More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4211 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008242  Meso_4211  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 174 aa  343  7e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4414  signal peptidase II  88.24 
 
 		 123 aa  211  3.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849735  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3203  lipoprotein signal peptidase  53.38 
 
 		 154 aa  140  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4439  signal peptidase II  44 
 
 		 165 aa  134  6.0000000000000005e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2967  lipoprotein signal peptidase  45.93 
 
 		 160 aa  121  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0888295  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0288  lipoprotein signal peptidase  41.55 
 
 		 184 aa  114  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.869766 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  40.74 
 
 		 154 aa  104  7e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0195  lipoprotein signal peptidase  45.27 
 
 		 163 aa  103  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1060  signal peptidase II  39.1 
 
 		 146 aa  100  7e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  39.29 
 
 		 172 aa  99.4  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4181  lipoprotein signal peptidase  41.72 
 
 		 165 aa  99.8  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.797741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1007  lipoprotein signal peptidase  38.04 
 
 		 167 aa  95.9  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4037  lipoprotein signal peptidase  40.52 
 
 		 165 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  37.58 
 
 		 169 aa  95.9  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1671  lipoprotein signal peptidase  40.15 
 
 		 165 aa  95.1  5e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0509  lipoprotein signal peptidase  40.15 
 
 		 163 aa  94.7  5e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3274  lipoprotein signal peptidase  36.09 
 
 		 171 aa  94.4  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00894133  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  34.81 
 
 		 182 aa  94.4  8e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  35.67 
 
 		 170 aa  93.2  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4860  lipoprotein signal peptidase  36.77 
 
 		 164 aa  94  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.777227  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  36.24 
 
 		 159 aa  93.6  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0215  lipoprotein signal peptidase  40.98 
 
 		 171 aa  93.6  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0133386  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  45.54 
 
 		 166 aa  94  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2334  lipoprotein signal peptidase  36.84 
 
 		 190 aa  93.6  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000924043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1409  lipoprotein signal peptidase  35.71 
 
 		 170 aa  92.8  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00981  lipoprotein signal peptidase  41.03 
 
 		 168 aa  93.2  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  45.95 
 
 		 166 aa  92.4  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  45.95 
 
 		 166 aa  92.4  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  45.95 
 
 		 166 aa  92.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  45.95 
 
 		 166 aa  92.4  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  45.95 
 
 		 166 aa  92.4  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  39.6 
 
 		 163 aa  92.4  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  45.95 
 
 		 166 aa  92.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  45.95 
 
 		 166 aa  92.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0632  lipoprotein signal peptidase  41.61 
 
 		 177 aa  92  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.263263  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  41.98 
 
 		 166 aa  91.7  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1404  lipoprotein signal peptidase  37.69 
 
 		 176 aa  90.9  8e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3783  lipoprotein signal peptidase  41.94 
 
 		 172 aa  90.5  9e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.800649  normal  0.222823 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3400  lipoprotein signal peptidase  40.46 
 
 		 165 aa  90.5  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1119  lipoprotein signal peptidase  33.93 
 
 		 173 aa  90.1  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004418  lipoprotein signal peptidase  36.03 
 
 		 169 aa  90.1  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  38.93 
 
 		 166 aa  89.4  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0581  lipoprotein signal peptidase  38.46 
 
 		 171 aa  89.4  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0620136  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2736  lipoprotein signal peptidase  40.46 
 
 		 165 aa  89.4  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.396586  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2281  lipoprotein signal peptidase  39.75 
 
 		 171 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0472  lipoprotein signal peptidase  35.22 
 
 		 170 aa  89  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0889  lipoprotein signal peptidase  35.22 
 
 		 170 aa  89.4  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2327  lipoprotein signal peptidase  35.22 
 
 		 170 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2219  lipoprotein signal peptidase  37.95 
 
 		 165 aa  89  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1105  lipoprotein signal peptidase  35.22 
 
 		 170 aa  89  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2904  lipoprotein signal peptidase  35.22 
 
 		 170 aa  89  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.353036  normal  0.916389 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1606  lipoprotein signal peptidase  35.22 
 
