More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0953 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0953  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 
135 aa  274  3e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.83954  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2126  response regulator receiver protein  53.54 
 
 
128 aa  137  4.999999999999999e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.438867  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1038  response regulator receiver protein  48.33 
 
 
131 aa  123  7e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3223  response regulator receiver protein  48.33 
 
 
131 aa  121  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.186882 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0159  response regulator receiver domain-containing protein  50.89 
 
 
128 aa  121  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0749254  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0886  response regulator receiver domain-containing protein  48.62 
 
 
137 aa  118  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384988  normal  0.153587 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2827  response regulator receiver domain-containing protein  44.17 
 
 
136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107479 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2015  two component hybrid sensor response regulator  33.33 
 
 
391 aa  74.3  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2445  response regulator receiver  37.19 
 
 
125 aa  72.8  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.942791  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1003  nitrogen regulation protein NR(I)  31.86 
 
 
481 aa  72  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.158383  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 
236 aa  72  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1220  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.61 
 
 
233 aa  72  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00991602 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2217  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.06 
 
 
276 aa  71.2  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00294817  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0916  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  30.77 
 
 
480 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0932  sensor histidine kinase/response regulator  32.5 
 
 
896 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0996  sensor histidine kinase/response regulator  32.5 
 
 
896 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3942  response regulator receiver protein  33.59 
 
 
163 aa  71.2  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1901  response regulator receiver protein  33.04 
 
 
125 aa  70.5  0.000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1090  sensor histidine kinase/response regulator  32.5 
 
 
896 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.358618  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1377  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30.36 
 
 
462 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.244526  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1357  response regulator receiver protein  34.51 
 
 
144 aa  70.1  0.000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0900  sensor histidine kinase  31.67 
 
 
896 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4266  sensor histidine kinase/response regulator  31.67 
 
 
896 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000252034 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2811  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 
498 aa  70.1  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.782124  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3996  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.38 
 
 
1159 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.374046  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0325  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.17 
 
 
2037 aa  68.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3210  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.86 
 
 
337 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.32327  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2522  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.51 
 
 
226 aa  68.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0917  sensor histidine kinase  31.67 
 
 
896 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5109  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.23 
 
 
2099 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0669819 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1163  sensor histidine kinase/response regulator  31.67 
 
 
896 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4779  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.71 
 
 
1195 aa  68.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.133558  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0907  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.67 
 
 
896 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4458  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.4 
 
 
442 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.741172  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2160  two component signal transduction response regulator  35.78 
 
 
451 aa  68.9  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000278347  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2563  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  30.09 
 
 
480 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247378 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1072  sensor histidine kinase/response regulator  31.67 
 
 
896 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.88167e-43 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1847  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.36 
 
 
459 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.122843  normal  0.436579 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2076  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.63 
 
 
2107 aa  68.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3831  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.62 
 
 
1177 aa  68.6  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195944  normal  0.0220401 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  34.19 
 
 
215 aa  68.6  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.115662  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 
228 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5393  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.23 
 
 
2099 aa  68.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0480029  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  32.31 
 
 
1207 aa  68.2  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1463  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.06 
 
 
364 aa  68.2  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.404054 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0707  two component transcriptional regulator  33.63 
 
 
227 aa  68.2  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.598521  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4602  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.04 
 
 
226 aa  67.4  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.52 
 
 
1954 aa  67.4  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1037  sensor histidine kinase/response regulator  30.83 
 
 
896 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1662  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 
396 aa  67  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72720  putative two-component response regulator  33.04 
 
 
447 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.269979  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0605  adenylate/guanylate cyclase  28.57 
 
 
355 aa  67  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.657653  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.84 
 
 
224 aa  67  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3296  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  29.31 
 
 
486 aa  67  0.00000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.533211  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3770  response regulator receiver protein  30 
 
 
391 aa  66.6  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5309  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 
246 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383621  normal  0.611504 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0547  two component transcriptional regulator  35.4 
 
 
224 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2786  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30.09 
 
 
480 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.543097  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1114  response regulator receiver modulated serine phosphatase  31.67 
 
 
391 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0653  two-component response regulator PhoB  31.9 
 
 
230 aa  66.2  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.131558  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2645  response regulator receiver protein  32.79 
 
 
215 aa  66.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.492308  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2781  two component transcriptional regulator  31.75 
 
 
241 aa  66.6  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0599  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  30.36 
 
 
313 aa  66.2  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.464892  normal  0.548622 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2223  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.5 
 
 
725 aa  66.6  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.847933  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5700  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 
246 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.663569  normal  0.593468 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3674  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 
246 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.027909  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0008  sensory box histidine kinase/response regulator  31.9 
 
 
516 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  29.91 
 
 
228 aa  66.2  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6548  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.92 
 
 
397 aa  66.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.543575 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0252  response regulator receiver protein  28.21 
 
 
239 aa  65.9  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.114255 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3995  helix-turn-helix, Fis-type  32.74 
 
 
444 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0385153 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4696  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.63 
 
 
1917 aa  66.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257042  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.86 
 
 
226 aa  66.2  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000154116  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4122  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.4 
 
 
1853 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4049  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.03 
 
 
1406 aa  66.2  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6353  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1839 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5171  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1857 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472035  normal  0.0675906 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4253  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.4 
 
 
1843 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1954  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  26.83 
 
 
464 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.611403  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1031  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.48 
 
 
1131 aa  65.5  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.768055  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3079  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  28.32 
 
 
480 aa  66.2  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00177638  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4276  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.4 
 
 
1847 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1350  response regulator receiver protein  32.11 
 
 
147 aa  65.9  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00189482  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1869  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  26.83 
 
 
464 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0392  response regulator receiver  34.58 
 
 
351 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.196838  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2009  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  27.64 
 
 
463 aa  65.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1936  response regulator receiver protein  30.36 
 
 
221 aa  65.5  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.941096  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2157  response regulator receiver protein  26.72 
 
 
140 aa  65.1  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2551  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 
396 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14529e-19 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0191  two component transcriptional regulator  32.28 
 
 
244 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05730  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  35.29 
 
 
242 aa  64.7  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.587783  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1136  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.63 
 
 
1896 aa  64.7  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270239  normal  0.51439 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1930  two component transcriptional regulator  31.9 
 
 
233 aa  64.7  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.465475  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0626  histidine kinase  34.75 
 
 
1137 aa  64.7  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6313  putative two-component response regulator  32.43 
 
 
447 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.86051  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1405  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  29.91 
 
 
478 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000117702 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2805  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  29.91 
 
 
478 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.228775  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.75 
 
 
1137 aa  64.7  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0618  response regulator receiver protein  35.29 
 
 
157 aa  64.7  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  30.83 
 
 
228 aa  64.7  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>