112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2705 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2705  DNA polymerase, beta-like region  100 
 
 		 102 aa  201  3e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0258  DNA polymerase beta domain protein region  51.04 
 
 		 97 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1228  DNA polymerase beta subunit  43.33 
 
 		 97 aa  81.3  0.000000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3299  DNA polymerase beta domain protein region  38.95 
 
 		 96 aa  79.3  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000315403 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0274  DNA polymerase beta subunit  37.89 
 
 		 96 aa  77.4  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122937  unclonable  0.00000800451 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3457  DNA polymerase beta subunit  39.53 
 
 		 98 aa  75.5  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288007 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4907  DNA polymerase beta domain protein region  43.96 
 
 		 97 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1203  DNA polymerase beta domain protein region  43.02 
 
 		 102 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2072  DNA polymerase beta domain protein region  49.43 
 
 		 97 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0110003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1790  DNA polymerase beta domain protein region  45.56 
 
 		 114 aa  73.9  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2969  DNA polymerase beta domain protein region  41.67 
 
 		 97 aa  72.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3140  DNA polymerase beta domain protein region  41.67 
 
 		 97 aa  72.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.440273 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2366  DNA polymerase beta subunit  41.11 
 
 		 115 aa  72  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.878119  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5352  DNA polymerase, beta-like region  39.58 
 
 		 98 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1298  hypothetical protein  43.62 
 
 		 97 aa  68.9  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5548  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 93 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3146  DNA polymerase beta domain protein region  40.23 
 
 		 98 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.94354 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50230  DNA polymerase, beta-like region-containing protein  36.46 
 
 		 96 aa  66.6  0.00000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1789  DNA polymerase beta domain protein region  38.64 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3618  DNA polymerase beta domain protein region  34.38 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1203  DNA polymerase, beta-like region  35.11 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.229672  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3117  DNA polymerase beta subunit  40.48 
 
 		 110 aa  63.5  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0444  nucleotidyltransferase  37.33 
 
 		 98 aa  62.8  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2672  DNA polymerase, beta-like region  34.04 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.836328  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1766  DNA polymerase beta domain protein region  36.27 
 
 		 100 aa  61.2  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.669718  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2757  nucleotidyltransferase family protein  37 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1104  DNA polymerase beta domain protein region  34.52 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0953254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0854  DNA polymerase beta subunit  32.22 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1295  DNA polymerase beta domain protein region  43.21 
 
 		 99 aa  56.6  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.599396  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3948  DNA polymerase beta subunit  30.85 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1221  nucleotidyltransferase domain-containing protein  44.44 
 
 		 64 aa  54.7  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.795397  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2452  DNA polymerase, beta-like region  35.87 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000219498  normal  0.98292 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0900  DNA polymerase beta subunit  32.98 
 
 		 103 aa  54.3  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  32.18 
 
 		 169 aa  54.3  0.0000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1694  DNA polymerase beta subunit  36.56 
 
 		 97 aa  53.5  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.366424  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3786  DNA polymerase beta domain protein region  43.48 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.123289  normal  0.700807 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2288  DNA polymerase, beta-like region  39.19 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1527  transcriptional regulator, XRE family  34.48 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0369  DNA polymerase beta subunit  36.23 
 
 		 105 aa  52.8  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.832865  normal  0.194305 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1948  DNA polymerase beta domain protein region  33.7 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.506279 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1959  DNA polymerase beta domain protein region  33.7 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.332639 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0548  DNA polymerase beta domain protein region  34.31 
 
 		 102 aa  52  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1733  DNA polymerase beta domain protein region  43.59 
 
 		 98 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.3433 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0626  DNA polymerase beta subunit  35.38 
 
 		 102 aa  50.8  0.000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.717752  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0357  DNA polymerase beta subunit  32.14 
 
 		 101 aa  50.8  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0316504 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1803  DNA polymerase beta domain protein region  35.79 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1113  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 109 aa  50.4  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3743  DNA polymerase beta domain protein region  37.37 
 
