86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0604 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0604  thiamine biosynthesis protein ThiS  100 
 
 		 70 aa  137  7e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.050819  normal  0.048745 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0615  thiamine biosynthesis protein ThiS  95.71 
 
 		 70 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.920589  normal  0.197497 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0579  thiamine biosynthesis protein ThiS  91.43 
 
 		 70 aa  103  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.16999  hitchhiker  0.00610226 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0578  thiamine biosynthesis protein ThiS  62.86 
 
 		 70 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6770  thiamine biosynthesis protein ThiS  60 
 
 		 70 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7517  thiamine biosynthesis protein ThiS  58.57 
 
 		 70 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12799  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3117  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.29 
 
 		 68 aa  60.1  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.295456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6223  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.14 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2224  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.66 
 
 		 69 aa  55.1  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.14 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433282  normal  0.219669 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1339  thiamine biosynthesis protein ThiS  40 
 
 		 66 aa  55.1  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038066 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0963  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.06 
 
 		 68 aa  54.3  0.0000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0239  thiamine biosynthesis sulfur transfer protein  42.25 
 
 		 67 aa  52.4  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.164539 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0774  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.29 
 
 		 68 aa  52.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.176558 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2098  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.29 
 
 		 76 aa  50.8  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.219145  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3651  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.71 
 
 		 64 aa  50.4  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34640  sulfur carrier protein ThiS  41.18 
 
 		 64 aa  50.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0439272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0620  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.9 
 
 		 67 aa  50.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0207  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.85 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.549071  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2892  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.84 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.502448  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4278  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.85 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0658142  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5998  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.25 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.786244 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2465  ThiS, thiamine-biosynthesis  45.71 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.637315  normal  0.928732 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0913  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.43 
 
 		 64 aa  48.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1415  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.25 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2782  putative thiamine biosynthesis protein ThiS  37.14 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0877  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.43 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0304024  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3034  thiamine biosynthesis protein ThiS  40 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00295138  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0988  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.44 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0800067  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0216  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.44 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4172  sulfur carrier protein ThiS  42.86 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.455905 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5919  sulfur carrier protein ThiS  41.43 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168418  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3887  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.5 
 
 		 66 aa  47.4  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2396  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  41.67 
 
 		 327 aa  47.4  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2111  thiS protein  44.44 
 
 		 66 aa  46.2  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.719096 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0021  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.71 
 
 		 69 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.71048  normal  0.598538 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1984  sulfur carrier protein ThiS  36.62 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2062  sulfur carrier protein ThiS  36.62 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0913  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.29 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.133934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0093  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.73 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.704796  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1153  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.12 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0709  sulfur carrier protein ThiS  40 
 
 		 65 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.367637  normal  0.0347852 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2390  thiamine biosynthesis protein ThiS  50 
 
 		 65 aa  45.4  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.233708  normal  0.952804 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0444  sulfur carrier protein ThiS  40 
 
 		 65 aa  45.1  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2501  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.5 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000495099 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0643  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.86 
 
 		 73 aa  44.7  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.85301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6572  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.21 
 
 		 69 aa  44.7  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0363  thiamine biosynthesis protein ThiS  48.65 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0610  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.14 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00214937  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4093  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.03 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467775  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6397  sulfur carrier protein ThiS  41.43 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  40 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3235  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.43 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.320513  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0010  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.29 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.209764 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5331  sulfur carrier protein ThiS  32.86 
 
 		 71 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.883696  normal  0.241111 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1043  ThiS, thiamine-biosynthesis  43.59 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2458  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.86 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4978  sulfur carrier protein ThiS  35.71 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3504  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.03 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169395  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1604  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.5 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.36595  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3747  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.86 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1285  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.8 
 
 		 68 aa  41.6  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5105  sulfur carrier protein ThiS  35.71 
 
 		 92 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.205609  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0369  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.82 
 
 		 68 aa  42  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.232233 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0546  sulfur carrier protein ThiS  37.14 
 
 		 65 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.639054  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0360  sulfur carrier protein ThiS  34.29 
 
 		 66 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.18682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0558  sulfur carrier protein ThiS  37.14 
 
 		 65 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.577012 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2522  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.71 
 
 		 77 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19401  hypothetical protein  31.43 
 
 		 70 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.952724 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1957  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.71 
 
 		 63 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04970  sulfur carrier protein ThiS  37.14 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.43 
 
 		 65 aa  41.6  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.153528  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3289  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.85 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1857  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.99 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.24 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.408493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3429  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.71 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.72 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0479  sulfur carrier protein ThiS  37.14 
 
 		 66 aa  41.2  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738565  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5155  sulfur carrier protein ThiS  34.29 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404683  normal  0.862246 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3404  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.62 
 
 		 62 aa  40.8  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.376587  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2780  thiamine biosynthesis protein ThiS  52.78 
 
 		 78 aa  40.8  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0685562  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0536  sulfur carrier protein ThiS  35.71 
 
 		 65 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.355428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1317  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.08 
 
 		 66 aa  40.4  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3292  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.43 
 
 		 65 aa  40  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212717 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2567  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.84 
 
 		 66 aa  40  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.823918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2563  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.57 
 
 		 65 aa  40  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.183271  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>