More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2586 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2586  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  100 
 
 
522 aa  1033    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0955  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  64.11 
 
 
523 aa  658    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00424687  normal  0.153051 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0671  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  59.46 
 
 
525 aa  620  1e-176  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3666  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  34.43 
 
 
492 aa  249  1e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.752681  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3953  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  34.11 
 
 
492 aa  238  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3284  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  34.1 
 
 
492 aa  237  4e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.141551  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2191  hydrogenase 4 subunit B  33.84 
 
 
673 aa  231  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.660892 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4834  NADH dehydrogenase (quinone)  31.98 
 
 
585 aa  230  4e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0135  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.48 
 
 
513 aa  224  3e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.501467  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2093  NADH dehydrogenase (quinone)  35.25 
 
 
501 aa  214  3.9999999999999995e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.156897  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2967  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.87 
 
 
501 aa  213  5.999999999999999e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.37012 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0107  NADH dehydrogenase (quinone)  30.21 
 
 
500 aa  209  7e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000249004 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2858  NADH dehydrogenase (quinone)  31.72 
 
 
504 aa  206  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.356875  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0380  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.97 
 
 
472 aa  204  3e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000595488  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2525  NADH dehydrogenase (quinone)  32.01 
 
 
505 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4575  hydrogenase 4 subunit B  31.52 
 
 
671 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0588  NADH dehydrogenase (quinone)  33.8 
 
 
609 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2161  NADH dehydrogenase (quinone)  32.05 
 
 
501 aa  200  6e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0751  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.6 
 
 
501 aa  197  3e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00659406  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0890  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.12 
 
 
507 aa  197  4.0000000000000005e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.50733  normal  0.143167 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1194  hydrogenase 4 subunit B  32.66 
 
 
672 aa  197  5.000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1187  NADH dehydrogenase (quinone)  32.43 
 
 
672 aa  196  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2629  hydrogenase 4 subunit B  32.33 
 
 
672 aa  194  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2460  NADH dehydrogenase (quinone)  31.86 
 
 
683 aa  194  3e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1771  NADH dehydrogenase (quinone)  31.29 
 
 
500 aa  194  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3704  hydrogenase 4 subunit B  32.49 
 
 
672 aa  194  4e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.726938  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2456  NADH dehydrogenase (quinone)  32.86 
 
 
662 aa  194  4e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0192367  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02374  NADH dehydrogenase subunit N  32.55 
 
 
672 aa  193  7e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02336  hypothetical protein  32.55 
 
 
672 aa  193  7e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1123  putative NADH dehydrogenase  30.63 
 
 
498 aa  192  1e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0103051  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0509  NADH dehydrogenase (quinone)  28.25 
 
 
748 aa  191  2.9999999999999997e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000352419  hitchhiker  0.0000000405513 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1741  NADH dehydrogenase subunit M  31.92 
 
 
604 aa  189  1e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.56797  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0315  NADH dehydrogenase (quinone)  34.12 
 
 
674 aa  189  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.39787  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0070  NADH dehydrogenase (quinone)  33.18 
 
 
667 aa  189  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1163  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.22 
 
 
790 aa  189  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2099  NADH dehydrogenase (quinone)  30.77 
 
 
498 aa  188  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.805314  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1136  NADH dehydrogenase (quinone)  30.61 
 
 
476 aa  187  5e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1127  hydrogenase membrane subunit  32.1 
 
 
649 aa  186  7e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0224903  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1822  hydrogenase membrane subunit  31.36 
 
 
643 aa  186  7e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0165692  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1065  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.94 
 
 
666 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.82932e-25 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000416  Na(+) H(+) antiporter subunit D  28.68 
 
 
498 aa  185  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0703  NADH dehydrogenase (quinone)  29.32 
 
 
662 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.20305  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00940  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  30.68 
 
 
672 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3692  NADH dehydrogenase (quinone)  30.59 
 
 
500 aa  183  6e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1781  hydrogenase subunit F  35.51 
 
 
482 aa  183  8.000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2032  NADH dehydrogenase (quinone)  31.93 
 
 
504 aa  183  8.000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0508  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  31.08 
 
 
499 aa  183  8.000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000163951  hitchhiker  0.000000287422 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1606  NADH dehydrogenase subunit M  29.62 
 
