B  64.81 
 
 
701 aa  863    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1044  DNA gyrase, B subunit  48.66 
 
 
675 aa  667    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  52.06 
 
 
641 aa  664    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0005  DNA gyrase, B subunit  71.94 
 
 
686 aa  1027    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.217672  normal  0.192252 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2729  DNA gyrase, B subunit  53.68 
 
 
641 aa  687    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.739794  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  54.8 
 
 
632 aa  711    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11740  DNA gyrase, B subunit  48.82 
 
 
637 aa  651    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00171708  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0006  DNA gyrase subunit B  61.4 
 
 
675 aa  823    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0596209 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0006  DNA gyrase, B subunit  54.92 
 
 
648 aa  711    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000466462  hitchhiker  0.000000932752 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10005  DNA gyrase subunit B  59.74 
 
 
714 aa  818    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0132  DNA gyrase, B subunit  52.56 
 
 
637 aa  691    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.312038  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4195  DNA gyrase, B subunit  50.51 
 
 
653 aa  645    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00698411 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0006  DNA gyrase subunit B  61.4 
 
 
675 aa  823    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  56.41 
 
 
644 aa  728    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18231  DNA gyrase subunit B  48.99 
 
 
655 aa  642    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.654486  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0005  DNA gyrase subunit B  54.68 
 
 
640 aa  677    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1413  DNA gyrase subunit B  49.85 
 
 
652 aa  635    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805897  normal  0.136461 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0006  DNA gyrase subunit B  54.88 
 
 
638 aa  661    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0015  DNA gyrase, B subunit  51.85 
 
 
644 aa  675    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  unclonable  0.00000155334 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0006  DNA gyrase subunit B  54.73 
 
 
638 aa  660    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00060  DNA gyrase, B subunit  53.43 
 
 
642 aa  669    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0006  DNA gyrase, B subunit  55.67 
 
 
638 aa  681    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.014329  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  51.62 
 
 
633 aa  695    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0984  DNA gyrase subunit B  54.23 
 
 
651 aa  679    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0005  DNA gyrase subunit B  51.55 
 
 
640 aa  639    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.204678  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0005  DNA gyrase subunit B  50.81 
 
 
652 aa  640    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.986745  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0005  DNA gyrase, B subunit  54.2 
 
 
642 aa  653    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0006  DNA gyrase, B subunit  63.66 
 
 
657 aa  849    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0640432  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0006  DNA gyrase subunit B  61.2 
 
 
652 aa  760    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0005  DNA gyrase, B subunit  52.55 
 
 
647 aa  670    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0130  DNA gyrase, B subunit  51.55 
 
 
636 aa  666    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.95821  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  54.28 
 
 
635 aa  693    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1480  DNA gyrase subunit B  53.88 
 
 
650 aa  667    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0006  DNA gyrase subunit B  77.67 
 
 
696 aa  1101    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248414  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  54.65 
 
 
628 aa  716    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0006  DNA gyrase, B subunit  51.17 
 
 
647 aa  673    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0995  DNA gyrase, B subunit  55 
 
 
645 aa  666    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0005  DNA gyrase, B subunit  52.27 
 
 
637 aa  635    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0005  DNA gyrase subunit B  65.49 
 
 
666 aa  867    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0007  DNA gyrase, B subunit  60.97 
 
 
648 aa  798    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000647413 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0403  DNA gyrase, B subunit  51.18 
 
 
659 aa  656    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0036  DNA gyrase subunit B  51.03 
 
 
643 aa  652    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0006  DNA gyrase subunit B  59.02 
 
 
711 aa  753    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.685499  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0005  DNA gyrase, B subunit  54.69 
 
 
640 aa  658    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0014  DNA gyrase subunit B  61.4 
 
 
675 aa  823    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.772791  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0006  DNA gyrase subunit B  59.71 
 
 
675 aa  806    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.313096 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0047  DNA gyrase, B subunit  50.81 
 
 
645 aa  642    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.109606 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0051  DNA gyrase, B subunit  53.94 
 
 
640 aa  685    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>