More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0895 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_0895  hypothetical protein  100 
 
 		 400 aa  803    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00465052  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0759  hypothetical protein  32.59 
 
 		 401 aa  243  5e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00207585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2654  ABC transporter, permease protein  31.57 
 
 		 401 aa  224  2e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0708496 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2199  hypothetical protein  34.59 
 
 		 400 aa  216  5e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.748449  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1426  hypothetical protein  35.57 
 
 		 402 aa  209  7e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.407629  normal  0.0995371 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1654  hypothetical protein  29.4 
 
 		 399 aa  188  1e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.498405  normal  0.951827 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0985  hypothetical protein  32.1 
 
 		 402 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001465  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  24.29 
 
 		 411 aa  91.3  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3444  putative ABC transporter permease protein  23.25 
 
 		 389 aa  89.7  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0182994  normal  0.122472 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  23.59 
 
 		 389 aa  80.5  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4040  putative lipoprotein-releasing system transmembrane protein (lolC)  24.07 
 
 		 411 aa  74.7  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498435 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05402  hypothetical protein  22.09 
 
 		 411 aa  74.3  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6004  hypothetical protein  23.18 
 
 		 405 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2534  hypothetical protein  22.74 
 
 		 416 aa  72.8  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176241  normal  0.761271 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5639  hypothetical protein  22.91 
 
 		 387 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7413  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.14 
 
 		 405 aa  72  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.155043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3196  hypothetical protein  19.81 
 
 		 410 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2659  hypothetical protein  19.52 
 
 		 421 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1430  hypothetical protein  21.62 
 
 		 428 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1663  protein of unknown function DUF214  21.68 
 
 		 535 aa  70.1  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  24.46 
 
 		 404 aa  70.1  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5303  protein of unknown function DUF214  21.97 
 
 		 830 aa  70.1  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4227  hypothetical protein  23.31 
 
 		 408 aa  70.1  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.650749 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0918  hypothetical protein  22.32 
 
 		 389 aa  70.1  0.00000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2373  ABC-type transport system, permease component  21.88 
 
 		 407 aa  68.9  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000351897  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07028  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  23.23 
 
 		 422 aa  68.2  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1310  hypothetical protein  23.39 
 
 		 409 aa  67.4  0.0000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0434  hypothetical protein  19.62 
 
 		 425 aa  67.8  0.0000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2498  hypothetical protein  19.25 
 
 		 380 aa  67.4  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00553555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25450  hypothetical protein  23.15 
 
 		 433 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000978  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  22.45 
 
 		 422 aa  66.6  0.0000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2137  ABC transporter, permease protein  26.63 
 
 		 376 aa  64.7  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2247  hypothetical protein  26.63 
 
 		 393 aa  64.3  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2175  hypothetical protein  23.15 
 
 		 414 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3827  hypothetical protein  22.22 
 
 		 408 aa  63.9  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2978  hypothetical protein  21.92 
 
 		 419 aa  63.5  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.231225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2146  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.52 
 
 		 414 aa  62.8  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.299394  normal  0.273871 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0758  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  22.29 
 
 		 420 aa  61.6  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00020569  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2151  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  21.48 
 
 		 417 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0738534  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6148  hypothetical protein  21.3 
 
 		 405 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.315368 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1714  hypothetical protein  19.77 
 
 		 395 aa  61.2  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0633161 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3316  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.86 
 
 		 461 aa  61.2  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0101247  normal  0.130845 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6495  hypothetical protein  22.91 
 
 		 405 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.96926 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1470  hypothetical protein  22.04 
 
 		 404 aa  61.6  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.901126 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  20.14 
 
 		 397 aa  60.1  0.00000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6489  protein of unknown function DUF214  20.34 
 
 		 406 aa  60.5  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3748  hypothetical protein  23.85 
 
 		 416 aa  60.1  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.244082  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0881  hypothetical protein  24.22 
 
 		 416 aa  59.7  0.00000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01530  hypothetical protein  22.33 
 
