60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5430 on replicon NC_011758
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011758  Mchl_5430  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  100 
 
 		 527 aa  1047    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4383  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  61.89 
 
 		 489 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1345  N-6 DNA methylase  34.25 
 
 		 554 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5445  methyltransferase small  35.67 
 
 		 552 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13292  DNA methylase  32.38 
 
 		 553 aa  192  1e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.909406  normal  0.973481 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0267  putative modification methyltransferase  22.93 
 
 		 524 aa  155  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4045  hypothetical protein  31.16 
 
 		 495 aa  134  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.539039  normal  0.599015 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2209  DNA methylase (modification methylase) (methyltransferase)  26.03 
 
 		 415 aa  124  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000172069  normal  0.0419277 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1609  hypothetical protein  22.97 
 
 		 521 aa  113  8.000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.160321  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3999  N-6 DNA methylase  20.28 
 
 		 523 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00695181 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1243  hypothetical protein  27.01 
 
 		 534 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4293  hypothetical protein  26.31 
 
 		 539 aa  98.6  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.223829 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0459  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  28.57 
 
 		 579 aa  92.4  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.307013 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0129  N-6 DNA methylase  18.7 
 
 		 533 aa  91.3  4e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0268034  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0554  modification methyltransferase  30.22 
 
 		 423 aa  83.2  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2480  N-6 DNA methylase  33.23 
 
 		 587 aa  76.6  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255725  normal  0.125112 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2778  N-6 DNA methylase  20 
 
 		 405 aa  68.9  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.63238e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1501  hypothetical protein  23.69 
 
 		 522 aa  68.2  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1514  methyltransferase small  29.33 
 
 		 466 aa  62  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0588  Eco57I restriction endonuclease  27.92 
 
 		 527 aa  61.6  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274467  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3449  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  28.35 
 
 		 389 aa  61.6  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0748  N-6 DNA methylase  22.52 
 
 		 504 aa  56.2  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000203871 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  19.51 
 
 		 694 aa  53.9  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2786  hypothetical protein  24.71 
 
 		 504 aa  53.5  0.000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2149  restriction endonuclease  29.15 
 
 		 629 aa  53.5  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0610  restriction modification system DNA specificity subunit  21.43 
 
 		 730 aa  52  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3354  type I restriction-modification system, M subunit  26.59 
 
 		 528 aa  50.4  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.501947  normal  0.0329699 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1713  adenine-specific DNA methyltransferase  26.15 
 
 		 478 aa  50.1  0.00009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0736948  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1860  type I restriction-modification system, M subunit  27.66 
 
 		 518 aa  49.7  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.876278  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1895  type I restriction-modification system, M subunit  27.66 
 
 		 518 aa  49.7  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.646372  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0279  hypothetical protein  37.04 
 
 		 285 aa  50.1  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.313315  normal  0.062823 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  21.36 
 
 		 1210 aa  48.9  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0454  type I restriction-modification system, M subunit  27.66 
 
 		 518 aa  49.3  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0466  type I restriction-modification system, M subunit  27.66 
 
 		 518 aa  49.3  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1037  HemK family modification methylase  34.04 
 
 		 287 aa  48.9  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.021133  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1843  type I restriction-modification system, M subunit  29.31 
 
 		 554 aa  47.4  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2532  hypothetical protein  27.82 
 
 		 497 aa  47  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.928699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6045  type I restriction-modification system subunit M  27.01 
 
 		 489 aa  47  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0475301  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0823  N-6 DNA methylase  26.15 
 
 		 768 aa  46.2  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0181192  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2617  N-6 DNA methylase  27.27 
 
 		 673 aa  46.2  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0309  hypothetical protein  23.24 
 
 		 691 aa  46.6  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2730  helicase domain protein  29.09 
 
 		 1722 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.52816  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2472  type I restriction-modification system, M subunit  25.64 
 
 		 518 aa  46.2  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0275864  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6184  helicase domain protein  36.67 
 
 		 284 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0111751 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  30.26 
 
 		 1036 aa  45.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2095  N-6 DNA methylase  24.19 
 
 		 481 aa  46.2  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02073  type I restriction enzyme EcoEI M protein  26.97 
 
 		 489 aa  45.1  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3698  hypothetical protein  34.33 
 
 		 449 aa  45.1  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1174  N-6 DNA methylase  21.26 
 
 		 493 aa  45.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0879909  normal  0.322631 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  25 
 
 		 505 aa  44.7  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0217  N-6 DNA methylase  21.95 
 
 		 578 aa  44.3  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4893  DEAD-like helicase  32.52 
 
 		 1417 aa  44.3  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9162  helicase SNF2 family  28.98 
 
 		 1697 aa  43.9  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2889  N-6 DNA methylase  21.95 
 
 		 578 aa  43.9  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2227  hypothetical protein  25.11 
 
 		 495 aa  43.9  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4612  N-6 DNA methylase  25.58 
 
 		 489 aa  43.9  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000590691 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1424  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  22.73 
 
 		 1194 aa  43.9  0.007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  25.93 
 
 		 504 aa  43.9  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1468  adenine-specific DNA methylase  31.25 
 
 		 254 aa  43.5  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00771536 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4476  helicase-like  30.72 
 
 		 1703 aa  43.5  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>