 
626 aa  182  1e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0875  hydrogenase subunit F  35.32 
 
 
482 aa  182  1e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00115046 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1285  hydrogenase 4 subunit B  29.39 
 
 
673 aa  181  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.488809  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1575  hydrogenase membrane subunit  29.18 
 
 
617 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3197  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.89 
 
 
666 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0731  quinone dependent NADH dehydrogenase  32.24 
 
 
511 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.156813  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0320  NADH dehydrogenase (quinone)  31.97 
 
 
531 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1042  hydrogenase subunit F  34.86 
 
 
482 aa  180  4.999999999999999e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3221  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.63 
 
 
500 aa  180  4.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0379  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  28.87 
 
 
605 aa  180  5.999999999999999e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.00000000000619684  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3194  NADH dehydrogenase (quinone)  31.31 
 
 
1264 aa  179  8e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.466435 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4066  NADH dehydrogenase (quinone)  31.65 
 
 
669 aa  179  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0619804  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1321  hydrogenase membrane subunit  29.82 
 
 
644 aa  179  1e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2223  NADH dehydrogenase (quinone)  30.89 
 
 
496 aa  178  2e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0589  NADH dehydrogenase (quinone)  30.47 
 
 
473 aa  176  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0892  NADH dehydrogenase (quinone)  31.5 
 
 
669 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2708  hydrogenase 4 subunit B  29.35 
 
 
679 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1453  hydrogenase subunit, HycC-like protein  29.07 
 
 
644 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1635  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  34.11 
 
 
502 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.193581  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12060  NADH dehydrogenase I subunit L  29.78 
 
 
506 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000252399  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0734  NAD-dependent dehydrogenase subunit  30.72 
 
 
668 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0393018  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0937  hydrogenase subunit F  31.57 
 
 
482 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0097  NADH dehydrogenase (quinone)  29.36 
 
 
505 aa  174  2.9999999999999996e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.988192  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1420  NADH dehydrogenase (quinone)  33 
 
 
1265 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3531  NADH dehydrogenase (quinone)  33.5 
 
 
610 aa  173  9e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2616  NADH dehydrogenase (quinone)  31.93 
 
 
577 aa  172  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0587  NADH dehydrogenase (quinone)  28.29 
 
 
480 aa  172  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0188  NADH dehydrogenase (quinone)  31.94 
 
 
737 aa  172  1e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0077  NADH dehydrogenase (quinone)  30.11 
 
 
500 aa  172  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3781  NADH dehydrogenase (quinone)  32.9 
 
 
654 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0217094  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2712  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.36 
 
 
574 aa  172  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2925  NADH dehydrogenase (quinone)  32.07 
 
 
505 aa  171  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0483803  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0164  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  28.44 
 
 
538 aa  171  4e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1791  ATP-binding protein  30.68 
 
 
655 aa  171  4e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0608774  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1673  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  29.07 
 
 
604 aa  170  6e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1217  NADH dehydrogenase subunit M  29.05 
 
 
614 aa  170  6e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2286  NADH dehydrogenase (quinone)  30.32 
 
 
437 aa  169  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2874  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.34 
 
 
799 aa  168  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000289402  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0375  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.24 
 
 
669 aa  168  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.044448  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3196  formate hydrogenlyase subunit 3  30.07 
 
 
608 aa  168  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0742  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  28.95 
 
 
538 aa  168  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.778742 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4506  NADH dehydrogenase (quinone)  29.69 
 
 
1265 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.105233 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1691  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  30.97 
 
 
688 aa  168  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000143823  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3530  NADH dehydrogenase (quinone)  29.05 
 
 
470 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5212  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  29.5 
 
 
523 aa  167  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0000590255  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0969  NADH dehydrogenase (quinone)  31.38 
 
 
1253 aa  167  5e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0218073 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0132  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.09 
 
 
788 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1914  L-alanyl-D-glutamate peptidase  29.36 
 
 
655 aa  167  5.9999999999999996e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3658  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.58 
 
 
562 aa  166  9e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0538  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.1 
 
 
801 aa  165  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0574  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.62 
 
 
535 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0132  hydrogenase 4 membrane subunit  28.34 
 
 
650 aa  166  1.0000000000000001e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.167866  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1772  Na(+)/H(+) antiporter subunit D  28 
 
 
499 aa  166  1.0000000000000001e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>