More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4352 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4352  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 335 aa  685    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1594  dihydrodipicolinate synthetase  30.56 
 
 		 317 aa  100  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.299034 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4403  dihydrodipicolinate synthetase  26.71 
 
 		 318 aa  90.1  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.210844  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1453  dihydrodipicolinate synthetase  30.53 
 
 		 317 aa  88.6  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.535565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1224  dihydrodipicolinate synthase  27.57 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  29.34 
 
 		 294 aa  79  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  29.34 
 
 		 294 aa  78.6  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0341  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  27.2 
 
 		 301 aa  74.7  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  30.91 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  28.87 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  31.29 
 
 		 292 aa  72.8  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  32.54 
 
 		 292 aa  72.8  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  24.15 
 
 		 289 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  33.71 
 
 		 290 aa  70.9  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  31.19 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2161  dihydrodipicolinate synthase  28.82 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0722  dihydrodipicolinate synthase  24.92 
 
 		 298 aa  69.7  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.862949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5604  dihydrodipicolinate synthase  25.3 
 
 		 298 aa  69.7  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1872  dihydrodipicolinate synthase  30 
 
 		 291 aa  69.3  0.00000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0072  dihydrodipicolinate synthase  28.57 
 
 		 304 aa  69.3  0.00000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  27.49 
 
 		 292 aa  69.3  0.00000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  24.51 
 
 		 295 aa  68.2  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5061  dihydrodipicolinate synthase  26.14 
 
 		 297 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  31.1 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  23.53 
 
 		 289 aa  67  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0868  dihydrodipicolinate synthase  31.25 
 
 		 319 aa  67  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0546543  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  30.06 
 
 		 296 aa  67  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3164  dihydrodipicolinate synthase  23.1 
 
 		 297 aa  67  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  23.22 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2262  dihydrodipicolinate synthase  28.5 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  28.28 
 
 		 313 aa  64.7  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2602  dihydrodipicolinate synthase  31.58 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0964  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  25.43 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  22.12 
 
 		 288 aa  63.5  0.000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  26.47 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3586  dihydrodipicolinate synthase  24.53 
 
 		 297 aa  63.2  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  26.47 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6292  dihydrodipicolinate synthase  26.47 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.454745 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  28.22 
 
 		 292 aa  62.8  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  31.13 
 
 		 290 aa  62.8  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  22.74 
 
 		 289 aa  62.4  0.000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1762  dihydrodipicolinate synthase  20.81 
 
 		 293 aa  62.4  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1865  dihydrodipicolinate synthase  23.42 
 
 		 293 aa  62.4  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  25.74 
 
 		 296 aa  62  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6951  dihydrodipicolinate synthase  27.06 
 
 		 298 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3482  dihydrodipicolinate synthase  22.46 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000010244  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  28.74 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  27.5 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  27.5 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  26.63 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  26.13 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  26.63 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  26.63 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08690  dihydrodipicolinate synthase  23.65 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0207042  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  29.14 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0965  dihydrodipicolinate synthase  23.67 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1427  dihydrodipicolinate synthase  27.65 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.544407 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1485  dihydrodipicolinate synthase  23.08 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1456  dihydrodipicolinate synthase  23.08 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  27.13 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0566  dihydrodipicolinate synthase  26.19 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3532  N-acetylneuraminate lyase  26.83 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3602  N-acetylneuraminate lyase  26.83 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  25.44 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3637  N-acetylneuraminate lyase  26.83 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.905763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3699  N-acetylneuraminate lyase  26.83 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3530  N-acetylneuraminate lyase  26.83 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.224809  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  28.57 
 
 		 292 aa  59.7  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  27.11 
 
 		 290 aa  59.7  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  28.72 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0257  dihydrodipicolinate synthase  21.45 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.457936  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  25.29 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4989  dihydrodipicolinate synthetase  30.68 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  30.43 
 
 		 297 aa  59.3  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  29.14 
 
 		 293 aa  59.3  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09012  dihydrodipicolinate synthetase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G02270)  30.92 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  24.85 
 
 		 300 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  24.85 
 
 		 300 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  24.85 
 
 		 300 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  26.85 
 
 		 292 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3972  dihydrodipicolinate synthetase  32.26 
 
 		 299 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  24.85 
 
 		 300 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  26.98 
 
 		 299 aa  58.9  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  25.44 
 
 		 301 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  24.85 
 
 		 300 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2640  dihydrodipicolinate synthase  30.08 
 
 		 296 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311988 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  24.85 
 
 		 300 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  31.18 
 
 		 295 aa  58.9  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  24.85 
 
 		 300 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  25.25 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4694  dihydrodipicolinate synthase  31.3 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111541 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3337  dihydrodipicolinate synthetase  33.04 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.426658  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  26.67 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2961  dihydrodipicolinate synthase  26.7 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1138  dihydrodipicolinate synthase  25.79 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.635374  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3219  dihydrodipicolinate synthase  33.99 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1370  dihydrodipicolinate synthase  26.92 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.702797  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  29.8 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1365  dihydrodipicolinate synthase  29.2 
 
 		 289 aa  57.8  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00312051  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1306  dihydrodipicolinate synthase  29.2 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>