94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_2369 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0574  integrase catalytic subunit  100 
 
 
906 bp  1796    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.344122  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2243  integrase catalytic subunit  100 
 
 
906 bp  1796    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0365379  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2369    100 
 
 
3548 bp  7033    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182688  normal  0.675739 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1614  integrase catalytic subunit  100 
 
 
906 bp  1796    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.341708  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1068  integrase catalytic subunit  100 
 
 
906 bp  1796    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2371  integrase catalytic subunit  100 
 
 
906 bp  1796    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.576276 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1066    100 
 
 
2897 bp  2573    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.233561 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4633  integrase catalytic subunit  100 
 
 
906 bp  1796    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2862    100 
 
 
5864 bp  2573    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427752  normal  0.514681 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2863  integrase catalytic subunit  100 
 
 
906 bp  1796    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.147732  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2377  MMPL domain-containing protein  100 
 
 
2265 bp  3695    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4642  integrase catalytic subunit  100 
 
 
906 bp  1796    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0620  integrase catalytic subunit  100 
 
 
906 bp  1796    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3688  integrase catalytic subunit  100 
 
 
906 bp  1796    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70228  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4620  integrase catalytic subunit  100 
 
 
906 bp  1796    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2330  MMPL  100 
 
 
2247 bp  3695    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3700  integrase catalytic subunit  100 
 
 
906 bp  1796    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.484261  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5497  integrase catalytic subunit  100 
 
 
906 bp  1796    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.295724  normal  0.115233 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0619  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
291 bp  577  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0575  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
291 bp  577  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.725872  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4619  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
291 bp  577  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2864  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
291 bp  577  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0966509  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3689  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
291 bp  577  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.547507  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2370  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
291 bp  577  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.695527 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1615  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
291 bp  577  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.146541  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1067  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
291 bp  577  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.285311 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5496  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
291 bp  577  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189114  normal  0.30251 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4643  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
291 bp  577  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4634  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
291 bp  577  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.823189 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2242  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
291 bp  577  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.021715  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3699    100 
 
 
165 bp  327  9.999999999999999e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.885653  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2131  MMPL domain-containing protein  79.89 
 
 
2217 bp  216  3e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4293  MMPL domain-containing protein  81.9 
 
 
2256 bp  178  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707525  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4139  MMPL domain-containing protein  79.7 
 
 
2310 bp  176  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4064  MMPL  79.7 
 
 
2310 bp  176  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4573  MMPL domain-containing protein  83.6 
 
 
2337 bp  170  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.479628 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1197  hypothetical protein  79.33 
 
 
2184 bp  155  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  81.05 
 
 
3468 bp  119  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5139  MMPL domain-containing protein  84.05 
 
 
2232 bp  117  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0467  MMPL domain-containing protein  90.67 
 
 
2196 bp  93.7  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0196039  normal  0.101106 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2977  MMPL domain-containing protein  83.46 
 
 
2304 bp  89.7  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2948  MMPL domain-containing protein  83.46 
 
 
2304 bp  89.7  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24292  normal  0.448539 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2933  MMPL  83.46 
 
 
2304 bp  89.7  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.667476  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2842  drug exporter of the RND superfamily-like protein  93.22 
 
 
2223 bp  85.7  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  92.98 
 
 
2202 bp  81.8  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0676  MMPL domain protein  85.57 
 
 
2211 bp  81.8  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3690  hypothetical protein  100 
 
 
456 bp  77.8  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.91193  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1612  MMPL domain protein  95.74 
 
 
2313 bp  77.8  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5495  AraC/XylS family transcriptional regulator  100 
 
 
930 bp  75.8  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.143439  normal  0.457572 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3870  drug exporter of the RND superfamily-like protein  100 
 
 
2223 bp  75.8  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.507814  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  94 
 
 
2157 bp  75.8  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2864  MMPL domain-containing protein  92.31 
 
 
2148 bp  71.9  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.157135  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3767  MMPL domain protein  92.31 
 
 
2154 bp  71.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1244    88.89 
 
 
2171 bp  69.9  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2752  drug exporter of the RND superfamily-like protein  89.83 
 
 
2175 bp  69.9  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17640  predicted RND superfamily drug exporter  92 
 
 
2286 bp  67.9  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0285272 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  100 
 
 
2529 bp  67.9  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  89.47 
 
 
2175 bp  65.9  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1311  MMPL domain protein  97.22 
 
 
2322 bp  63.9  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.610628  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11170  transmembrane transport protein mmpL13b  91.67 
 
 
1503 bp  63.9  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.356849 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2652  MMPL domain protein  97.22 
 
 
2256 bp  63.9  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.139454  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  97.22 
 
 
2283 bp  63.9  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  91.67 
 
 
2199 bp  63.9  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1751  MMPL domain protein  88.14 
 
 
2217 bp  61.9  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1813  integral membrane protein  94.74 
 
 
2232 bp  60  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00875807  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1420  MMPL domain-containing protein  97.06 
 
 
2232 bp  60  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.94343  normal  0.0882917 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  94.59 
 
 
2232 bp  58  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0668  drug exporter of the RND superfamily-like protein  91.11 
 
 
2391 bp  58  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2658  MMPL domain protein  87.72 
 
 
2526 bp  58  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4060  hypothetical protein  91.11 
 
 
2352 bp  58  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5130    88.46 
 
 
2379 bp  56  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  94.29 
 
 
2940 bp  54  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5740  MMPL domain-containing protein  92.31 
 
 
2712 bp  54  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.670793 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  88.24 
 
 
2181 bp  54  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  89.36 
 
 
2172 bp  54  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  94.29 
 
 
2952 bp  54  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  94.29 
 
 
2952 bp  54  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11169  transmembrane transport protein mmpL13a  85.07 
 
 
1086 bp  54  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.266542 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0656  MMPL domain-containing protein  89.36 
 
 
2391 bp  54  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177102  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  94.12 
 
 
2172 bp  52  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  94.12 
 
 
2277 bp  52  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  100 
 
 
2907 bp  52  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1195  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  94.12 
 
 
2232 bp  52  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490179  hitchhiker  0.0010558 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8829  drug exporter of the RND superfamily-like protein  94.12 
 
 
3927 bp  52  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00314237  decreased coverage  0.000466085 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  94.12 
 
 
2346 bp  52  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  94.12 
 
 
2253 bp  52  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  94.12 
 
 
2259 bp  52  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2790  hypothetical protein  94.12 
 
 
2190 bp  52  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00546434  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  90.24 
 
 
2154 bp  50.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  93.94 
 
 
2499 bp  50.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2536  putative membrane transport protein  93.94 
 
 
2424 bp  50.1  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1037  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  100 
 
 
1698 bp  50.1  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1250  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 
1665 bp  50.1  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0409478  normal  0.0986355 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0955  integral membrane protein  96.55 
 
 
2130 bp  50.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778456  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>