139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1228 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1228  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 290 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.824423 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1389  glycosyl transferase family 2  98.94 
 
 		 283 aa  553  1e-156  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1165  glycosyl transferase family 2  88.5 
 
 		 287 aa  442  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.307947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3662  glycosyl transferase family protein  64.54 
 
 		 283 aa  330  1e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.707108  normal  0.123727 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0285  putative sugar transferase  49.13 
 
 		 294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0463119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0203  glycosyl transferase family protein  42.81 
 
 		 313 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.326499 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0146  glycosyl transferase family 2  42.11 
 
 		 313 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19750  predicted glycosyltransferase  45.52 
 
 		 664 aa  194  2e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0287  glycosyl transferase family 2  41.75 
 
 		 315 aa  188  8e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.201037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0201  putative sugar transferase  46.05 
 
 		 296 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.537288 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0144  putative sugar transferase  46.95 
 
 		 284 aa  178  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.454267 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0721  glycosyltransferase-like protein  42.28 
 
 		 275 aa  173  3.9999999999999995e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3363  glycosyl transferase family 2  42.71 
 
 		 288 aa  167  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00021305  normal  0.0157445 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3876  putative sugar transferase  50.72 
 
 		 283 aa  160  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4443  putative sugar transferase  39.29 
 
 		 301 aa  139  3.9999999999999997e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.296874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26670  hypothetical protein  39.07 
 
 		 300 aa  133  3e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.873023 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01232  glycosyl transferase, family 2  28.08 
 
 		 327 aa  94.7  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.474972  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2935  family 2 glycosyl transferase  27.92 
 
 		 272 aa  71.2  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.231634 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0340  glycosyl transferase family 2  31.48 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167181  normal  0.387021 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  29.62 
 
 		 525 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2051  glycosyl transferase family protein  26.87 
 
 		 280 aa  64.7  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0137  glycosyl transferase family protein  32 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.145337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  30.73 
 
 		 333 aa  63.2  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3362  glycosyl transferase family 2  30.43 
 
 		 425 aa  62  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000110111  normal  0.0175779 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2004  glycosyl transferase family 2  27.46 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4195  glycosyl transferase family 2  28.12 
 
 		 345 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.859941 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1842  glycosyl transferase family 2  30.64 
 
 		 884 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3553  glycosyl transferase family 2  31.35 
 
 		 619 aa  58.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0189873  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2399  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.378112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1813  glycosyl transferase family 2  27.19 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0379  glycosyl transferase family protein  31.87 
 
 		 891 aa  56.6  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4928  glycosyl transferase family 2  33.73 
 
 		 513 aa  55.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4447  glycosyl transferase family 2  34.21 
 
 		 419 aa  54.7  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2934  family 2 glycosyl transferase  30.86 
 
 		 295 aa  54.3  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.349608 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3975  polysaccharide pyruvyl transferase  25.69 
 
 		 1225 aa  54.3  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.584875 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  30.94 
 
 		 2401 aa  53.5  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  28.95 
 
 		 841 aa  52.8  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0884  b-glycosyltransferase  29.23 
 
 		 283 aa  52  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.030368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0466  glycosyl transferase family protein  29.11 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0600433  unclonable  0.0000113237 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2255  glycosyl transferase family 2  28.29 
 
 		 305 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0353  glycosyl transferase family 2  34.48 
 
 		 317 aa  51.6  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  30.18 
 
 		 477 aa  51.2  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4074  glycosyl transferase, group 1  32.68 
 
 		 773 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1274  glycosyl transferase family 2  26.82 
 
 		 303 aa  51.2  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  22.49 
 
 		 260 aa  51.6  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0754  glycosyl transferase family 2  30.9 
 
 		 691 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.235056 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0769  glycosyl transferase family 2  25.37 
 
 		 352 aa  50.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3194  glycosyl transferase family 2  28.16 
 
 		 455 aa  49.7  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4885  glycosyl transferase family 2  28.95 
 
 		 344 aa  49.3  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0343644 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0791  glycosyl transferase family 2  29.78 
 
 		 691 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal  0.0614605 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3808  glycosyl transferase family 2  28.95 
 