 		 170 aa  89  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2910  lipoprotein signal peptidase  35.22 
 
 		 170 aa  89  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0390  lipoprotein signal peptidase  35.22 
 
 		 170 aa  89  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0884  lipoprotein signal peptidase  35.22 
 
 		 170 aa  89  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.978547 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3163  lipoprotein signal peptidase  39.72 
 
 		 164 aa  88.6  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2356  lipoprotein signal peptidase  37.42 
 
 		 173 aa  88.6  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0383384 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  40.56 
 
 		 178 aa  88.6  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  39.6 
 
 		 166 aa  88.2  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3952  lipoprotein signal peptidase  40.91 
 
 		 157 aa  88.2  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.386002  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2326  lipoprotein signal peptidase  38.56 
 
 		 171 aa  88.2  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231394  normal  0.6435 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3614  lipoprotein signal peptidase  40.91 
 
 		 157 aa  88.2  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.463393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  36.81 
 
 		 162 aa  87.8  6e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  36.84 
 
 		 157 aa  87.8  6e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2603  lipoprotein signal peptidase  36.18 
 
 		 171 aa  88.2  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.172447 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2231  lipoprotein signal peptidase  35.66 
 
 		 189 aa  87.8  7e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  38.3 
 
 		 169 aa  87.8  7e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3451  lipoprotein signal peptidase  41.04 
 
 		 169 aa  87.4  8e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10093  normal  0.187541 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  39.16 
 
 		 163 aa  86.7  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0480  lipoprotein signal peptidase  39.04 
 
 		 159 aa  87  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  38.51 
 
 		 164 aa  86.3  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  38.26 
 
 		 166 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2543  lipoprotein signal peptidase  37.78 
 
 		 165 aa  86.7  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3687  lipoprotein signal peptidase  35.76 
 
 		 164 aa  85.9  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3587  lipoprotein signal peptidase  38.93 
 
 		 169 aa  86.3  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0789  lipoprotein signal peptidase  38.93 
 
 		 169 aa  86.3  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.56712 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0487  lipoprotein signal peptidase  34.52 
 
 		 178 aa  86.3  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  38.93 
 
 		 166 aa  86.7  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  40.52 
 
 		 160 aa  85.9  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  38.35 
 
 		 180 aa  85.5  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  34.51 
 
 		 161 aa  85.5  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4058  lipoprotein signal peptidase  39.24 
 
 		 169 aa  85.5  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113935  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0699  lipoprotein signal peptidase  33.12 
 
 		 169 aa  85.5  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.390058  normal  0.0603607 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2630  peptidase A8, signal peptidase II  37.72 
 
 		 166 aa  85.5  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0386  lipoprotein signal peptidase  38 
 
 		 178 aa  85.1  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000832352  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00031  signal peptidase II  32.87 
 
 		 164 aa  84.7  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00165346  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1143  lipoprotein signal peptidase  39.72 
 
 		 165 aa  84.7  5e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00030  hypothetical protein  32.87 
 
 		 164 aa  84.7  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0011292  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3459  lipoprotein signal peptidase  39.5 
 
 		 169 aa  84.7  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0475821  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  34.42 
 
 		 168 aa  85.1  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  38 
 
 		 158 aa  84.7  6e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3391  lipoprotein signal peptidase  42.15 
 
 		 166 aa  84.7  6e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.137503 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0392  lipoprotein signal peptidase  41.18 
 
 		 165 aa  84.7  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.034269  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  40.43 
 
 		 160 aa  84.7  6e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2304  signal peptidase II  42.15 
 
 		 166 aa  84.7  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000504038  hitchhiker  0.000155189 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3473  lipoprotein signal peptidase  36.88 
 
 		 170 aa  84.7  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.911066  normal  0.126226 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  37.58 
 
 		 166 aa  84.3  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0196  lipoprotein signal peptidase  36.84 
 
 		 170 aa  84.3  7e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  37.58 
 
 		 166 aa  84.3  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  37.58 
 
 		 166 aa  84.3  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>