265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2490 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2490  iron dependent repressor  100 
 
 		 140 aa  280  6.000000000000001e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0973  iron dependent repressor  45.11 
 
 		 142 aa  119  9.999999999999999e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0171137 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2328  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.85 
 
 		 160 aa  107  6e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1664  DtxR family iron dependent repressor  38.02 
 
 		 163 aa  107  8.000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2011  manganese transport transcriptional regulator  40.74 
 
 		 143 aa  104  4e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1132  DtxR family iron dependent repressor  38.84 
 
 		 160 aa  102  1e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.179229 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0776  iron dependent repressor  38.52 
 
 		 163 aa  102  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0633  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.15 
 
 		 231 aa  100  6e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000139622  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1105  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  44.86 
 
 		 121 aa  97.4  6e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000518249  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1053  DtxR family iron dependent repressor  38.98 
 
 		 154 aa  95.9  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1457  hypothetical protein  34.62 
 
 		 160 aa  94  7e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.504372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1950  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.13 
 
 		 168 aa  93.2  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.641152 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1620  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.09 
 
 		 176 aa  91.7  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.303579  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2802  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.09 
 
 		 172 aa  90.9  5e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1535  iron-dependent transcriptional repressor  33.82 
 
 		 159 aa  90.5  6e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.35634  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0854  hypothetical protein  38.74 
 
 		 134 aa  90.1  9e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.513797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  39.02 
 
 		 221 aa  89.7  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2813  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.67 
 
 		 158 aa  89.4  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.957834 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.62 
 
 		 239 aa  89.7  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2411  iron dependent repressor  36.75 
 
 		 156 aa  89.4  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0227  manganese transport transcriptional regulator  35.82 
 
 		 141 aa  89  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3768  DtxR family iron dependent repressor  38.06 
 
 		 177 aa  88.6  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000422778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0974  iron dependent repressor  36.92 
 
 		 134 aa  88.2  4e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.431439  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2346  manganese transport transcriptional regulator  35 
 
 		 142 aa  87.8  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1655  iron dependent repressor  36.92 
 
 		 134 aa  87.4  5e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0258  DtxR family iron dependent repressor  36.92 
 
 		 134 aa  87.4  6e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1324  iron dependent repressor  38.84 
 
 		 138 aa  87  8e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00365508 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1313  iron dependent repressor  36.75 
 
 		 145 aa  85.9  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.244265  normal  0.0126962 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0973  iron dependent repressor  35 
 
 		 148 aa  85.5  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106771  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1304  manganese transport regulator MntR  40.87 
 
 		 157 aa  85.9  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.581866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3596  manganese transport regulator MntR  41.03 
 
 		 166 aa  84.7  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3888  manganese transport regulator MntR  41.03 
 
 		 166 aa  84.7  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1567  iron dependent repressor  36.22 
 
 		 148 aa  85.1  3e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4423  manganese transport regulator MntR  42.24 
 
 		 153 aa  83.6  8e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4057  manganese transport transcriptional regulator  34.48 
 
 		 142 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3611  DtxR family iron dependent repressor  44.76 
 
 		 152 aa  82.8  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.321459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2897  manganese transport transcriptional regulator  34.45 
 
 		 142 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000708107  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3949  DtxR family iron dependent repressor  44.76 
 
 		 152 aa  82.8  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.592113  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4333  manganese transport transcriptional regulator  34.48 
 
 		 142 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4277  manganese transport transcriptional regulator  34.48 
 
 		 142 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4108  manganese transport transcriptional regulator  34.48 
 
 		 142 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3946  manganese transport transcriptional regulator  34.48 
 
 		 142 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3957  manganese transport transcriptional regulator  34.48 
 
 		 142 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295063  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4428  manganese transport transcriptional regulator  34.48 
 
 		 142 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4224  manganese transport transcriptional regulator  34.48 
 
 		 142 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0920  manganese transport transcriptional regulator  34.45 
 
 		 142 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0525  DtxR family iron dependent repressor  36.28 
 