 		 344 aa  49.3  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.761497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3930  glycosyl transferase family 2  28.73 
 
 		 413 aa  48.9  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.555455  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19720  predicted glycosyltransferase  33 
 
 		 461 aa  48.9  0.00009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3678  glycosyl transferase family 2  28.5 
 
 		 289 aa  48.5  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0831  glycosyl transferase family protein  29.78 
 
 		 691 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.74925  normal  0.236177 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0518  family 2 glycosyl transferase  24.35 
 
 		 754 aa  48.5  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00714685  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4777  glycosyl transferase family 2  25.11 
 
 		 742 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26650  predicted glycosyltransferase  37.02 
 
 		 474 aa  48.9  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.755615 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0426  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  31.58 
 
 		 408 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0211  glycosyl transferase family protein  29.81 
 
 		 623 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1213  glycosyl transferase family protein  26.09 
 
 		 683 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0434  glycosyl transferase family 2  27.2 
 
 		 460 aa  47.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4524  glycosyl transferase family protein  28.72 
 
 		 308 aa  47.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal  0.110607 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11260  histidinol-phosphate phosphatase family protein  32.16 
 
 		 499 aa  47.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130521  normal  0.23358 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2849  glycosyl transferase family protein  23.79 
 
 		 824 aa  47  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  25.88 
 
 		 994 aa  46.6  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2635  glycosyl transferase family protein  27.76 
 
 		 346 aa  47  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.448186  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  27.76 
 
 		 1267 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  22.89 
 
 		 841 aa  47  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  27.52 
 
 		 355 aa  46.6  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4626  glycosyl transferase family 2  24.78 
 
 		 742 aa  47  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18553  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  28.66 
 
 		 836 aa  46.6  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4260  glycosyl transferase family protein  24.35 
 
 		 742 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109167  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4681  glycosyl transferase family protein  32.14 
 
 		 345 aa  46.2  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627848  normal  0.36467 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0339  glycosyl transferase family 2  27.37 
 
 		 304 aa  46.2  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.479436  normal  0.396217 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0478  glycosyl transferase family 2  38.33 
 
 		 335 aa  46.2  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677803  normal  0.931373 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2064  glycosyl transferase family protein  27.03 
 
 		 322 aa  46.2  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.346015  normal  0.195007 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2354  glycosyl transferase family protein  32.61 
 
 		 297 aa  45.8  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.358669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3110  glycosyl transferase family 2  30.13 
 
 		 325 aa  46.2  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  30.67 
 
 		 1077 aa  46.2  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3182  glycosyl transferase family 2  27.48 
 
 		 322 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3863  methyltransferase FkbM family  30.9 
 
 		 792 aa  45.8  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0912765  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2643  family 2 glycosyl transferase  32.34 
 
 		 321 aa  45.8  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1316  glycosyl transferase  24.02 
 
 		 358 aa  45.8  0.0009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.255761  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  24.86 
 
 		 703 aa  45.8  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5590  glycosyl transferase family 2  27.85 
 
 		 328 aa  45.8  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399759 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0479  glycosyl transferase family protein  31.85 
 
 		 341 aa  45.4  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3592  glycosyl transferase family 2  42.22 
 
 		 405 aa  45.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05340  Glycosyl transferase, family 2  28.29 
 
 		 321 aa  45.8  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000520172  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2471  glycosyl transferase family 2  23.7 
 
 		 311 aa  45.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2934  glycosyl transferase family 2  28.03 
 
 		 378 aa  45.4  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607022  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0725  family 2 glycosyl transferase  28.25 
 
 		 292 aa  45.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0538326 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3392  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 		 287 aa  44.3  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4179  Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase  27.05 
 
 		 847 aa  44.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  28.42 
 
 		 315 aa  45.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4105  glycosyl transferase family 2  32.54 
 
 		 317 aa  44.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.852576  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1959  glycosyl transferase family 2  29.94 
 
 		 321 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  25.82 
 
 		 1739 aa  44.3  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5500  glycosyl transferase family 2  35.2 
 
 		 308 aa  43.9  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  25.23 
 
 		 337 aa  44.3  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>