207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5570 on replicon NC_008703
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008703  Mkms_5570  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 113 aa  228  3e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1646  MerR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 133 aa  105  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3662  transcriptional regulator, MerR family  44.79 
 
 		 146 aa  87.4  5e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4509  transcriptional regulator, MerR family  45.36 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125189 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2008  transcriptional regulator, MerR family  38.78 
 
 		 148 aa  80.5  0.000000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.505788  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  39.58 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  39.58 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3212  MerR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0356219  normal  0.122177 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4947  regulatory protein, MerR  40.62 
 
 		 129 aa  71.6  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.459947  decreased coverage  0.00286067 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13367  MerR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1777  MerR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 141 aa  67  0.00000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.784519 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2494  transcriptional regulator, MerR family  32.69 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3620  transcriptional regulator, MerR family  32.69 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4464  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4295  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4195  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3005  MerR family transcriptional regulator  33 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44472  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4528  transcriptional regulator, MerR family  34.65 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4237  MerR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0303  transcriptional regulator, MerR family  29.41 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00540997  normal  0.988288 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2675  MerR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.995117  normal  0.398735 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4536  transcriptional regulator, MerR family  40.54 
 
 		 146 aa  57  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228678  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0211  transcriptional regulator, MerR family protein  29.36 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2464  transcriptional regulator, MerR family  38.89 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0920  MerR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.320526  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02955  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  36 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0202543  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00354  putative Zn(II)-responsive transcriptional regulator, regulates Zn export (MerR family) protein  26.47 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.784451  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2868  MerR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000311414  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2059  transcriptional regulator, MerR family  33.71 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  34.88 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1934  MerR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.210113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0237  MerR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2718  transcriptional regulator, MerR family  29.47 
 
 		 150 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.654055  hitchhiker  0.0000347436 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4798  MerR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 136 aa  51.6  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3456  MerR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 149 aa  51.6  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4315  MerR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 130 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1484  MerR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 126 aa  50.8  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.944176  normal  0.368372 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3299  MerR family transcriptional regulator  32 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1783  putative transcriptional regulator MerR  36.99 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.45958  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  28.43 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2256  MerR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.773576 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1943  transcriptional regulator of MerR family protein  32.43 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.555422  normal  0.0105773 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1661  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.282422  normal  0.34807 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0168  putative transcriptional regulator MerR  36.99 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0271  MerR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4537  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  30.77 
 
 		 132 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1217  putative transcriptional regulator MerR  35.62 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4426  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3492  transcriptional regulator, MerR family protein  33.33 
 
 		 135 aa  48.9  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  37.35 
 
 		 252 aa  48.9  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0171  MerR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 134 aa  48.9  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1213  transcriptional regulator, MerR family  35.62 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.276419  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6344  Hg(II) resistance regulatory protein MerR  35.62 
 
 		 162 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000851109  unclonable  0.0000000537327 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2302  MerR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000169784  hitchhiker  0.000117286 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3389  MerR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.11439 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0083  putative transcriptional regulator MerR  35.62 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.68539 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2129  putative transcriptional regulator MerR  35.62 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3724  zinc-responsive transcriptional regulator  32.89 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.299789  hitchhiker  0.00578388 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2655  zinc-responsive transcriptional regulator  30.86 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1129  MerR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.560457  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0101  putative transcriptional regulator MerR  35.62 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.656805  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2773  MerR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6498  putative transcriptional regulator MerR  35.62 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0239269  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6171  putative transcriptional regulator MerR  35.62 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000597544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15480  putative transcriptional regulator MerR  35.62 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000744936  unclonable  4.377399999999999e-22 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4341  putative transcriptional regulator MerR  35.62 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2341  putative transcriptional regulator MerR  35.62 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3941  MerR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 128 aa  47.8  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.708141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2232  putative transcriptional regulator MerR  35.62 
 
 		 144 aa  47.4  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.620327  normal  0.3464 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0987  MerR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 160 aa  47.4  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.758767  hitchhiker  0.000750648 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0494  zinc-responsive transcriptional regulator  31.46 
 
 		 153 aa  47.8  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002186  zinc-responsive transcriptional regulator  32.35 
 
 		 132 aa  47.4  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00879391  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2149  transcriptional regulator, MerR family  31.08 
 
 		 132 aa  47.4  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.705718  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01412  Transcriptional regulator MerR  33.33 
 
 		 150 aa  47.4  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.536111  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3819  MerR family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 153 aa  47.4  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0221891 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0137  MerR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 145 aa  47  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2017  MerR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 140 aa  47  0.00009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2981  MerR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 134 aa  47  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4360  MerR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 134 aa  47  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02950  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  32.84 
 
 		 131 aa  47  0.00009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0289893  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1218  MerR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 134 aa  47  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4384  MerR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 134 aa  47  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1941  MerR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 140 aa  47  0.00009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0608  zinc-responsive transcriptional regulator  34.62 
 
 		 144 aa  46.2  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000357731  normal  0.723537 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0310  zinc-responsive transcriptional regulator  34.62 
 
 		 141 aa  46.2  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2710  MerR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3793  transcriptional regulator, MerR family  32.89 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2173  regulatory protein, MerR  36.11 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2323  putative transcriptional regulator MerR  34.21 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3563  transcriptional regulator, MerR family  33.65 
 
 		 157 aa  46.2  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4066  MerR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 152 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3888  zinc-responsive transcriptional regulator  34.62 
 
 		 141 aa  46.2  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00039361  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 252 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2170  transcriptional regulator, MerR family  34.21 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000807108 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2300  MerR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 134 aa  45.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.639917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2819  transcriptional regulator, MerR family protein  35.62 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3477  MerR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.137212  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>