More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1894 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1847  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
526 aa  1077    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.068039  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1894  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
526 aa  1077    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.567427  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1828  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
526 aa  1077    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1823  extracellular solute-binding protein  37.18 
 
 
520 aa  293  7e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.214721  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1870  extracellular solute-binding protein  37.18 
 
 
520 aa  293  7e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1804  extracellular solute-binding protein  37.18 
 
 
520 aa  293  7e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.12787  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2323  extracellular solute-binding protein family 5  33.85 
 
 
518 aa  254  2.0000000000000002e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.250322  normal  0.0484761 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0456  extracellular solute-binding protein family 5  29.26 
 
 
531 aa  208  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.15867 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2347  extracellular solute-binding protein  30.54 
 
 
516 aa  172  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33855  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2170  extracellular solute-binding protein  28.48 
 
 
516 aa  161  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.233404  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  29.61 
 
 
515 aa  160  4e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2099  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  28.27 
 
 
516 aa  159  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1572  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  28.27 
 
 
516 aa  158  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1686  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  28.27 
 
 
516 aa  158  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2160  extracellular solute-binding protein family 5  28.05 
 
 
516 aa  155  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0024579  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01445  D-ala-D-a la transporter subunit  28.05 
 
 
516 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  28.63 
 
 
520 aa  154  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  27.22 
 
 
526 aa  153  7e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1750  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  27.87 
 
 
516 aa  153  8e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.843018  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4121  extracellular solute-binding protein  27.13 
 
 
521 aa  150  5e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  29.21 
 
 
528 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1224  extracellular solute-binding protein family 5  28.63 
 
 
544 aa  149  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0137957 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2948  extracellular solute-binding protein family 5  28.86 
 
 
541 aa  145  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649638  normal  0.755867 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0542  extracellular solute-binding protein family 5  31.07 
 
 
537 aa  139  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.578152 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6076  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  29.27 
 
 
524 aa  138  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.814144  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  26.16 
 
 
532 aa  136  7.000000000000001e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  29.43 
 
 
534 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  29.89 
 
 
531 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0389  extracellular solute-binding protein  27.36 
 
 
527 aa  134  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000716553  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  26.91 
 
 
509 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  27.06 
 
 
508 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  27.97 
 
 
541 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2197  extracellular solute-binding protein family 5  30.13 
 
 
556 aa  130  5.0000000000000004e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2998  extracellular solute-binding protein family 5  28.74 
 
 
610 aa  130  6e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.869563  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  30.02 
 
 
528 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4912  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  28.67 
 
 
535 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03395  dipeptide transporter  28.67 
 
 
535 aa  127  5e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0168  4-phytase  28.67 
 
 
535 aa  127  5e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4037  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  28.67 
 
 
535 aa  127  5e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3863  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  28.67 
 
 
535 aa  127  5e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03346  hypothetical protein  28.67 
 
 
535 aa  127  5e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0171  4-phytase  28.67 
 
 
535 aa  127  5e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3744  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  28.67 
 
 
535 aa  127  5e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0028  extracellular solute-binding protein family 5  28.05 
 
 
520 aa  125  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0183012 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  26.87 
 
 
535 aa  125  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1494  extracellular solute-binding protein  33.22 
 
 
526 aa  124  3e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.69615 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3804  extracellular solute-binding protein  29.89 
 
 
509 aa  125  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00625229  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.46 
 
 
510 aa  124  6e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3666  extracellular solute-binding protein family 5  26.4 
 
 
563 aa  123  6e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2402  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  27.45 
 
 
538 aa  123  8e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0351  nickel ABC transporter, periplasmic nickel- binding protein  28.18 
 
 
532 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  27.49 
 
 
524 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01730  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.63 
 
 
560 aa  122  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4075  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  28.09 
 
 
535 aa  121  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0088  4-phytase  28.09 
 
 
535 aa  121  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.534677  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4056  periplasmic dipeptide transport protein  28.09 
 
 
535 aa  121  3.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  27.51 
 
 
512 aa  120  6e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0484  extracellular solute-binding protein  28.2 
 
 
523 aa  120  6e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.036637  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0804  nickel ABC transporter, nickel-binding protein, putative  24.56 
 
 
526 aa  119  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0754  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  24.56 
 
 
526 aa  119  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  28.87 
 
 
521 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2532  extracellular solute-binding protein family 5  27.71 
 
 
525 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  28.87 
 
 
521 aa  118  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.87 
 
 
521 aa  118  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  28.87 
 
 
521 aa  118  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  28.87 
 
 
521 aa  118  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3353  extracellular solute-binding protein  27.39 
 
 
520 aa  118  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587262  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 
539 aa  117  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5344  extracellular solute-binding protein family 5  27.9 
 
 
506 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.297716  normal  0.516905 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3028  twin-arginine translocation pathway signal  31.29 
 
 
562 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000374916  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0602  extracellular solute-binding protein  31.25 
 
 
545 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.497567  hitchhiker  0.000000266408 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  24.63 
 
 
510 aa  117  5e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1032  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  28.03 
 
 
544 aa  117  6e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000591223  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5411  extracellular solute-binding protein family 5  27.9 
 
 
506 aa  117  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.253312  decreased coverage  0.00154474 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4455  extracellular solute-binding protein  26.86 
 
 
509 aa  117  6.9999999999999995e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.661138  hitchhiker  0.000234808 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0206  extracellular solute-binding protein family 5  29.23 
 
 
561 aa  116  7.999999999999999e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.646254  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1288  extracellular solute-binding protein  31.46 
 
 
492 aa  117  7.999999999999999e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213997  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3906  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  27.84 
 
 
526 aa  116  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.938997 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3133  twin-arginine translocation pathway signal  29.76 
 
 
529 aa  116  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3842  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  27.84 
 
 
526 aa  116  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3950  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  27.84 
 
 
526 aa  116  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7613  nickel ABC transporter periplasmic nickel-binding protein  28.7 
 
 
526 aa  116  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0836  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  27.86 
 
 
520 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385717  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4203  extracellular solute-binding protein  27.13 
 
 
520 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237738  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4010  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  27.84 
 
 
526 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4163  extracellular solute-binding protein  27.13 
 
 
520 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0633493  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  25.29 
 
 
511 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  30.09 
 
 
508 aa  115  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18790  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  32.1 
 
 
540 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00232176  normal  0.206883 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3130  extracellular solute-binding protein family 5  27.42 
 
 
520 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777715  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1526  extracellular solute-binding protein  28.63 
 
 
544 aa  114  3e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4426  extracellular solute-binding protein  29.05 
 
 
520 aa  115  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3973  extracellular solute-binding protein family 5  29.09 
 
 
549 aa  114  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3828  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  27.58 
 
 
526 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.808847  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4225  extracellular solute-binding protein  27.3 
 
 
520 aa  114  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1571  4-phytase  29.68 
 
 
510 aa  114  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.624152  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  29.86 
 
 
544 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  25.14 
 
 
532 aa  114  5e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0821  periplasmic oligopeptide-binding  31.78 
 
 
533 aa  114  5e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19540  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.7 
 
 
567 aa  114  6e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.394832  normal  0.058637 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>