195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3009 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3198  magnesium chelatase subunit D  79.45 
 
 		 614 aa  791    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3009  magnesium chelatase subunit D  100 
 
 		 582 aa  1069    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.247156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1834  magnesium chelatase subunit D  63.29 
 
 		 566 aa  472  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0704313 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6448  magnesium chelatase subunit D  53.49 
 
 		 580 aa  458  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0486  magnesium chelatase subunit D  53.27 
 
 		 605 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1694  magnesium chelatase subunit D  50.85 
 
 		 590 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0775219  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4016  magnesium chelatase subunit D  52.32 
 
 		 586 aa  435  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3770  magnesium chelatase subunit D  52.73 
 
 		 588 aa  435  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.804805  normal  0.0156101 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1251  magnesium chelatase subunit D  49 
 
 		 599 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045417 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2067  magnesium chelatase subunit D  49.74 
 
 		 587 aa  354  2e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.683367 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0146  magnesium chelatase subunit D  48.38 
 
 		 563 aa  338  1.9999999999999998e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3503  magnesium chelatase subunit D  49.92 
 
 		 573 aa  325  1e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.457147  normal  0.553977 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1021  magnesium chelatase subunit D  46.43 
 
 		 546 aa  281  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0648816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0274  magnesium chelatase subunit D  47.11 
 
 		 564 aa  276  7e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1917  magnesium chelatase subunit D  46.94 
 
 		 558 aa  276  9e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.447341 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1620  magnesium chelatase ATPase subunit D  34.78 
 
 		 621 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1795  magnesium chelatase ATPase subunit D  34.9 
 
 		 618 aa  244  5e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1047  magnesium chelatase ATPase subunit D  33.82 
 
 		 618 aa  242  1e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3732  magnesium chelatase subunit D  65.74 
 
 		 581 aa  243  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217721  normal  0.103365 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1630  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  33.87 
 
 		 619 aa  238  2e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0786  magnesium chelatase ATPase subunit D  34.09 
 
 		 620 aa  236  7e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1437  magnesium chelatase ATPase subunit D  33.39 
 
 		 619 aa  233  6e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000286805  normal  0.499539 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2540  magnesium chelatase ATPase subunit D  37.02 
 
 		 608 aa  228  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1492  magnesium chelatase ATPase subunit D  34.52 
 
 		 618 aa  227  5.0000000000000005e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2823  magnesium chelatase ATPase subunit D  37.71 
 
 		 610 aa  226  1e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00357294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3122  magnesium chelatase ATPase subunit D  38.82 
 
 		 636 aa  216  9.999999999999999e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0209  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  33.82 
 
 		 701 aa  214  2.9999999999999995e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.910934 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0290  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  31.21 
 
 		 725 aa  203  6e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03681  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  34.55 
 
 		 717 aa  203  6e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1654  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  34.38 
 
 		 717 aa  203  7e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.835262  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03111  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  30.93 
 
 		 727 aa  202  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03121  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  31.27 
 
 		 711 aa  202  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03141  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  34.62 
 
 		 690 aa  202  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.421782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4044  magnesium chelatase ATPase subunit D  30.92 
 
 		 671 aa  200  6e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.653268 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0799  magnesium chelatase ATPase subunit D  34.55 
 
 		 664 aa  195  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25201  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  35.7 
 
 		 714 aa  194  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2274  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  33.33 
 
 		 677 aa  193  9e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0236  magnesium chelatase ATPase subunit D  33.28 
 
 		 703 aa  191  4e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03211  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  30.03 
 
 		 721 aa  188  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38488  predicted protein  31.89 
 
 		 683 aa  184  3e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4577  magnesium chelatase ATPase subunit D  33.91 
 
 		 668 aa  182  2e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0276  magnesium chelatase, ChlI subunit  28.85 
 
 		 619 aa  178  3e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0650073  normal  0.0615582 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1621  magnesium chelatase subunit D  48.26 
 
 		 625 aa  178  3e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.893519  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0291  magnesium chelatase, ChlI subunit  29.3 
 
 		 680 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0449  magnesium chelatase  30.17 
 
 		 669 aa  170  7e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0156382  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_776  predicted protein  32.29 
 
 		 654 aa  161  3e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.425078 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4967  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  43.21 
 
 		 672 aa  156  8e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1776  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  27.14 
 
 		 688 aa  156  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3084  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  42.62 
 
