More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1055 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1823  hypothetical protein  78.27 
 
 
464 aa  743    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.440887  normal  0.352314 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0358  hypothetical protein  79.02 
 
 
464 aa  741    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.175668 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1055  hypothetical protein  100 
 
 
463 aa  945    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0336  hypothetical protein  84.06 
 
 
459 aa  766    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0347  hypothetical protein  84.06 
 
 
459 aa  765    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5776  hypothetical protein  91.27 
 
 
484 aa  827    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.246423 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0447  aminotransferase class-III  73.8 
 
 
461 aa  699    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0357  hypothetical protein  84.06 
 
 
459 aa  765    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.340156 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0272  aminotransferase class-III  65.49 
 
 
462 aa  619  1e-176  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4627  hypothetical protein  67.98 
 
 
435 aa  621  1e-176  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1438  aminotransferase class-III  62.67 
 
 
444 aa  555  1e-157  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.662958  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2960  aminotransferase class-III  58.7 
 
 
457 aa  539  9.999999999999999e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0599689  hitchhiker  0.00173955 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00920  aminotransferase  60.82 
 
 
463 aa  528  1e-149  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24140  aminotransferase  60.74 
 
 
453 aa  527  1e-148  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5722  hypothetical protein  59.23 
 
 
446 aa  523  1e-147  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0158  hypothetical protein  58.94 
 
 
438 aa  514  1e-144  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0841  aminotransferase class-III  58.97 
 
 
440 aa  513  1e-144  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0034  hypothetical protein  59.86 
 
 
441 aa  509  1e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1417  4-aminobutyrate aminotransferase  56.74 
 
 
441 aa  498  1e-140  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3118  hypothetical protein  56.84 
 
 
437 aa  501  1e-140  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2572  hypothetical protein  60.42 
 
 
437 aa  497  1e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1870  aminotransferase class-III  44.32 
 
 
444 aa  397  1e-109  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1120  aminotransferase class-III  43.71 
 
 
446 aa  389  1e-107  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.020832  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3443  aminotransferase class-III  40.28 
 
 
450 aa  352  5.9999999999999994e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000605746  normal  0.17806 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1430  hypothetical protein  43.12 
 
 
448 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360398  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6399  hypothetical protein  43.12 
 
 
448 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.755332  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3751  aminotransferase class-III  38.22 
 
 
448 aa  331  2e-89  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0532  aminotransferase class-III  35.09 
 
 
444 aa  285  9e-76  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410218  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4554  aminotransferase class-III  39.34 
 
 
428 aa  275  2.0000000000000002e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4062  aminotransferase class-III  37.62 
 
 
443 aa  261  2e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2523  aminotransferase class-III  37.8 
 
 
443 aa  259  6e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0404  aminotransferase class-III  35.14 
 
 
454 aa  245  9.999999999999999e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2925  aminotransferase class-III  32.43 
 
 
474 aa  242  1e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_41686  predicted protein  34.37 
 
 
430 aa  240  4e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1032  aminotransferase class-III  34.41 
 
 
450 aa  236  5.0000000000000005e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3821  hypothetical protein  36.47 
 
 
446 aa  233  6e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000353101 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  34.43 
 
 
428 aa  232  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4163  hypothetical protein  34.85 
 
 
446 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.45343  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  32.81 
 
 
463 aa  231  3e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0934  hypothetical protein  35.03 
 
 
446 aa  229  6e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1536  hypothetical protein  35.9 
 
 
449 aa  229  8e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4687  hypothetical protein  34.8 
 
 
446 aa  229  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1338  aminotransferase class-III  34.8 
 
 
479 aa  228  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000660385 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3587  hypothetical protein  35.03 
 
 
446 aa  229  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5503  hypothetical protein  35.03 
 
 
446 aa  229  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4780  hypothetical protein  35.03 
 
 
446 aa  229  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  37.05 
 
 
459 aa  229  1e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1364  hypothetical protein  35.9 
 
 
449 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2467  hypothetical protein  35.9 
 
 
449 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.549012  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1202  hypothetical protein  35.9 
 
 
449 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0347  hypothetical protein  35.9 
 
 
449 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31983  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0944  hypothetical protein  35.9 
 
 
449 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0142965  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0627  hypothetical protein  35.9 
 
 
449 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.804751  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1275  hypothetical protein  35.9 
 
 
449 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381328  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8945  aminotransferase  35.75 
 
 
412 aa  228  2e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2668  aminotransferase  34.66 
 
 
457 aa  226  6e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4978  hypothetical protein  36.39 
 
 
448 aa  226  7e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3182  hypothetical protein  36.39 
 
 
448 aa  226  7e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3136  hypothetical protein  32.89 
 
 
456 aa  225  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03450  4-aminobutyrate aminotransferase  34.92 
 
 
426 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  1.22305e-16 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0344  4-aminobutyrate aminotransferase  34.92 
 
 
426 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4297  hypothetical protein  36.14 
 
 
448 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90094  normal  0.321538 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8150  hypothetical protein  33.49 
 
 
448 aa  222  9e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.387109  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  32.33 
 
 
457 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  32.86 
 
 
449 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  33.8 
 
 
468 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  32.86 
 
 
454 aa  220  5e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  33.02 
 
 
454 aa  220  5e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  33.1 
 
 
454 aa  219  6e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0303  4-aminobutyrate aminotransferase  33.02 
 
 
454 aa  219  6e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  34.05 
 
 
448 aa  219  6e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0232  4-aminobutyrate aminotransferase  34.82 
 
 
440 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  33.49 
 
 
479 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1320  aminotransferase  32.39 
 
 
450 aa  219  1e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0408042  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1332  aminotransferase class-III  35.75 
 
 
460 aa  218  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.531603  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  32.63 
 
 
478 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0575  hypothetical protein  33.41 
 
 
454 aa  219  1e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088547  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  31.51 
 
 
455 aa  218  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2218  aminotransferase  32.52 
 
 
450 aa  219  1e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2288  aminotransferase class-III  35.66 
 
 
442 aa  218  1e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3172  aminotransferase  32.73 
 
 
449 aa  218  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.606908  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3219  aminotransferase class-III  36.79 
 
 
442 aa  218  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.338952 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6715  hypothetical protein  34.64 
 
 
454 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.284821 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  31.47 
 
 
441 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  32.86 
 
 
454 aa  217  4e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  32.86 
 
 
454 aa  217  4e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  32.39 
 
 
454 aa  216  5e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3177  hypothetical protein  34.81 
 
 
467 aa  216  5e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.060239  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  34.23 
 
 
451 aa  216  5.9999999999999996e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14780  4-aminobutyrate aminotransferase  32.71 
 
 
437 aa  216  7e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  32.3 
 
 
452 aa  215  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2600  aminotransferase class-III  36.76 
 
 
464 aa  215  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3534  hypothetical protein  34.58 
 
 
467 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.631271  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  32.35 
 
 
452 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  32.57 
 
 
456 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0315  4-aminobutyrate aminotransferase  35.38 
 
 
440 aa  216  9.999999999999999e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  32.57 
 
 
456 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2972  aminotransferase class-III  34.7 
 
 
460 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.121159 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2853  aminotransferase class-III  32.31 
 
 
455 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.382989  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2602  aminotransferase class-III  34.45 
 
 
459 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>