 		 374 aa  60.1  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2132  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  21.13 
 
 		 417 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.435353  normal  0.150883 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1740  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.67 
 
 		 411 aa  59.3  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.170655 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1252  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  21.8 
 
 		 414 aa  58.9  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.368874  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0912  hypothetical protein  24.39 
 
 		 416 aa  59.3  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2749  hypothetical protein  20.23 
 
 		 409 aa  59.3  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0349567  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3882  hypothetical protein  21.76 
 
 		 408 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00664536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2542  hypothetical protein  21.7 
 
 		 441 aa  58.5  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.429279  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1839  protein of unknown function DUF214  23.51 
 
 		 416 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  0.633197 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2024  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  20.99 
 
 		 417 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.329575 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5963  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  21.13 
 
 		 417 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2114  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  21.13 
 
 		 417 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.08589  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1389  hypothetical protein  23.84 
 
 		 379 aa  57.8  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23230  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  22.33 
 
 		 419 aa  58.2  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000130781  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0917  hypothetical protein  21.8 
 
 		 364 aa  57  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  24.68 
 
 		 407 aa  57  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0081  hypothetical protein  24.44 
 
 		 420 aa  57  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.466459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003992  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC  23.67 
 
 		 374 aa  57  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5420  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  20.78 
 
 		 417 aa  57  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003048  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  27.48 
 
 		 400 aa  56.2  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  31.25 
 
 		 391 aa  55.8  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1846  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.95 
 
 		 427 aa  55.8  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.105079  normal  0.498084 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23240  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  20.38 
 
 		 415 aa  55.5  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1446  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  20.98 
 
 		 417 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.644445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  24.4 
 
 		 387 aa  55.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1787  protein of unknown function DUF214  24.08 
 
 		 379 aa  55.5  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1340  protein of unknown function DUF214  22.76 
 
 		 421 aa  55.5  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.710747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0204  hypothetical protein  24.05 
 
 		 388 aa  55.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.20132  unclonable  0.000000000008111 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1727  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  20.88 
 
 		 403 aa  55.1  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0228  hypothetical protein  23.66 
 
 		 388 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000368299 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1156  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  20.88 
 
 		 417 aa  54.3  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.342008  normal  0.0203303 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1566  ABC lipoprotein efflux pump, inner membrane subunit  21.38 
 
 		 417 aa  54.7  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.764315  normal  0.414868 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0220  hypothetical protein  24.05 
 
 		 388 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  21.57 
 
 		 387 aa  54.3  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1171  hypothetical protein  19.22 
 
 		 404 aa  53.9  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.267769  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2534  protein of unknown function DUF214  20.11 
 
 		 406 aa  54.3  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261611  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0481  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC  20.71 
 
 		 414 aa  53.9  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0641  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  20.71 
 
 		 414 aa  53.9  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.256103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  25.85 
 
 		 452 aa  53.9  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2216  hypothetical protein  23.2 
 
 		 388 aa  53.9  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3239  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  21.68 
 
 		 424 aa  53.9  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0892821  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2567  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  22.87 
 
 		 417 aa  53.9  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178921  normal  0.0571791 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1792  hypothetical protein  22.65 
 
 		 397 aa  53.9  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0323827  unclonable  0.00000000701935 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1332  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  19.52 
 
 		 411 aa  53.5  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.803281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1135  hypothetical protein  23.28 
 
 		 397 aa  53.5  0.000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1813  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  17.78 
 
 		 416 aa  53.5  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0198484  normal  0.092514 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2074  protein of unknown function DUF214  25.09 
 
 		 405 aa  53.5  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1545  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  19.95 
 
 		 407 aa  53.5  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0135691  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1794  hypothetical protein  21.89 
 
 		 388 aa  53.5  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0173513  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2805  hypothetical protein  24.05 
 
 		 388 aa  53.5  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.275109  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0301  hypothetical protein  24.05 
 
 		 388 aa  53.5  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157711  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1505  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.76 
 
 		 414 aa  53.1  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>