 		 678 aa  155  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03742  chelatase protein  33.04 
 
 		 637 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.84057 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50740  predicted protein  37.3 
 
 		 800 aa  145  1e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0750  magnesium chelatase subunit D/I family protein  22.65 
 
 		 643 aa  144  4e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2084  magnesium chelatase  30.37 
 
 		 617 aa  141  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.191813  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2889  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  31.23 
 
 		 653 aa  134  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0159  Magnesium chelatase  33.33 
 
 		 705 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6039  Magnesium chelatase  32.9 
 
 		 719 aa  127  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3857  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.54 
 
 		 665 aa  127  7e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.149974  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1910  Magnesium chelatase  42.31 
 
 		 660 aa  127  7e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5368  Sigma 54 interacting domain protein  26.18 
 
 		 614 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1309  cobaltochelatase subunit  35.06 
 
 		 657 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.441078  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17760  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  42.36 
 
 		 674 aa  121  3.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1421  von Willebrand factor type A  40.73 
 
 		 329 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.301249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1020  cobaltochelatase subunit  28.75 
 
 		 653 aa  118  3e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.816011  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0498  magnesium chelatase  29.31 
 
 		 612 aa  117  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.141561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2071  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  29.53 
 
 		 622 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498251  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2117  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  29.53 
 
 		 622 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0165109 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2054  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  29.53 
 
 		 622 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.457872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1209  magnesium chelatase  40.25 
 
 		 670 aa  108  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4050  magnesium chelatase  28.75 
 
 		 626 aa  107  7e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12865  magnesium chelatase  31.96 
 
 		 629 aa  107  9e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.498334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1277  Magnesium chelatase  33.43 
 
 		 650 aa  106  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.951784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1261  magnesium chelatase  37.99 
 
 		 689 aa  106  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3096  von Willebrand factor type A  36.96 
 
 		 265 aa  106  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0378393  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1192  Magnesium chelatase  38.89 
 
 		 696 aa  105  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000678359  hitchhiker  0.00162635 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1621  von Willebrand factor type A  30.21 
 
 		 699 aa  104  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921819  normal  0.480885 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1700  Sigma 54 interacting domain protein  30.84 
 
 		 618 aa  102  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808868  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2302  magnesium chelatase  28.7 
 
 		 638 aa  101  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0546  cobaltochelatase subunit  44.56 
 
 		 674 aa  99.8  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200541  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5885  chelatase protein  46.6 
 
 		 713 aa  99.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0403011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2709  magnesium chelatase  41.31 
 
 		 730 aa  96.3  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000369585 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0636  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  41.82 
 
 		 616 aa  96.7  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.122113  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2527  magnesium chelatase  47.26 
 
 		 738 aa  93.2  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0313  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  36.59 
 
 		 673 aa  91.7  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1860  Magnesium chelatase  39.3 
 
 		 719 aa  87  9e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.217661 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5861  Magnesium chelatase  43.2 
 
 		 680 aa  86.7  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4158  magnesium chelatase  45.81 
 
 		 776 aa  85.5  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0127951  normal  0.72272 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2299  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  45.81 
 
 		 788 aa  82.8  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.291711  normal  0.0239656 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1006  von Willebrand factor type A  36.84 
 
 		 749 aa  79  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3462  magnesium chelatase ChlI subunit  40.44 
 
 		 754 aa  77.8  0.0000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0817  Magnesium chelatase  40 
 
 		 607 aa  74.7  0.000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.19805  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0375  magnesium chelatase  39.49 
 
 		 637 aa  73.9  0.000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.165558  normal  0.638672 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0229  magnesium chelatase  39.49 
 
 		 637 aa  73.6  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2134  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.6 
 
 		 674 aa  72.4  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.118601  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2088  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  30.27 
 
 		 600 aa  71.6  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0124  von Willebrand factor type A  31.01 
 
 		 272 aa  71.2  0.00000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00784287  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3380  magnesium chelatase  23.8 
 
 		 594 aa  70.5  0.00000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.193165 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13850  Mg-chelatase subunit ChlD  30.77 
 
 		 257 aa  69.3  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3148  magnesium chelatase, subunit ChII, putative  30.67 
 
 		 342 aa  67.4  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.210132  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2026  von Willebrand factor type A  26.86 
 
 		 599 aa  67  0.0000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1433  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  24.58 
 
 		 337 aa  66.6  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>