More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1734 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1734  tyrosyl-tRNA synthetase  100 
 
 
317 aa  657    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.446224  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2498  tyrosyl-tRNA synthetase  71.66 
 
 
315 aa  487  1e-137  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2455  tyrosyl-tRNA synthetase  68.37 
 
 
313 aa  459  9.999999999999999e-129  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2463  tyrosyl-tRNA synthetase  63.58 
 
 
313 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00510009  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2791  tyrosyl-tRNA synthetase  62.22 
 
 
316 aa  432  1e-120  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0439459  normal  0.169169 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1048  tyrosyl-tRNA synthetase  55.76 
 
 
325 aa  384  1e-106  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0795852  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1745  tyrosyl-tRNA synthetase  58.58 
 
 
317 aa  384  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.368347 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1463  tyrosyl-tRNA synthetase  58.58 
 
 
317 aa  358  8e-98  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.056145  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1410  tyrosyl-tRNA synthetase  51.97 
 
 
309 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0690  tyrosyl-tRNA synthetase  51.97 
 
 
311 aa  316  3e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.118103  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1266  tyrosyl-tRNA synthetase  50.99 
 
 
309 aa  314  9.999999999999999e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1276  tyrosyl-tRNA synthetase  51.48 
 
 
319 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2505  tyrosyl-tRNA synthetase  48.6 
 
 
328 aa  310  1e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.40451 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0194  tyrosyl-tRNA synthetase  51.62 
 
 
317 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0360156  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1080  tyrosyl-tRNA synthetase  50 
 
 
326 aa  303  2.0000000000000002e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2672  tyrosyl-tRNA synthetase  48.6 
 
 
331 aa  302  6.000000000000001e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2529  tyrosyl-tRNA synthetase  43.49 
 
 
345 aa  256  3e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0676026  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0042  tyrosyl-tRNA synthetase  39.94 
 
 
338 aa  234  1.0000000000000001e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2565  tyrosyl-tRNA synthetase  40.3 
 
 
345 aa  225  6e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.134305 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1058  tyrosyl-tRNA synthetase  39.63 
 
 
361 aa  221  9.999999999999999e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.07011  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2152  tyrosyl-tRNA synthetase  38.04 
 
 
352 aa  216  2.9999999999999998e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000510287  hitchhiker  0.000433253 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1777  tyrosyl-tRNA synthetase  36.39 
 
 
315 aa  199  3e-50  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74631  tyrosyl-tRNA synthetase  35.58 
 
 
404 aa  196  4.0000000000000005e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.158279 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2062  tyrosyl-tRNA synthetase  35.78 
 
 
372 aa  191  1e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2108  tyrosyl-tRNA synthetase  35.85 
 
 
314 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.253913  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0791  tyrosyl-tRNA synthetase  36.54 
 
 
319 aa  188  1e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0733  tyrosyl-tRNA synthetase  34.31 
 
 
372 aa  188  1e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1751  tyrosyl-tRNA synthetase  35.24 
 
 
348 aa  187  2e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0892  tyrosyl-tRNA synthetase  34.37 
 
 
336 aa  181  1e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01310  phosphoribosylamidoimidazole-succinocarboxamide synthase, putative  33.33 
 
 
824 aa  181  2e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2290  tyrosyl-tRNA synthetase  36.02 
 
 
372 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.161586 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0894  tyrosyl-tRNA synthetase  33.14 
 
 
374 aa  176  4e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.652771  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1932  tyrosyl-tRNA synthetase  35.48 
 
 
372 aa  171  1e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15823  predicted protein  34.59 
 
 
349 aa  161  1e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.263243  normal  0.149739 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00057  tyrosyl-tRNA synthetase, putative (Eurofung)  33.64 
 
 
397 aa  161  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.857416 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1659  tyrosyl-tRNA synthetase  34.6 
 
 
388 aa  154  2e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.661585  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1695  tyrosyl-tRNA synthetase  31.45 
 
 
405 aa  102  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00574764  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0576  tyrosyl-tRNA synthetase  26.36 
 
 
396 aa  98.2  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2269  tyrosyl-tRNA synthetase  29.63 
 
 
403 aa  97.1  4e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000414234 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0876  tyrosyl-tRNA synthetase  29.96 
 
 
400 aa  93.6  4e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  unclonable  0.00000000281136  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0425  tyrosyl-tRNA synthetase  24.37 
 
 
390 aa  92.8  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3822  tyrosyl-tRNA synthetase  26.75 
 
 
404 aa  90.9  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0697  tyrosyl-tRNA synthetase  26.65 
 
 
400 aa  91.3  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000250226  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2123  tyrosyl-tRNA synthetase  29.19 
 
 
413 aa  90.9  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45368  predicted protein  27.64 
 
 
791 aa  90.9  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.415443  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0438  tyrosyl-tRNA synthetase  28.98 
 
 
399 aa  89.4  7e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000725763  normal  0.0537593 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3050  tyrosyl-tRNA synthetase  31.12 
 
 
398 aa  89  9e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000057737  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0140  tyrosyl-tRNA synthetase  31.02 
 
 
393 aa  88.6  1e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.485656  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1919  tyrosyl-tRNA synthetase  28.28 
 
 
399 aa  89  1e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000583253  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1709  tyrosyl-tRNA synthetase  29.51 
 
