More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl362 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006055  Mfl362  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 202 aa  404  1.0000000000000001e-112  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  3.68833e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06295  short chain dehydrogenase  45.05 
 
 		 200 aa  178  5.999999999999999e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1238  short chain dehydrogenase  40.8 
 
 		 199 aa  175  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3138  short chain dehydrogenase  44.28 
 
 		 200 aa  175  3e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0313  short chain dehydrogenase  44.67 
 
 		 199 aa  174  7e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0297  short chain dehydrogenase  44.67 
 
 		 199 aa  174  7e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05280  short chain dehydrogenase  41.79 
 
 		 200 aa  174  9.999999999999999e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4312  short chain dehydrogenase  40.1 
 
 		 199 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50610  short chain dehydrogenase  39.11 
 
 		 223 aa  169  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0391945 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3200  short chain dehydrogenase  41.5 
 
 		 217 aa  167  8e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0657  short chain dehydrogenase  42.57 
 
 		 202 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.769936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5629  short chain dehydrogenase  43.07 
 
 		 198 aa  162  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.973642 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0927  short chain dehydrogenase  38.42 
 
 		 200 aa  160  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.115438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4883  short chain dehydrogenase  40.3 
 
 		 202 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3331  short chain dehydrogenase  42.13 
 
 		 201 aa  158  6e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4284  short chain dehydrogenase  39 
 
 		 201 aa  158  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.206363 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0613  short chain dehydrogenase  39 
 
 		 201 aa  156  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0886445 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5475  short chain dehydrogenase  40.3 
 
 		 202 aa  156  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5387  short chain dehydrogenase  40.3 
 
 		 202 aa  156  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.255767 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1664  short chain dehydrogenase  37.81 
 
 		 199 aa  155  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3526  short chain dehydrogenase  43.6 
 
 		 233 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0150103 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3670  short chain dehydrogenase  37.13 
 
 		 208 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3793  short chain dehydrogenase  37.13 
 
 		 207 aa  149  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4448  short chain dehydrogenase  37.5 
 
 		 201 aa  148  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3613  short chain dehydrogenase  39.39 
 
 		 199 aa  138  6e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0789  short chain dehydrogenase  36.14 
 
 		 205 aa  137  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4306  short chain dehydrogenase  34.33 
 
 		 197 aa  134  9e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2493  short chain dehydrogenase  38.41 
 
 		 200 aa  132  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2520  short chain dehydrogenase  39.63 
 
 		 199 aa  131  5e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0216463  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1726  short chain dehydrogenase  37.8 
 
 		 200 aa  131  6.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1873  short chain dehydrogenase  36.55 
 
 		 201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2619  short chain dehydrogenase  35.82 
 
 		 201 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2512  short chain dehydrogenase  32.34 
 
 		 199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.296656  normal  0.253878 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1736  short chain dehydrogenase  35.03 
 
 		 201 aa  121  7e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.544896  normal  0.157452 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6188  short chain dehydrogenase  37.36 
 
 		 198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1778  short chain dehydrogenase  36.55 
 
 		 202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2546  short chain dehydrogenase  28.8 
 
 		 238 aa  74.7  0.0000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2779  short chain dehydrogenase  28.8 
 
 		 238 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000967722 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.23 
 
 		 238 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.290784  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0802  short chain dehydrogenase  24.71 
 
 		 238 aa  72  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06495  oxidoreductase  28.03 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2087  short chain dehydrogenase  27.72 
 
 		 245 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.319948  normal  0.613238 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2913  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.63 
 
 		 234 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6322  putative short-chain dehydrogenase  28.96 
 
 		 252 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2533  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.98 
 
 		 243 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72840  putative short-chain dehydrogenase  28.96 
 
 		 252 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118155  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2324  short chain dehydrogenase  26.2 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.73 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0938  Short-chain alcohol dehydrogenase  25.58 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00746042  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1106  short chain dehydrogenase  23.26 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.256004  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1133  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.57 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5398  short chain dehydrogenase  25.32 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.448232  normal  0.960589 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0211  short chain dehydrogenase  23.26 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0327074  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0953  short chain dehydrogenase  23.26 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1548  short chain dehydrogenase  23.26 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4285  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  22.03 
 
 		 249 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.81 
 
 		 245 aa  58.5  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.46 
 
 		 259 aa  58.2  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.429144  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0847  short chain dehydrogenase/reductase family protein  25.58 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4560  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.98 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.84586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1392  short chain dehydrogenase  23.3 
 
 		 237 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0142  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.4 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0336  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.61 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1352  short chain dehydrogenase  23.81 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.297804  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.1 
 
 		 262 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.469065 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0107  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.85 
 
 		 258 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2639  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.59 
 
 		 238 aa  54.3  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.72 
 
 		 244 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000616439 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4387  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.71 
 
 		 247 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1661  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.97 
 
 		 249 aa  52.8  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.731962 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.43 
 
 		 248 aa  52.8  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1988  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.19 
 
 		 260 aa  52.4  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.730129 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.84 
 
 		 252 aa  52.8  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4477  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.37 
 
 		 257 aa  52.8  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.211006  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3634  short chain dehydrogenase  24.59 
 
 		 260 aa  52.4  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.71182 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  22.46 
 
 		 228 aa  52.8  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.126746  normal  0.0331408 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.81 
 
 		 259 aa  52  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000516058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  22.16 
 
 		 285 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00277313  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6298  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.94 
 
 		 271 aa  52.4  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.1246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5285  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.14 
 
 		 230 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6461  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  22.16 
 
 		 285 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5374  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.14 
 
 		 230 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1340  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.16 
 
 		 234 aa  51.6  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.16 
 
 		 234 aa  51.6  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.661641  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2237  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.66 
 
 		 252 aa  52  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.635702  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4605  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.06 
 
 		 255 aa  51.6  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350123  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6829  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  21.76 
 
 		 237 aa  51.6  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.138862 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  20.75 
 
 		 274 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6383  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.48 
 
 		 285 aa  51.6  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.11398  normal  0.546447 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.48 
 
 		 285 aa  51.6  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0246755  normal  0.0427159 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6053  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  21.59 
 
 		 285 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0516293 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0112  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.66 
 
 		 249 aa  50.8  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.16629  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2039  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.73 
 
 		 249 aa  51.2  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.566372 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3118  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.83 
 
 		 250 aa  50.8  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0651  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.68 
 
 		 252 aa  50.8  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.26 
 
 		 250 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1055  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  22.79 
 
 		 258 aa  51.2  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2437  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  24.16 
 
 		 251 aa  50.4  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.090617  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1379  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.4 
 
 		 249 aa  50.4  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4155  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.13 
 
 		 249 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.282325  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>