 		 140 aa  81.6  0.000000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00120371  normal  0.358538 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4314  manganese transport transcriptional regulator  33.61 
 
 		 142 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00784  DNA-binding transcriptional regulator of mntH  40 
 
 		 155 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2825  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40 
 
 		 155 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00801  hypothetical protein  40 
 
 		 155 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0874  manganese transport regulator MntR  40 
 
 		 155 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2531  manganese transport regulator MntR  40 
 
 		 155 aa  81.3  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0841  manganese transport regulator MntR  40 
 
 		 155 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.515904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2426  manganese transport regulator MntR  39.66 
 
 		 152 aa  81.3  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2826  manganese transport regulator MntR  40 
 
 		 155 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.876091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0966  manganese transport regulator MntR  40 
 
 		 155 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0782983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0887  manganese transport regulator MntR  40 
 
 		 155 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.185812  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1554  iron dependent repressor  37.5 
 
 		 217 aa  80.1  0.000000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.662319 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4272  manganese transport regulator MntR  40.17 
 
 		 171 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2291  manganese transport regulator MntR  39.66 
 
 		 156 aa  80.1  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466027 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0438  iron dependent repressor  42.98 
 
 		 138 aa  80.1  0.00000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1583  transcriptional regulator LysR family  39.84 
 
 		 163 aa  79.3  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.104279  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3986  FeoA family protein  37.1 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0329  manganese transport regulator MntR  37.61 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.930858  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0301  manganese transport regulator MntR  36.75 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0279959  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3626  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.87 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1915  manganese transport regulator MntR  38.39 
 
 		 156 aa  77  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00170642  decreased coverage  0.00000058092 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1346  histidine kinase  31.75 
 
 		 390 aa  77  0.00000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0129942  normal  0.400624 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00918  manganese transport regulator MntR  36.75 
 
 		 155 aa  76.6  0.00000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0409262  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0246  transcriptional regulator, MarR family  41.07 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.966628 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3607  DtxR family iron dependent repressor  33.06 
 
 		 225 aa  76.6  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1549  iron dependent repressor  34.07 
 
 		 160 aa  76.6  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.168929  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0867  manganese transport regulator MntR  38.39 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12960  Mn-dependent transcriptional regulator  31.4 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.236692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3322  DtxR family iron dependent repressor  34.96 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.116911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3941  DtxR family iron dependent repressor  39.13 
 
 		 163 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.02597 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1619  DtxR family iron dependent repressor  40.17 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123273 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0987  manganese transport regulator MntR  37.39 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0933  manganese transport regulator MntR  37.39 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0903  manganese transport regulator MntR  37.39 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0966  manganese transport regulator MntR  37.39 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0875  manganese transport regulator MntR  37.39 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0078  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.89 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.305356  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1760  transcriptional regulator, MarR family  32.74 
 
 		 123 aa  73.2  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0097  iron dependent repressor, putative  33.58 
 
 		 238 aa  72.4  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0071213  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0653  DtxR family iron dependent repressor  38.85 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00367016  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4678  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.71 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.289073 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0620  DtxR family iron dependent repressor  30.91 
 
 		 130 aa  72  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000404291  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2677  manganese transport regulator MntR  37.5 
 
 		 149 aa  72  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0464566  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0107  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.96 
 
 		 218 aa  72  0.000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000388915  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1353  manganese transport regulator MntR  38.53 
 
 		 170 aa  71.2  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.895463 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0302  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.57 
 
 		 225 aa  70.9  0.000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.298992  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0114  iron-dependent transcriptional regulator  34.68 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.272637  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1228  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.21 
 
 		 216 aa  70.5  0.000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.294242  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0797  iron dependent repressor  33.61 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0626  DtxR family iron (metal) dependent repressor  35.25 
 
 		 239 aa  69.7  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0317366  normal  0.280307 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2694  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.27 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0485756 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2026  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.98 
 
 		 232 aa  68.6  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3874  DtxR family iron dependent repressor  44.57 
 
 		 250 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000018192  normal  0.124247 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>