140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1213 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_1213  major facilitator transporter  100 
 
 		 398 aa  748    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.451147 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1909  major facilitator family transporter  40.44 
 
 		 406 aa  263  3e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0280  major facilitator transporter  43.09 
 
 		 395 aa  234  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3309  major facilitator transporter  40.85 
 
 		 395 aa  233  3e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6538  major facilitator transporter  40.86 
 
 		 404 aa  227  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.499845 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6744  major facilitator superfamily MFS_1  43.13 
 
 		 405 aa  222  8e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.713185 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4306  major facilitator superfamily transporter  38.1 
 
 		 413 aa  208  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0575629 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7234  major facilitator superfamily MFS_1  37.7 
 
 		 411 aa  193  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0445  major facilitator transporter  38.01 
 
 		 408 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1953  hypothetical protein  36.56 
 
 		 406 aa  188  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4318  hypothetical protein  37.94 
 
 		 409 aa  187  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0616031  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33770  hypothetical protein  36.19 
 
 		 408 aa  164  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.756882  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0856  hypothetical protein  30.84 
 
 		 412 aa  100  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0806  hypothetical protein  32.66 
 
 		 423 aa  97.8  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.314007 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1488  hypothetical protein  32.89 
 
 		 417 aa  92.8  9e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.861875 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6839  protein of unknown function DUF1228  29.68 
 
 		 408 aa  89.7  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0480421  normal  0.134894 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0821  protein of unknown function DUF1228  30.53 
 
 		 404 aa  89  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.303268  normal  0.29655 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1585  major facilitator transporter  26.11 
 
 		 403 aa  88.6  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4033  hypothetical protein  32.82 
 
 		 386 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.253788 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0805  hypothetical protein  33.21 
 
 		 409 aa  87.4  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.703384  normal  0.650566 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0279  major facilitator transporter  24.86 
 
 		 398 aa  87  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4560  major facilitator transporter  31.37 
 
 		 392 aa  86.7  6e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2507  hypothetical protein  29.23 
 
 		 443 aa  86.3  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.690501  normal  0.711571 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1041  hypothetical protein  32.62 
 
 		 428 aa  86.3  9e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4526  hypothetical protein  32.05 
 
 		 390 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0733  hypothetical protein  29.68 
 
 		 388 aa  85.5  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.162418  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04201  predicted inner membrane protein  31.37 
 
 		 392 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000208654  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3664  protein of unknown function DUF1228  31.37 
 
 		 392 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000330121  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3732  hypothetical protein  31.37 
 
 		 392 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000100771  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04164  hypothetical protein  31.37 
 
 		 392 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000012722  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0190  hypothetical protein  31 
 
 		 422 aa  84.7  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1449  hypothetical protein  31.08 
 
 		 393 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4773  transporter, major facilitator family  31.09 
 
 		 392 aa  83.6  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5539  hypothetical protein  28.24 
 
 		 402 aa  82.4  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.188295  normal  0.0555001 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0209  protein of unknown function DUF1228  30.63 
 
 		 422 aa  82  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0751  protein of unknown function DUF1228  29.97 
 
 		 404 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.361372 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4932  major facilitator transporter  31.09 
 
 		 392 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3608  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 416 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5344  major facilitator transporter  29.02 
 
 		 415 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0908766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3043  major facilitator transporter  29.37 
 
 		 394 aa  79  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.890919 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3596  major facilitator transporter  32.93 
 
 		 398 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0225  protein of unknown function DUF1228  31.8 
 
 		 395 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3912  major facilitator transporter  29.06 
 
 		 416 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8502  major facilitator transporter  30.1 
 
 		 388 aa  77.4  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.988555 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0489  major facilitator transporter  29.87 
 
 		 394 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5844  transporter, major facilitator family  31.2 
 
 		 392 aa  77  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.482212 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4877  major facilitator transporter  31.2 
 
 		 392 aa  77  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.429993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0484  hypothetical protein  26.81 
 
 		 400 aa  75.9  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5090  major facilitator transporter  29.31 
 
