More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1023 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1023  Cache sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
723 aa  1478    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  53.48 
 
 
834 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 
763 aa  428  1e-118  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0842  multisensor signal transduction histidine kinase  41.08 
 
 
727 aa  415  1e-114  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0510  Cache sensor signal transduction histidine kinase  44.71 
 
 
633 aa  401  9.999999999999999e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0262  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.34 
 
 
523 aa  228  4e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0996  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  26.87 
 
 
823 aa  209  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2108  multisensor signal transduction histidine kinase  44.4 
 
 
492 aa  207  5e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1264  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.1 
 
 
561 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2201  multisensor signal transduction histidine kinase  36.48 
 
 
633 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3161  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.74 
 
 
437 aa  180  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.838045  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0352  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.93 
 
 
649 aa  167  8e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.127099 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3030  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.69 
 
 
832 aa  155  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00284544  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  26.84 
 
 
785 aa  145  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3295  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.63 
 
 
720 aa  142  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000403269  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0943  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.55 
 
 
793 aa  137  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.27721  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5329  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.21 
 
 
691 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.8679  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3504  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.14 
 
 
657 aa  125  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.193477  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3293  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.14 
 
 
720 aa  124  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.601  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0640  methyl-accepting chemotaxis protein  36.57 
 
 
744 aa  120  9e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0006  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  26 
 
 
667 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4113  methyl-accepting chemotaxis protein  24.82 
 
 
778 aa  116  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.433818  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4783  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.03 
 
 
730 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1205  chemotaxis sensory transducer  22.89 
 
 
713 aa  115  3e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0972  methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  23.6 
 
 
779 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000412028  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3926  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  26.9 
 
 
665 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0576  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.61 
 
 
688 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.84 
 
 
730 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0177086  normal  0.260794 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3537  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.23 
 
 
843 aa  111  5e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0497  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.12 
 
 
1181 aa  111  5e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2086  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.15 
 
 
657 aa  111  6e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2376  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  30.56 
 
 
1407 aa  110  7.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2372  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.48 
 
 
657 aa  110  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.63052  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6717  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.44 
 
 
741 aa  109  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447835  normal  0.587139 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.08 
 
 
716 aa  108  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0439  methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  23.15 
 
 
740 aa  108  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0301  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  24.56 
 
 
735 aa  107  7e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0007  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25 
 
 
636 aa  107  7e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3137  histidine kinase  31.06 
 
 
455 aa  107  9e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1255  sensory box histidine kinase PhoR  32.46 
 
 
565 aa  107  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6046  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.02 
 
 
768 aa  107  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.479069  normal  0.26296 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1730  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  29.96 
 
 
707 aa  106  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000446671  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4666  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 
514 aa  106  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.782496  normal  0.233494 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 
815 aa  105  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1960  sensor histidine kinase  31.28 
 
 
551 aa  105  3e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0440591  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2995  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.98 
 
 
1002 aa  105  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.175208  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1502  Histidine kinase  28.79 
 
 
919 aa  105  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6390  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.21 
 
 
770 aa  105  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.186908 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4117  hybrid sensory histidine kinase BarA  25.63 
 
 
948 aa  105  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.598015  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1898  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.24 
 
 
546 aa  105  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0314  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  27.89 
 
 
1399 aa  105  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2374  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 
709 aa  105  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5642  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.21 
 
 
768 aa  105  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.203801 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3827  methyl-accepting chemotaxis transducer  26.28 
 
 
695 aa  104  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000221184 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0354  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.52 
 
 
814 aa  104  5e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.261611 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6454  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.61 
 
 
768 aa  104  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1099  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.52 
 
 
699 aa  104  6e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1375  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.61 
 
 
768 aa  104  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.397027  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
585 aa  104  6e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 
582 aa  104  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1200  Signal transduction histidine kinase  26.15 
 
 
779 aa  103  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2025  two component sensor histidine kinase  28.18 
 
 
613 aa  102  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.199641  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2546  chemotaxis sensory transducer  27.72 
 
 
690 aa  102  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3161  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.61 
 
 
731 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.072786  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1591  hypothetical protein  27.2 
 
 
300 aa  102  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0191  response regulator receiver hybrid histidine kinase  29.88 
 
 
519 aa  102  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.835451  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7014  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.61 
 
 
781 aa  101  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0447  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.92 
 
 
662 aa  101  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4990  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.31 
 
 
955 aa  101  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  24.63 
 
 
713 aa  100  7e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1924  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.39 
 
 
901 aa  100  7e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0232  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.09 
 
 
1116 aa  100  8e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 
581 aa  100  8e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4197  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.81 
 
 
679 aa  100  9e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3772  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.64 
 
 
934 aa  100  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1284  histidine kinase  31.06 
 
 
560 aa  100  9e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0983353  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0051  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.09 
 
 
796 aa  100  9e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000874578 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0952  sensory box histidine kinase  29.15 
 
 
346 aa  100  9e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000116101  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1189  multi-sensor hybrid histidine kinase  20.5 
 
 
971 aa  100  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.13 
 
 
1068 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0640729  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1200  hybrid sensory histidine kinase BarA  27.56 
 
 
933 aa  100  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.930165  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1005  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  28 
 
 
646 aa  100  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.442988  decreased coverage  0.0000217029 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2018  ATP-binding region, ATPase-like  29.23 
 
 
771 aa  100  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88254  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5450  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.74 
 
 
799 aa  99.4  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00754974 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.37 
 
 
769 aa  99.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1372  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.59 
 
 
510 aa  99.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.94557  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1716  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.91 
 
 
628 aa  99.8  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805197  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  29.5 
 
 
1346 aa  99.4  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3782  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 
606 aa  99.8  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1750  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.53 
 
 
660 aa  99.8  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.66 
 
 
641 aa  99  3e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1264  histidine kinase  26.72 
 
 
421 aa  99  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.557954  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4807  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.01 
 
 
1287 aa  99  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00341781  normal  0.634217 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0498  histidine kinase  29.49 
 
 
391 aa  99  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2390  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.46 
 
 
618 aa  98.6  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.868312  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4943  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.5 
 
 
571 aa  98.6  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.769292  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0654  two-component sensor histidine kinase PhoR  30.13 
 
 
591 aa  98.6  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2093  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.67 
 
 
530 aa  98.2  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.874358  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3436  histidine kinase  27.63 
 
 
771 aa  98.6  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.416045  normal  0.0284383 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1852  histidine kinase  28.51 
 
 
1074 aa  98.2  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.496494  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>