 		 98 aa  50.8  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0845  DNA polymerase beta subunit  30.11 
 
 		 96 aa  50.4  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1148  DNA polymerase beta subunit  34.69 
 
 		 115 aa  50.1  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1164  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 113 aa  50.4  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0627  DNA polymerase beta subunit  37.04 
 
 		 101 aa  50.1  0.000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0829  DNA polymerase beta subunit  31.65 
 
 		 98 aa  50.4  0.000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.141069  normal  0.412533 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0052  DNA polymerase beta subunit  37.04 
 
 		 101 aa  50.1  0.000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0550488  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0638  nucleotidyltransferase  36.96 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3557  DNA polymerase beta subunit  32.26 
 
 		 254 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0946906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4395  hypothetical protein  47.92 
 
 		 121 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0622266 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0053  DNA polymerase beta subunit  35.38 
 
 		 102 aa  50.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0582464  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1851  DNA polymerase beta domain protein region  29.35 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1877  DNA polymerase beta domain protein region  29.35 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19940  predicted nucleotidyltransferase  32.61 
 
 		 100 aa  49.7  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0104125 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1883  DNA polymerase, beta-like region  31.33 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1102  hypothetical protein  32.1 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.836571  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0506  DNA polymerase beta subunit  34.57 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1784  nucleotidyltransferase  33 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0697  DNA polymerase beta subunit  30.12 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.424952 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2148  DNA polymerase beta domain protein region  38.03 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0296  DNA polymerase beta domain protein region  32.63 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.499305 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1342  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1075  DNA polymerase beta domain protein region  32.65 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.796392  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0929  DNA polymerase beta domain protein region  27.59 
 
 		 96 aa  47.4  0.00006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.887181  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4165  DNA polymerase beta subunit  36.62 
 
 		 109 aa  47.4  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0157  DNA polymerase beta domain protein region  32 
 
 		 109 aa  47  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0867  DNA polymerase beta domain protein region  32.1 
 
 		 96 aa  47.4  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2036  DNA polymerase beta domain protein region  28.26 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18823  normal  0.524072 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0152  DNA polymerase  32.14 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1408  DNA polymerase beta subunit  37.68 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0374  DNA polymerase beta subunit  32.93 
 
 		 108 aa  46.2  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.509035  normal  0.373075 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3147  DNA polymerase beta domain protein region  32.84 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.949814 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0202  DNA polymerase beta domain protein region  29.07 
 
 		 131 aa  45.4  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.368731 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2532  DNA polymerase beta subunit  32.89 
 
 		 104 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0127103 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0949  DNA polymerase beta subunit  38.75 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.878884  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0348  DNA polymerase beta subunit  34.18 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1188  DNA polymerase beta domain protein region  36.62 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5818  DNA polymerase beta domain protein region  32 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1652  ISSo9, nucleotidyltransferase domain-containing protein  31.88 
 
 		 69 aa  45.1  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.175672 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10090  predicted nucleotidyltransferase  30.93 
 
 		 106 aa  44.3  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2529  DNA polymerase beta subunit  28.92 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1512  ISSo9, nucleotidyltransferase domain-containing protein  27.78 
 
 		 96 aa  44.3  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0340826  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3260  transcriptional regulator, XRE family  35.29 
 
 		 152 aa  43.9  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0015  hypothetical protein  33.33 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0548  nucleotidyltransferase family protein  33.8 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0927  hypothetical protein  29 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.430224  normal  0.445553 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0409  DNA polymerase beta subunit  33.77 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2453  DNA polymerase beta subunit  31.33 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00090311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0088  DNA polymerase beta subunit  34.12 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0340868 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4370  DNA polymerase beta domain protein region  27.93 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1345  DNA polymerase, beta-like region  51.35 
 
 		 55 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.230797 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3538  DNA polymerase beta subunit  30.38 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.114192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1812  DNA polymerase beta subunit  33.8 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.337517  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>