71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0455 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0455  TM helix repeat-containing protein  100 
 
 		 229 aa  441  1e-123  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1056  TM helix repeat-containing protein  44.39 
 
 		 229 aa  192  5e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0376279  normal  0.186599 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1704  TM helix repeat-containing protein  44.19 
 
 		 228 aa  187  9e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0334  TM helix repeat-containing protein  43.72 
 
 		 228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.172175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1614  TM helix repeat-containing protein  35.53 
 
 		 255 aa  116  3.9999999999999997e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.232731  normal  0.487938 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0909  TM helix repeat-containing protein  30.37 
 
 		 271 aa  104  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1441  conserved TM helix repeat-containing protein  27.91 
 
 		 243 aa  97.4  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0269  TM helix protein  32.6 
 
 		 306 aa  97.4  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2984  hypothetical protein  26.73 
 
 		 306 aa  91.3  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.20248  normal  0.0286538 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0423  TM helix protein  34.81 
 
 		 306 aa  89.7  4e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0220  hypothetical protein  27.05 
 
 		 241 aa  83.2  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1361  hypothetical protein  30.06 
 
 		 204 aa  74.7  0.000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.158875 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2078  TM helix protein  28.38 
 
 		 276 aa  73.6  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0558  TM helix repeat-containing protein  30.92 
 
 		 281 aa  71.2  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4747  TM helix repeat-containing protein  30.54 
 
 		 275 aa  68.9  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00173258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1684  TM helix repeat-containing protein  26.11 
 
 		 499 aa  67  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0737  TM helix repeat-containing protein  29.07 
 
 		 279 aa  66.2  0.0000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.36808  normal  0.444649 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16810  hypothetical protein  35.14 
 
 		 257 aa  65.1  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.403378 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1719  TM helix repeat-containing protein  30.28 
 
 		 335 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.082128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1787  TM helix repeat-containing protein  30.28 
 
 		 335 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1740  TM helix protein  30.28 
 
 		 335 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0500  TM helix protein  25.21 
 
 		 547 aa  62.4  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.587519  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0275  hypothetical protein  30.17 
 
 		 197 aa  62  0.000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2159  TM helix protein  26.32 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.760211  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1736  TM helix repeat-containing protein  26.9 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0517  hypothetical protein  31.03 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.328951  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1308  hypothetical protein  24.57 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1341  hypothetical protein  27.57 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.306672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2091  hypothetical protein  24.2 
 
 		 582 aa  58.9  0.00000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.395964  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3828  Conserved TM helix repeat-containing protein  35 
 
 		 265 aa  58.5  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.222399 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2407  TM helix protein  24.2 
 
 		 565 aa  58.5  0.00000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.533371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0752  TM helix repeat-containing protein  25.71 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1751  TM helix repeat-containing protein  29.91 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.232886 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1737  TM helix repeat-containing protein  29.91 
 
 		 287 aa  57  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.5984  decreased coverage  0.000938993 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1787  TM helix protein  29.32 
 
 		 494 aa  56.6  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5911  TM helix repeat-containing protein  24.81 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0596  hypothetical protein  25 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1329  TM helix repeat-containing protein  30.09 
 
 		 543 aa  55.5  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521958 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3307  hypothetical protein  28.48 
 
 		 487 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0141  TM helix repeat-containing protein  27.22 
 
 		 487 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2928  TM helix protein  27.22 
 
 		 487 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.606719  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0127  TM helix repeat-containing protein  27.22 
 
 		 487 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263684  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1346  hypothetical protein  24.74 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.161879 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0117  TM helix repeat-containing protein  28.57 
 
 		 487 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0127  TM helix repeat-containing protein  28.57 
 
 		 487 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1301  TM helix repeat-containing protein  28.32 
 
 		 543 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1406  TM helix protein  22.17 
 
 		 223 aa  53.1  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0345535  normal  0.402222 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2252  TM helix repeat-containing protein  25.68 
 
 		 525 aa  53.1  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0125  TM helix repeat-containing protein  25.48 
 
 		 487 aa  53.1  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0505  MscS Mechanosensitive ion channel  33.98 
 
 		 254 aa  51.2  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.271457  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1981  TM helix repeat-containing protein  21.49 
 
 		 246 aa  50.1  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0913829  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2465  hypothetical protein  25.73 
 
 		 255 aa  49.3  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3286  hypothetical protein  31.4 
 
 		 487 aa  48.9  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3041  hypothetical protein  30.58 
 
 		 487 aa  48.9  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2978  hypothetical protein  30.58 
 
 		 487 aa  48.9  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3329  hypothetical protein  30.58 
 
 		 503 aa  48.9  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1560  hypothetical protein  30.58 
 
 		 503 aa  48.9  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3213  TM helix protein  23.08 
 
 		 486 aa  48.5  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.529906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3944  hypothetical protein  30.58 
 
 		 503 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4016  hypothetical protein  30.58 
 
 		 503 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0005  Conserved TM helix repeat-containing protein  26.49 
 
 		 281 aa  48.1  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.152576  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0146  hypothetical protein  30.58 
 
 		 487 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.279624  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05319  hypothetical protein  25.36 
 
 		 487 aa  48.1  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.243091  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0961  hypothetical protein  23.08 
 
 		 274 aa  47  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5533  TM helix repeat-containing protein  24.03 
 
 		 272 aa  46.2  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.774759  normal  0.837846 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0638  hypothetical protein  30.23 
 
 		 278 aa  44.7  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1329  TM helix repeat-containing protein  23.53 
 
 		 297 aa  43.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00100917  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0300  hypothetical protein  24.44 
 
 		 260 aa  43.1  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0317825  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1259  CmpX protein  24.32 
 
 		 221 aa  42.7  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1708  TM helix protein  25.13 
 
 		 261 aa  42.4  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0232168  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23310  Mechanosensitive ion channel protein  26.92 
 
 		 274 aa  42  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>