More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3008 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3008  hydrolase  100 
 
 		 319 aa  651    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0906767 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4640  hypothetical protein  58.13 
 
 		 280 aa  182  6e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.376604  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1050  alpha/beta hydrolase fold  35.69 
 
 		 322 aa  124  2e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.173196  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0343  alpha/beta fold family hydrolase  24.09 
 
 		 372 aa  93.2  5e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25920  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.21 
 
 		 351 aa  87.8  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.84065  normal  0.959468 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2678  alpha/beta hydrolase fold protein  27.72 
 
 		 333 aa  80.9  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.906981 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  31.07 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3005  Alpha/beta hydrolase fold  36.46 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4126  alpha/beta hydrolase fold  42.45 
 
 		 393 aa  65.9  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000164833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  36.17 
 
 		 373 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1380  3-oxoadipate enol-lactonase  37.76 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.595814 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4343  3-oxoadipate enol-lactonase  37.76 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149189  normal  0.0581646 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0317  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  40.57 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4434  3-oxoadipate enol-lactonase  38.3 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.600688  normal  0.0168889 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2869  alpha/beta hydrolase fold protein  33.66 
 
 		 291 aa  62.4  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.415646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  30.98 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06270  putative hydrolase  38.78 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.674294  normal  0.191203 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3138  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  33.07 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00175613  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0490  alpha/beta hydrolase fold  36.25 
 
 		 283 aa  59.7  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  31.58 
 
 		 262 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1274  3-oxoadipate enol-lactonase  33.68 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7140  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 425 aa  58.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1020  3-oxoadipate enol-lactonase  37.23 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.062909 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1629  3-oxoadipate enol-lactonase  30.88 
 
 		 260 aa  57  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.603035 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  33.33 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3105  alpha/beta hydrolase fold  36.25 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38180  3-oxoadipate enol-lacton hydrolase  36.17 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4088  alpha/beta hydrolase fold protein  34.33 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.90454  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  35.24 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  31.13 
 
 		 265 aa  55.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1023  alpha/beta family hydrolase  33.33 
 
 		 287 aa  55.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  29.06 
 
 		 271 aa  55.5  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  35.51 
 
 		 392 aa  54.3  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  29.55 
 
 		 259 aa  55.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1204  putative phospholipase  33.93 
 
 		 638 aa  54.7  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3585  alpha/beta hydrolase fold  36.67 
 
 		 270 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2178  hydrolase, putative  36 
 
 		 233 aa  54.3  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1692  3-oxoadipate enol-lactonase  30.93 
 
 		 269 aa  53.9  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3040  3-oxoadipate enol-lactonase  30.3 
 
 		 253 aa  54.3  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0310  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 		 324 aa  53.5  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  0.178465 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  34.34 
 
 		 261 aa  53.9  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2473  alpha/beta hydrolase fold protein  33.65 
 
 		 324 aa  53.9  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0409911  normal  0.0604811 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2870  3-oxoadipate enol-lactonase  33.65 
 
 		 266 aa  53.5  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4026  alpha/beta hydrolase fold protein  37.37 
 
 		 298 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2090  putative hydrolase  35 
 
 		 233 aa  53.5  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3547  3-oxoadipate enol-lactonase  33.65 
 
 		 266 aa  52.8  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.307445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2714  alpha/beta hydrolase fold protein  28.42 
 
 		 284 aa  53.1  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216364  normal  0.0171077 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2532  hypothetical protein  40.43 
 
 		 299 aa  52.8  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.236123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1295  short chain dehydrogenase  34.86 
 
 		 602 aa  52.8  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.101432  normal  0.699766 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0068  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  36.56 
 
 		 297 aa  52.8  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  36.67 
 
 		 272 aa  52.8  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3943  3-oxoadipate enol-lactonase  39.56 
 
 		 265 aa  52.8  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0394549  normal  0.0878902 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3458  hydrolase protein  35.38 
 
 		 306 aa  52.4  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326966  hitchhiker  0.00447624 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  35.06 
 
 		 270 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05450  putative hydrolase signal peptide protein  29.73 
 
 		 412 aa  52  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.111492 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  32.32 
 
 		 269 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0733  alpha/beta hydrolase fold  34 
 
 		 280 aa  52.4  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  29.73 
 
 		 260 aa  52  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  37.66 
 
 		 267 aa  52  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 		 273 aa  52.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1714  alpha/beta hydrolase fold  31.48 
 
 		 265 aa  52  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  35.06 
 
 		 270 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3092  alpha/beta hydrolase fold protein  32.26 
 
 		 309 aa  52  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150861 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4769  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 282 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  33 
 
 		 260 aa  51.6  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0626  Alpha/beta hydrolase fold  36.14 
 
 		 308 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.434824 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6462  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 284 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.056485  normal  0.485183 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1701  alpha/beta hydrolase fold protein  31.53 
 
 		 303 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1726  alpha/beta hydrolase fold protein  31.53 
 
 		 303 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5068  alpha/beta hydrolase fold protein  35.16 
 
 		 297 aa  51.2  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0923  alpha/beta hydrolase fold protein  38.54 
 
 		 296 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8637  alpha/beta hydrolase fold protein  47.46 
 
 		 370 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0532982  normal  0.751963 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2195  alpha/beta hydrolase fold  28.4 
 
 		 288 aa  51.2  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5437  alpha/beta hydrolase fold  36.97 
 
 		 280 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204018  hitchhiker  0.00818802 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0950  alpha/beta hydrolase fold protein  38.54 
 
 		 296 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  35.06 
 
 		 270 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  31.09 
 
 		 287 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1359  short chain dehydrogenase  34.86 
 
 		 602 aa  51.2  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  39.39 
 
 		 289 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0379  alpha/beta hydrolase fold  39.18 
 
 		 327 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  35.58 
 
 		 275 aa  50.8  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  35.06 
 
 		 270 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  31.63 
 
 		 260 aa  50.4  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  31.03 
 
 		 303 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3567  3-oxoadipate enol-lactonase  29.13 
 
 		 264 aa  50.1  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0409722 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4419  alpha/beta hydrolase fold  38.75 
 
 		 309 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3948  alpha/beta hydrolase fold  38.75 
 
 		 309 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3580  alpha/beta hydrolase fold  38.75 
 
 		 309 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1067  alpha/beta hydrolase fold protein  26.67 
 
 		 239 aa  50.1  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 		 291 aa  50.1  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.2 
 
 		 602 aa  50.1  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4013  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 266 aa  50.1  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  32.38 
 
 		 263 aa  50.1  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4478  alpha/beta hydrolase fold  28.79 
 
 		 317 aa  49.7  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7174  alpha/beta hydrolase fold  31.93 
 
 		 284 aa  49.7  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  36.56 
 
 		 284 aa  49.7  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  31.18 
 
 		 286 aa  49.7  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0627  Alpha/beta hydrolase  33.66 
 
 		 289 aa  49.7  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  34.38 
 
 		 289 aa  49.7  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>