More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1520 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  42.5 
 
 
896 aa  636    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1520  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 
848 aa  1667    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0358  DNA mismatch repair protein MutS  47.46 
 
 
918 aa  646    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.613152  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  41.04 
 
 
887 aa  647    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1537  DNA mismatch repair protein MutS  59.64 
 
 
880 aa  864    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  39.93 
 
 
873 aa  639    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0434  DNA mismatch repair protein MutS  71.43 
 
 
853 aa  1155    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0558205  normal  0.0590484 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  38.33 
 
 
867 aa  636    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0330  DNA mismatch repair protein MutS  42.79 
 
 
917 aa  632  1e-180  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0458  DNA mismatch repair protein MutS  43.86 
 
 
865 aa  630  1e-179  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.143165  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  39.91 
 
 
870 aa  629  1e-179  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2380  DNA mismatch repair protein MutS  43.15 
 
 
893 aa  626  1e-178  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  41.43 
 
 
868 aa  617  1e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  40.26 
 
 
932 aa  612  9.999999999999999e-175  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  44.36 
 
 
900 aa  614  9.999999999999999e-175  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3186  DNA mismatch repair protein MutS  44.21 
 
 
854 aa  610  1e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0251089 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0412  DNA mismatch repair protein MutS  42.22 
 
 
857 aa  609  1e-173  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  40.35 
 
 
853 aa  605  9.999999999999999e-173  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  43.03 
 
 
869 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  40.39 
 
 
860 aa  604  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  38.45 
 
 
863 aa  602  1.0000000000000001e-171  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  43.22 
 
 
891 aa  599  1e-170  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  40.73 
 
 
881 aa  600  1e-170  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  41 
 
 
870 aa  597  1e-169  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  45.25 
 
 
882 aa  595  1e-169  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  39.54 
 
 
869 aa  598  1e-169  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  41.32 
 
 
889 aa  595  1e-169  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  42 
 
 
850 aa  593  1e-168  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  44.18 
 
 
880 aa  593  1e-168  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  45.92 
 
 
863 aa  595  1e-168  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  41.08 
 
 
882 aa  593  1e-168  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2095  DNA mismatch repair protein MutS  43.68 
 
 
903 aa  595  1e-168  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  42.43 
 
 
857 aa  592  1e-168  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0863  DNA mismatch repair protein MutS  36.19 
 
 
873 aa  591  1e-167  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.462297  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1478  DNA mismatch repair protein MutS  39.95 
 
 
828 aa  583  1.0000000000000001e-165  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1355  DNA mismatch repair protein MutS  36.27 
 
 
872 aa  582  1.0000000000000001e-165  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.653089  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1925  DNA mismatch repair protein MutS  44.26 
 
 
865 aa  585  1.0000000000000001e-165  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1381  DNA mismatch repair protein MutS  36.27 
 
 
872 aa  582  1.0000000000000001e-165  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.640627  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  40.5 
 
 
872 aa  579  1e-164  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  37.55 
 
 
910 aa  579  1e-164  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  46.27 
 
 
898 aa  578  1.0000000000000001e-163  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2125  DNA mismatch repair protein MutS  39.86 
 
 
897 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565829  normal  0.043993 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38640  DNA mismatch repair protein MutS  44.64 
 
 
855 aa  578  1.0000000000000001e-163  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.477357  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2226  DNA mismatch repair protein MutS  42.77 
 
 
956 aa  577  1.0000000000000001e-163  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.137389  normal  0.561287 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1001  DNA mismatch repair protein MutS  40.1 
 
 
819 aa  578  1.0000000000000001e-163  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280502  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  37.38 
 
 
910 aa  577  1.0000000000000001e-163  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  40.72 
 
 
859 aa  578  1.0000000000000001e-163  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  40.59 
 
 
871 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  42.77 
 
 
863 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1207  DNA mismatch repair protein MutS  42.79 
 
 
862 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1519  DNA mismatch repair protein MutS  44.01 
 
 
855 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17500  DNA mismatch repair protein MutS  44.01 
 
 
855 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  40.91 
 
 
862 aa  571  1e-161  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  41.5 
 
 
861 aa  570  1e-161  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  41.26 
 
 
872 aa  572  1e-161  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  42.09 
 