 
413 aa  87.8  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000941896  normal  0.172619 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_541  tyrosyl-tRNA synthetase  26.89 
 
 
396 aa  88.2  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.32758  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08560  tyrosyl-tRNA synthetase  29.79 
 
 
399 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0100825  decreased coverage  0.000000000888942 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2033  tyrosyl-tRNA synthetase  28.4 
 
 
398 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0657081  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1161  tyrosyl-tRNA synthetase  29.25 
 
 
402 aa  87.4  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3373  tyrosyl-tRNA synthetase  28.51 
 
 
398 aa  87.4  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0809  tyrosyl-tRNA synthetase  28.52 
 
 
399 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.00020616  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1970  tyrosyl-tRNA synthetase  28.15 
 
 
403 aa  86.7  4e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.362658  unclonable  0.00000174204 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2221  tyrosyl-tRNA synthetase  29.17 
 
 
414 aa  87  4e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0601  tyrosyl-tRNA synthetase  28.46 
 
 
396 aa  86.7  5e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00761156  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0271  tyrosyl-tRNA synthetase  26.88 
 
 
399 aa  86.7  5e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653604  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0228  tyrosyl-tRNA synthetase  29.46 
 
 
395 aa  86.3  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3386  tyrosyl-tRNA synthetase  25.71 
 
 
400 aa  86.3  7e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.3078  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3069  tyrosyl-tRNA synthetase  26.05 
 
 
413 aa  85.9  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.498889  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2388  tyrosyl-tRNA synthetase  26.97 
 
 
406 aa  85.9  8e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262104  normal  0.700315 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1647  tyrosyl-tRNA synthetase  28.51 
 
 
407 aa  85.9  9e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00531566  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2405  tyrosyl-tRNA synthetase  26.48 
 
 
400 aa  85.9  9e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000233958  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1808  tyrosyl-tRNA synthetase  25.1 
 
 
405 aa  85.1  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1468  tyrosyl-tRNA synthetase  26.34 
 
 
400 aa  85.1  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1110  tyrosine--tRNA ligase  29.05 
 
 
438 aa  85.5  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000317082  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2197  tyrosyl-tRNA synthetase  27.71 
 
 
414 aa  85.1  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0747984  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0405  tyrosyl-tRNA synthetase  27.46 
 
 
401 aa  85.1  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  unclonable  0.000000345962  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0749  tyrosyl-tRNA synthetase  28.16 
 
 
397 aa  84  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000050083  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4565  tyrosyl-tRNA synthetase  27.66 
 
 
403 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000112799  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1368  tyrosyl-tRNA synthetase  30.33 
 
 
432 aa  84  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0107166  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2348  tyrosyl-tRNA synthetase  26.01 
 
 
413 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3291  tyrosyl-tRNA synthetase  24.78 
 
 
403 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3406  tyrosyl-tRNA synthetase  26.32 
 
 
413 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2527  tyrosyl-tRNA synthetase  26.01 
 
 
413 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1123  tyrosyl-tRNA synthetase  26.01 
 
 
413 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0261  tyrosyl-tRNA synthetase  26.01 
 
 
413 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.668867  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0457  tyrosyl-tRNA synthetase  27.8 
 
 
401 aa  82.8  0.000000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000997958  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1490  tyrosyl-tRNA synthetase  29.2 
 
 
404 aa  82.8  0.000000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0436  tyrosyl-tRNA synthetase  28.51 
 
 
399 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00177319  normal  0.0465602 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0609  tyrosyl-tRNA synthetase  27.16 
 
 
403 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.024569  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3412  tyrosyl-tRNA synthetase  26.32 
 
 
435 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.899029  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0469  tyrosyl-tRNA synthetase  28.51 
 
 
399 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.000000000169724  decreased coverage  0.000126716 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4767  tyrosyl-tRNA synthetase  27.56 
 
 
399 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000195797  normal  0.701844 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0706  tyrosyl-tRNA synthetase  26.1 
 
 
406 aa  82.4  0.000000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0476  tyrosyl-tRNA synthetase  27.65 
 
 
413 aa  82.4  0.000000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.209364  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2700  tyrosyl-tRNA synthetase  25.93 
 
 
454 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.62079 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0442  tyrosyl-tRNA synthetase  27.8 
 
 
401 aa  82.4  0.000000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000185644  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3371  tyrosyl-tRNA synthetase  26.2 
 
 
413 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0306351  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0761  tyrosyl-tRNA synthetase  26.77 
 
 
402 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000977983  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1240  tyrosyl-tRNA synthetase  26.23 
 
 
413 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0307967  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0970  tyrosyl-tRNA synthetase  25.57 
 
 
403 aa  82  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000274252  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2560  tyrosyl-tRNA synthetase  26.25 
 
 
432 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.181889  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0861  tyrosyl-tRNA synthetase  26.88 
 
 
405 aa  82  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1811  tyrosyl-tRNA synthetase  26.45 
 
 
412 aa  81.6  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000303004  normal  0.076359 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2686  tyrosyl-tRNA synthetase  27.09 
 
 
405 aa  81.6  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000803186  normal  0.260014 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0814  tyrosyl-tRNA synthetase  28.29 
 
 
405 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000175629  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>