More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_3228 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_3228  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 
158 aa  313  4e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0152  signal transduction protein  54.72 
 
 
160 aa  169  1e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0069  signal transduction protein  52.56 
 
 
158 aa  167  6e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  47.13 
 
 
158 aa  159  1e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2651  putative signal transduction protein with CBS domains  49.67 
 
 
161 aa  151  4e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2002  hypothetical protein  45.81 
 
 
154 aa  142  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.584772  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1341  CBS domain-containing protein  42.86 
 
 
154 aa  133  8e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1281  signal transduction protein  37.5 
 
 
153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.366949  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1395  signal transduction protein  37.5 
 
 
153 aa  110  8.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0675  signal transduction protein  38.16 
 
 
153 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.302021  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1289  signal transduction protein  38.82 
 
 
153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  35.57 
 
 
155 aa  107  5e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1136  signal transduction protein  34.87 
 
 
214 aa  76.6  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1887  CBS domain containing membrane protein  30.63 
 
 
153 aa  76.3  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  30 
 
 
154 aa  74.7  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  30.63 
 
 
153 aa  73.6  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  32.89 
 
 
209 aa  72.8  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4751  CBS domain containing membrane protein  35.29 
 
 
154 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142923  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  29.56 
 
 
150 aa  71.2  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1585  CBS domain containing protein  32.03 
 
 
217 aa  70.9  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  30.57 
 
 
161 aa  70.9  0.000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2208  CBS domain-containing protein  31.58 
 
 
221 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000650498  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  35.76 
 
 
208 aa  69.7  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2202  putative signal transduction protein with CBS domains  28.1 
 
 
236 aa  68.9  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0486  signal transduction protein  31.33 
 
 
258 aa  68.2  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2551  signal transduction protein  32.24 
 
 
220 aa  68.2  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  31.41 
 
 
149 aa  68.2  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  32.9 
 
 
153 aa  67.8  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0797  CBS domain protein  28.57 
 
 
139 aa  67.4  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.65672e-35 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  31.33 
 
 
215 aa  67.4  0.00000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1256  signal-transduction protein  33.78 
 
 
210 aa  67  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2521  signal transduction protein  27.5 
 
 
161 aa  67  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1851  CBS domain-containing protein  29.3 
 
 
120 aa  67  0.00000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  30.92 
 
 
232 aa  67  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0631  CBS domain-containing protein  28.57 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000812315  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  30.52 
 
 
152 aa  67  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  29.94 
 
 
247 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  31.33 
 
 
215 aa  66.6  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  35.53 
 
 
210 aa  67  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0872  CBS domain protein  28.57 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  30.34 
 
 
250 aa  65.9  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0631  CBS domain-containing protein  28.57 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.480891  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  30.38 
 
 
147 aa  66.2  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2021  CBS domain containing membrane protein  27.95 
 
 
164 aa  66.2  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0714  signal transduction protein  31.37 
 
 
211 aa  65.9  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135984  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0566  CBS domain-containing protein  33.56 
 
 
279 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.565144  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2667  CBS domain containing protein  27.84 
 
 
313 aa  65.5  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.13324  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  29.94 
 
 
246 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  29.22 
 
 
152 aa  65.1  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0640  CBS domain-containing protein  30 
 
 
150 aa  65.1  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0687  CBS domain-containing protein  27.21 
 
 
139 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.740174  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0720  CBS domain-containing protein  27.21 
 
 
139 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000162258  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  28.75 
 
 
149 aa  64.7  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  29.14 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0791  CBS domain-containing protein  27.89 
 
 
139 aa  64.3  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244605  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  28.39 
 
 
249 aa  64.3  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4003  CBS domain-containing protein  32.21 
 
 
140 aa  63.9  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.360398 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  28.03 
 
 
141 aa  63.9  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  33.12 
 
 
216 aa  63.9  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  27.92 
 
 
150 aa  63.9  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  29.75 
 
 
142 aa  63.2  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0778  signal transduction protein  30 
 
 
140 aa  63.5  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0404956 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4559  CBS domain protein  27.21 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024778  normal  0.1618 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  28.93 
 
 
598 aa  62.8  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0776  CBS domain protein  27.21 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00143526  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2666  putative signal transduction protein with CBS domains  25.33 
 
 
252 aa  62.4  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0113422  normal  0.552797 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2906  signal transduction protein  27.15 
 
 
291 aa  62.4  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1421  CBS domain-containing protein  31.33 
 
 
279 aa  62.8  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.351959  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0568  signal-transduction protein  31.79 
 
 
133 aa  62.4  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.706815 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2707  signal-transduction protein  27.46 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  28.67 
 
 
217 aa  62.4  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  29.53 
 
 
141 aa  62  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  29.49 
 
 
153 aa  62  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  29.22 
 
 
152 aa  62  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  24.16 
 
 
688 aa  62.4  0.000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  32.89 
 
 
155 aa  61.6  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  28.85 
 
 
152 aa  61.6  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1182  putative transcriptional regulator, XRE family  29.53 
 
 
147 aa  61.6  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000705125  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0607  signal-transduction protein  24.53 
 
 
144 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.150713  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0636  signal-transduction protein  25.85 
 
 
139 aa  61.2  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  26.32 
 
 
149 aa  61.2  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2008  CBS  28.48 
 
 
330 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  25.64 
 
 
230 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  29.61 
 
 
219 aa  61.2  0.000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1383  signal transduction protein  30.77 
 
 
282 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2569  metal dependent phosphohydrolase  29.56 
 
 
171 aa  61.2  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  25 
 
 
148 aa  60.8  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  32.47 
 
 
216 aa  60.8  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0937  putative signal transduction protein with CBS domains  33.55 
 
 
214 aa  60.8  0.000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000079186  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0960  CBS domain-containing protein  25 
 
 
153 aa  60.8  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0461508  hitchhiker  0.00174257 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  24.83 
 
 
688 aa  60.8  0.000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1013  CBS domain-containing protein  29.61 
 
 
216 aa  60.5  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2229  CBS domain-containing protein  24.62 
 
 
313 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0978  hypothetical protein  30 
 
 
364 aa  59.7  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  26.49 
 
 
426 aa  60.1  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2351  CBS domain-containing protein  27.81 
 
 
283 aa  60.1  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000984272  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2791  hypothetical protein  26.85 
 
 
141 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.402578  normal  0.193338 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0498  CBS domain-containing protein  29.33 
 
 
279 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.235797  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0339  CBS domain-containing protein  30 
 
 
279 aa  59.7  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.436853  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  28.12 
 
 
153 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>