 
887 aa  567  1e-160  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  42.98 
 
 
861 aa  566  1e-160  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  42.98 
 
 
861 aa  566  1e-160  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  39.49 
 
 
858 aa  568  1e-160  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3815  DNA mismatch repair protein MutS  42.48 
 
 
907 aa  562  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.548974 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  41.19 
 
 
870 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2247  DNA mismatch repair protein MutS  43.15 
 
 
882 aa  563  1.0000000000000001e-159  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0873729  normal  0.14084 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1045  DNA mismatch repair protein MutS  43.34 
 
 
854 aa  565  1.0000000000000001e-159  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.493253 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  38.72 
 
 
875 aa  564  1.0000000000000001e-159  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1299  DNA mismatch repair protein MutS  42.14 
 
 
859 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.537227  hitchhiker  0.00000000408163 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1195  DNA mismatch repair protein MutS  42.98 
 
 
861 aa  565  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1485  DNA mismatch repair protein MutS  44.88 
 
 
878 aa  564  1.0000000000000001e-159  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1576  DNA mismatch repair protein MutS  39.07 
 
 
854 aa  565  1.0000000000000001e-159  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  41.37 
 
 
855 aa  565  1.0000000000000001e-159  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  41.52 
 
 
859 aa  560  1e-158  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1246  DNA mismatch repair protein MutS  42.75 
 
 
856 aa  560  1e-158  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000830859 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0935  DNA mismatch repair protein MutS  41.93 
 
 
874 aa  561  1e-158  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  42.48 
 
 
856 aa  560  1e-158  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  39.91 
 
 
872 aa  561  1e-158  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  42.75 
 
 
856 aa  562  1e-158  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  42.87 
 
 
856 aa  560  1e-158  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3270  DNA mismatch repair protein MutS  42.63 
 
 
856 aa  560  1e-158  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.820026  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  39.88 
 
 
858 aa  558  1e-157  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1619  DNA mismatch repair protein MutS  44.66 
 
 
897 aa  558  1e-157  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.510747 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1519  DNA mismatch repair protein MutS  42.2 
 
 
854 aa  559  1e-157  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00861946  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0767  DNA mismatch repair protein MutS  38.41 
 
 
863 aa  556  1e-157  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1768  DNA mismatch repair protein MutS  39.88 
 
 
846 aa  556  1e-157  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0986  DNA mismatch repair protein MutS  40.8 
 
 
871 aa  557  1e-157  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0964  DNA mismatch repair protein MutS  41.59 
 
 
854 aa  556  1e-157  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854968  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0621  DNA mismatch repair protein MutS  42.15 
 
 
859 aa  558  1e-157  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.947929  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3645  DNA mismatch repair protein MutS  40.21 
 
 
901 aa  557  1e-157  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.473403 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03081  DNA mismatch repair protein(MutS)  40.68 
 
 
863 aa  556  1e-157  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0879  DNA mismatch repair protein MutS  40.55 
 
 
859 aa  552  1e-156  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0842  DNA mismatch repair protein MutS  38.5 
 
 
860 aa  553  1e-156  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.899937  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3337  DNA mismatch repair protein MutS  41.71 
 
 
854 aa  555  1e-156  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1769  DNA mismatch repair protein MutS  40.19 
 
 
846 aa  555  1e-156  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  36.61 
 
 
868 aa  554  1e-156  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3341  DNA mismatch repair protein MutS  42.03 
 
 
858 aa  553  1e-156  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.285192  unclonable  0.0000000411572 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4078  DNA mismatch repair protein MutS  38.88 
 
 
928 aa  554  1e-156  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980246  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1900  DNA mismatch repair protein MutS  38.44 
 
 
868 aa  555  1e-156  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.419193  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03515  DNA mismatch repair protein MutS  42.27 
 
 
853 aa  551  1e-155  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1431  DNA mismatch repair protein MutS  39.63 
 
 
892 aa  549  1e-155  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.964721 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1015  DNA mismatch repair protein MutS  39.4 
 
 
793 aa  549  1e-155  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1594  DNA mismatch repair protein MutS  41.15 
 
 
871 aa  552  1e-155  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0845017  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3868  DNA mismatch repair protein MutS  39.68 
 
 
890 aa  549  1e-155  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>