More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5534 on replicon NC_009339
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009339  Mflv_5534  NLP/P60 protein  100 
 
 		 420 aa  837    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5540  NLP/P60 protein  59.85 
 
 		 473 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.981915  normal  0.121534 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5469  hypothetical protein  32.48 
 
 		 301 aa  108  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.746169  normal  0.546197 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2872  NLP/P60 protein  44.6 
 
 		 164 aa  105  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1447  NLP/P60  46.77 
 
 		 256 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.397182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1465  NLP/P60 protein  46.77 
 
 		 256 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.589531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4557  NLP/P60 protein  44.36 
 
 		 248 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  38.95 
 
 		 388 aa  99.4  9e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0902  NLP/P60 protein  41.73 
 
 		 256 aa  99  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  35.35 
 
 		 388 aa  98.2  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2843  NLP/P60 protein  42.45 
 
 		 256 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.676167 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5288  NLP/P60 protein  41.73 
 
 		 257 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.181073 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5720  NLP/P60 protein  41.73 
 
 		 257 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3652  NLP/P60 protein  41.73 
 
 		 257 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.387493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4472  NLP/P60 protein  42.11 
 
 		 225 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2050  NLP/P60 protein  40.15 
 
 		 696 aa  96.7  7e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.426387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  34.93 
 
 		 235 aa  96.3  9e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5324  NLP/P60 protein  42.74 
 
 		 256 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5687  NLP/P60 protein  42.74 
 
 		 256 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.444646 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3688  NLP/P60 protein  41.94 
 
 		 248 aa  93.2  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  39.26 
 
 		 232 aa  90.9  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10024  hypothetical protein  43.8 
 
 		 281 aa  90.5  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  46.3 
 
 		 349 aa  90.1  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  46.43 
 
 		 329 aa  89.4  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  41.28 
 
 		 348 aa  89  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  42.73 
 
 		 333 aa  88.6  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  39.64 
 
 		 257 aa  88.6  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  44.66 
 
 		 265 aa  87.8  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1561  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  44.44 
 
 		 337 aa  87.4  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11507  invasion protein  41.28 
 
 		 253 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.116745 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  47.71 
 
 		 308 aa  87  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  45.19 
 
 		 391 aa  87  6e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2839  NLP/P60 protein  41.41 
 
 		 469 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.239503 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2451  NLP/P60  40.68 
 
 		 475 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.629046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2496  NLP/P60 protein  40.68 
 
 		 475 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  48.15 
 
 		 337 aa  85.9  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2488  NLP/P60 protein  40.68 
 
 		 475 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11506  invasion protein  36.57 
 
 		 472 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0747167 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4564  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 467 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.057013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3663  NLP/P60 protein  40.16 
 
 		 479 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.24038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1562  NlpC/P60 family protein  49.47 
 
 		 553 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000246871  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4511  NLP/P60 protein  40.32 
 
 		 388 aa  84.7  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.307006  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2747  NLP/P60 protein  38.98 
 
 		 478 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.552726  normal  0.486637 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32150  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  48.96 
 
 		 475 aa  83.6  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191937  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  40.31 
 
 		 438 aa  83.6  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  45.45 
 
 		 340 aa  83.2  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1440  NLP/P60  42.61 
 
 		 467 aa  83.2  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1458  NLP/P60 protein  42.61 
 
 		 467 aa  83.2  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.614878  normal  0.41084 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4529  NLP/P60 protein  38.6 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.612016  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  42.11 
 
 		 452 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2333  NLP/P60 protein  39.23 
 
 		 432 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554645  normal  0.0124113 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3656  NLP/P60 protein  41.74 
 
 		 469 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  34.51 
 
 		 162 aa  82.4  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  40 
 
 		 317 aa  82  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0895  NLP/P60 protein  40.87 
 
 		 469 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8582  NLP/P60 protein  34.57 
 
 		 180 aa  81.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0901428  normal  0.349112 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  41.67 
 
 		 204 aa  81.3  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4520  NLP/P60 protein  39.02 
 
 		 472 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1353  NLP/P60 family protein, enterotoxin  34.18 
 
 		 549 aa  80.9  0.00000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.185421  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2110  NLP/P60 protein  40.91 
 
 		 491 aa  80.9  0.00000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0361918  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5573  hypothetical protein  41.61 
 
 		 329 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.820139  normal  0.955455 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  41.23 
 
 		 335 aa  80.5  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5292  NLP/P60 protein  40 
 
 		 469 aa  80.5  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.308075  normal  0.186714 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5716  NLP/P60 protein  40 
 
 		 469 aa  80.5  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  43.12 
 
 		 417 aa  80.1  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2403  NLP/P60 protein  37.98 
 
 		 505 aa  79.7  0.00000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  43.09 
 
 		 318 aa  79.7  0.00000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  42.11 
 
 		 347 aa  79.7  0.00000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5763  NLP/P60 protein  41.8 
 
 		 362 aa  79.7  0.00000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  44.21 
 
 		 246 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  43.12 
 
 		 459 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1072  NLP/P60 protein  38.84 
 
 		 393 aa  79.3  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.191144  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  42.34 
 
 		 370 aa  79  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6528  NLP/P60 protein  41.6 
 
 		 392 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.203343 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  40.65 
 
 		 1048 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0239  NlpC/P60 family protein  37.61 
 
 		 249 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3662  NLP/P60 protein  35.11 
 
 		 228 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.286781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0271  NlpC/P60 family protein  37.61 
 
 		 257 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.677165 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00222  predicted lipoprotein and C40 family peptidase  37.61 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  43.75 
 
 		 246 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3380  NLP/P60 protein  37.61 
 
 		 234 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  42.61 
 
 		 332 aa  78.2  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  45.71 
 
 		 432 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  41.07 
 
 		 374 aa  78.2  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00226  hypothetical protein  37.61 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0255  NlpC/P60 family protein  37.61 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2296  NLP/P60 protein  35.38 
 
 		 625 aa  77.8  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000910624  hitchhiker  0.00399846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  44.25 
 
 		 366 aa  77.4  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0261  NlpC/P60 family protein  37.61 
 
 		 269 aa  77.8  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3393  NLP/P60 protein  38.46 
 
 		 208 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  45.71 
 
 		 432 aa  77.4  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1008  cell wall-associated hydrolase  38.26 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000147737  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  41.28 
 
 		 340 aa  77  0.0000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0285  NLP/P60  41.46 
 
 		 368 aa  77  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  34.19 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  42.34 
 
 		 331 aa  76.6  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  36.29 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0613  NLP/P60 protein  41.75 
 
 		 502 aa  76.3  0.0000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.322284 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2085  NLP/P60 protein  39.67 
 
 		 447 aa  75.5  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  41.12 
 
 		 476 aa  75.5  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>