 		 416 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.778625 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3819  hypothetical protein  31.17 
 
 		 389 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0125429  normal  0.189828 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3514  major facilitator transporter  28.74 
 
 		 415 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.747582  normal  0.0415191 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0434  major facilitator transporter  29.68 
 
 		 408 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1384  hypothetical protein  30.91 
 
 		 390 aa  72.8  0.000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0951204  normal  0.2451 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0169  major facilitator superfamily MFS_1  28.43 
 
 		 397 aa  72.4  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1047  major facilitator transporter  29.28 
 
 		 405 aa  71.6  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4896  hypothetical protein  25 
 
 		 395 aa  71.2  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46180  hypothetical protein  31.65 
 
 		 397 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0113792 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0856  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 397 aa  68.6  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2754  hypothetical protein  27.65 
 
 		 382 aa  67.8  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0358  hypothetical protein  29.78 
 
 		 400 aa  67.4  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.23836  unclonable  0.0000000671481 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1291  hypothetical protein  27.96 
 
 		 408 aa  67  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1231  major facilitator superfamily tranporter  23.45 
 
 		 428 aa  66.6  0.0000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.475499 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1818  hypothetical protein  34.39 
 
 		 525 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.628043  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1455  major facilitator transporter  27.56 
 
 		 411 aa  65.9  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1425  hypothetical protein  34.39 
 
 		 238 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.128087  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0453  hypothetical protein  34.39 
 
 		 238 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1662  major facilitator superfamily permease  34.39 
 
 		 546 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.252981  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0707  hypothetical protein  34.39 
 
 		 238 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.445459  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4555  hypothetical protein  34.27 
 
 		 417 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0273  hypothetical protein  31.76 
 
 		 427 aa  65.5  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1639  major facilitator superfamily permease  32.09 
 
 		 537 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3928  hypothetical protein  32.75 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2649  major facilitator transporter  22.94 
 
 		 389 aa  64.7  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.189084 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2580  major facilitator transporter  22.54 
 
 		 398 aa  64.7  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0171602  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0339  major facilitator superfamily permease  28.63 
 
 		 399 aa  64.3  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2038  normal  0.0205502 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1559  hypothetical protein  26.7 
 
 		 385 aa  64.3  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2659  major facilitator transporter  35.46 
 
 		 540 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.600208  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1330  hypothetical protein  32.37 
 
 		 413 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2822  protein of unknown function DUF1228  28.02 
 
 		 421 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.503322  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0334  major facilitator superfamily MFS_1  31.42 
 
 		 395 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0235  sugar transporter  27.2 
 
 		 395 aa  62.4  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.105559  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0207  hypothetical protein  26.84 
 
 		 395 aa  62.4  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.49283  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2745  protein of unknown function DUF1228  28.85 
 
 		 399 aa  62  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7222  major facilitator superfamily MFS_1  29.92 
 
 		 415 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1160  major facilitator transporter  22.58 
 
 		 433 aa  61.2  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0149798 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2471  major facilitator transporter  26.9 
 
 		 383 aa  60.8  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2569  hypothetical protein  26.9 
 
 		 383 aa  60.5  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0386  hypothetical protein  28.24 
 
 		 359 aa  59.7  0.00000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4509  hypothetical protein  30 
 
 		 392 aa  59.7  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.530694 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1904  hypothetical protein  34.44 
 
 		 437 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.21993 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4772  transporter major facilitator family  29.01 
 
 		 394 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0929  hypothetical protein  32.77 
 
 		 420 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0697566  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1411  hypothetical protein  32.77 
 
 		 439 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4870  major facilitator family protein  29.3 
 
 		 394 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.444375 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0706  major facilitator family transporter  27.1 
 
 		 428 aa  58.9  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.233996  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4846  transporter, major facilitator family  29.3 
 
 		 394 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4918  major facilitator family transporter  29.3 
 
 		 394 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.844872  normal  0.222303 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0485  hypothetical protein  29.21 
 
 		 406 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.626037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2883  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 391 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000788215 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0072  hypothetical protein  27.15 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>